POLR2A

Subunidad RPB1 de la ARN polimerasa II
Estructuras disponibles
PDB

Buscar ortólogos: PDBe, RCSB

 Lista de códigos PDB
2GHQ , 2GHT , 2LTO , 3D9K , 3D9L , 3D9M , 3D9N , 3D9O , 3D9P
 Estructuras enzimáticas
RCSB PDB, PDBe, PDBsum
Identificadores
Símbolos POLR2A (HGNC: 9187) MGC75453; POLR2; POLRA; RPB1; RPBh1; RPO2; RPOL2; RpIILS; hRPB220; hsRPB1
Identificadores
externos
  • OMIM: 180660
  • HomoloGene: 721
  • ChEMBL: 1641353
  • EBI: POLR2A
  • GeneCards: Gen POLR2A
  • UniProt: POLR2A
 Bases de datos de enzimas
IntEnz: entrada en IntEnz
BRENDA: entrada en BRENDA
ExPASy: NiceZime view
KEGG: entrada en KEEG
PRIAM: perfil PRIAM
ExplorEnz: entrada en ExplorEnz
MetaCyc: vía metabólica
Número EC 2.7.7.7
Locus Cr. 17 p13.1
              
Ontología génica
Referencias: AmiGO / QuickGO
Patrón de expresión de ARNm
ancho=250px
ancho=250px
Más información
Ortólogos
Especies
Humano Ratón
Entrez
5430 20020
Ensembl
Véase HS Véase MM
UniProt
P24928 P08775
RefSeq
(ARNm)
NM_000937 NM_009089
RefSeq
(proteína) NCBI
NP_000928 NP_033115
Ubicación (UCSC)
Cr. 17:
7.39 – 7.42 Mb 		Cr. 11:
69.73 – 69.76 Mb
PubMed (Búsqueda)
[1]


[2]
  • v
  • t
  • e
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La subunidad RPB1 de la ARN polimerasa II (POLR2A) es una enzima codificada en humanos por el gen polr2A.

Esta proteína se corresponde con la subunidad de mayor tamaño de la ARN polimerasa II, la polimerasa responsable de sintetizar el ARNm en eucariotas. POLR2A contiene un dominio en el extremo C-terminal compuesto de repeticiones de un heptapéptido que es esencial en la actividad de la polimerasa. Estas repeticiones contienen residuos de serina y treonina que son fosforilados durante la transcripción de la polimerasa. Además, esta subunidad en combinación con otras subunidades de la polimerasa, conforman un dominio de unión a ADN de la polimerasa, una especie de surco en el cual entra la molécula de ADN para ser transcrita a ARN.[1]​

Interacciones

La proteína POLR2A ha demostrado ser capaz de interaccionar con:

  • Regulador 1 de la elongación de la transcripción[2]​
  • CREBBP[3]​
  • BRCA1[4]​[5]​[6]​[7]​
  • GTF2H4[5]​
  • Proteína de unión a TATA[5]​
  • PCAF[3]​
  • GTF2F1[5]​[3]​
  • SUPT5H[8]​[9]​
  • TFIIB[5]​
  • POLR2H[10]​
  • POLR2L[10]​
  • MED26[11]​
  • Cdk8[3]​
  • ZNF74[12]​
  • TCEA1[13]​[14]​[15]​
  • SMYD3[16]​
  • CTDP1[5]​
  • POLR2C[10]​
  • PQBP1[17]​
  • SMARCA2[18]​[19]​[3]​
  • SND1[20]​
  • MED21[5]​[3]​[21]​
  • SMARCB1[18]​[19]​[3]​
  • POLR2E[10]​
  • SMARCA4[18]​[19]​[22]​
  • TAF11[5]​

Referencias

  1. ↑ «Entrez Gene: POLR2A polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide A, 220kDa». 
  2. ↑ Carty, S M; Goldstrohm A C, Suñé C, Garcia-Blanco M A, Greenleaf A L (Aug. de 2000). «Protein-interaction modules that organize nuclear function: FF domains of CA150 bind the phosphoCTD of RNA polymerase II». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. (UNITED STATES) 97 (16): 9015-20. ISSN 0027-8424. PMID 10908677. doi:10.1073/pnas.160266597.  La referencia utiliza el parámetro obsoleto |coautores= (ayuda)
  3. ↑ a b c d e f g Cho, H; Orphanides G, Sun X, Yang X J, Ogryzko V, Lees E, Nakatani Y, Reinberg D (Sep. de 1998). «A human RNA polymerase II complex containing factors that modify chromatin structure». Mol. Cell. Biol. (UNITED STATES) 18 (9): 5355-63. ISSN 0270-7306. PMID 9710619.  La referencia utiliza el parámetro obsoleto |coautores= (ayuda)
  4. ↑ Krum, Susan A; Miranda Gustavo A, Lin Chenwei, Lane Timothy F (Dec. de 2003). «BRCA1 associates with processive RNA polymerase II». J. Biol. Chem. (United States) 278 (52): 52012-20. ISSN 0021-9258. PMID 14506230. doi:10.1074/jbc.M308418200.  La referencia utiliza el parámetro obsoleto |coautores= (ayuda)
  5. ↑ a b c d e f g h Scully, R; Anderson S F, Chao D M, Wei W, Ye L, Young R A, Livingston D M, Parvin J D (mayo de 1997). «BRCA1 is a component of the RNA polymerase II holoenzyme». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. (UNITED STATES) 94 (11): 5605-10. ISSN 0027-8424. PMID 9159119.  La referencia utiliza el parámetro obsoleto |coautores= (ayuda)
  6. ↑ Chiba, N; Parvin J D (Oct. de 2001). «Redistribution of BRCA1 among four different protein complexes following replication blockage». J. Biol. Chem. (United States) 276 (42): 38549-54. ISSN 0021-9258. PMID 11504724. doi:10.1074/jbc.M105227200. 
  7. ↑ Krum, Susan A; Womack James E, Lane Timothy F (Sep. de 2003). «Bovine BRCA1 shows classic responses to genotoxic stress but low in vitro transcriptional activation activity». Oncogene (England) 22 (38): 6032-44. ISSN 0950-9232. PMID 12955082. doi:10.1038/sj.onc.1206515.  La referencia utiliza el parámetro obsoleto |coautores= (ayuda)
  8. ↑ Kim, J B; Yamaguchi Y, Wada T, Handa H, Sharp P A (Sep. de 1999). «Tat-SF1 protein associates with RAP30 and human SPT5 proteins». Mol. Cell. Biol. (UNITED STATES) 19 (9): 5960-8. ISSN 0270-7306. PMID 10454543.  La referencia utiliza el parámetro obsoleto |coautores= (ayuda)
  9. ↑ Wada, T; Takagi T, Yamaguchi Y, Ferdous A, Imai T, Hirose S, Sugimoto S, Yano K, Hartzog G A, Winston F, Buratowski S, Handa H (Feb. de 1998). «DSIF, a novel transcription elongation factor that regulates RNA polymerase II processivity, is composed of human Spt4 and Spt5 homologs». Genes Dev. (UNITED STATES) 12 (3): 343-56. ISSN 0890-9369. PMID 9450929.  La referencia utiliza el parámetro obsoleto |coautores= (ayuda)
  10. ↑ a b c d Acker, J; de Graaff M, Cheynel I, Khazak V, Kedinger C, Vigneron M (Jul. de 1997). «Interactions between the human RNA polymerase II subunits». J. Biol. Chem. (UNITED STATES) 272 (27): 16815-21. ISSN 0021-9258. PMID 9201987.  La referencia utiliza el parámetro obsoleto |coautores= (ayuda)
  11. ↑ Sato, Shigeo; Tomomori-Sato Chieri, Parmely Tari J, Florens Laurence, Zybailov Boris, Swanson Selene K, Banks Charles A S, Jin Jingji, Cai Yong, Washburn Michael P, Conaway Joan Weliky, Conaway Ronald C (Jun. de 2004). «A set of consensus mammalian mediator subunits identified by multidimensional protein identification technology». Mol. Cell (United States) 14 (5): 685-91. ISSN 1097-2765. PMID 15175163. doi:10.1016/j.molcel.2004.05.006.  La referencia utiliza el parámetro obsoleto |coautores= (ayuda)
  12. ↑ Grondin, B; Côté F, Bazinet M, Vincent M, Aubry M (Oct. de 1997). «Direct interaction of the KRAB/Cys2-His2 zinc finger protein ZNF74 with a hyperphosphorylated form of the RNA polymerase II largest subunit». J. Biol. Chem. (UNITED STATES) 272 (44): 27877-85. ISSN 0021-9258. PMID 9346935.  La referencia utiliza el parámetro obsoleto |coautores= (ayuda)
  13. ↑ Kettenberger, Hubert; Armache Karim-Jean, Cramer Patrick (Aug. de 2003). «Architecture of the RNA polymerase II-TFIIS complex and implications for mRNA cleavage». Cell (United States) 114 (3): 347-57. ISSN 0092-8674. PMID 12914690.  La referencia utiliza el parámetro obsoleto |coautores= (ayuda)
  14. ↑ Archambault, J; Pan G, Dahmus G K, Cartier M, Marshall N, Zhang S, Dahmus M E, Greenblatt J (Oct. de 1998). «FCP1, the RAP74-interacting subunit of a human protein phosphatase that dephosphorylates the carboxyl-terminal domain of RNA polymerase IIO». J. Biol. Chem. (UNITED STATES) 273 (42): 27593-601. ISSN 0021-9258. PMID 9765293.  La referencia utiliza el parámetro obsoleto |coautores= (ayuda)
  15. ↑ Pan, G; Aso T; Greenblatt J (Sep. de 1997). «Interaction of elongation factors TFIIS and elongin A with a human RNA polymerase II holoenzyme capable of promoter-specific initiation and responsive to transcriptional activators». J. Biol. Chem. (UNITED STATES) 272 (39): 24563-71. ISSN 0021-9258. PMID 9305922. 
  16. ↑ Hamamoto, Ryuji; Furukawa Yoichi, Morita Masashi, Iimura Yuko, Silva Fabio Pittella, Li Meihua, Yagyu Ryuichiro, Nakamura Yusuke (Aug. de 2004). «SMYD3 encodes a histone methyltransferase involved in the proliferation of cancer cells». Nat. Cell Biol. (England) 6 (8): 731-40. ISSN 1465-7392. PMID 15303093. doi:10.1038/ncb1151.  La referencia utiliza el parámetro obsoleto |coautores= (ayuda)
  17. ↑ Okazawa, Hitoshi; Rich Tina, Chang Alex, Lin Xi, Waragai Masaaki, Kajikawa Masunori, Enokido Yasushi, Komuro Akihiko, Kato Seishi, Shibata Masao, Hatanaka Hiroshi, Mouradian M Maral, Sudol Marius, Kanazawa Ichiro (mayo de 2002). «Interaction between mutant ataxin-1 and PQBP-1 affects transcription and cell death». Neuron (United States) 34 (5): 701-13. ISSN 0896-6273. PMID 12062012.  La referencia utiliza el parámetro obsoleto |coautores= (ayuda)
  18. ↑ a b c Sif, S; Saurin A J, Imbalzano A N, Kingston R E (Mar. de 2001). «Purification and characterization of mSin3A-containing Brg1 and hBrm chromatin remodeling complexes». Genes Dev. (United States) 15 (5): 603-18. ISSN 0890-9369. PMID 11238380. doi:10.1101/gad.872801.  La referencia utiliza el parámetro obsoleto |coautores= (ayuda)
  19. ↑ a b c Wang, W; Côté J, Xue Y, Zhou S, Khavari P A, Biggar S R, Muchardt C, Kalpana G V, Goff S P, Yaniv M, Workman J L, Crabtree G R (Oct. de 1996). «Purification and biochemical heterogeneity of the mammalian SWI-SNF complex». EMBO J. (ENGLAND) 15 (19): 5370-82. ISSN 0261-4189. PMID 8895581.  La referencia utiliza el parámetro obsoleto |coautores= (ayuda)
  20. ↑ Yang, Jie; Aittomäki Saara, Pesu Marko, Carter Kara, Saarinen Jussi, Kalkkinen Nisse, Kieff Elliott, Silvennoinen Olli (Sep. de 2002). «Identification of p100 as a coactivator for STAT6 that bridges STAT6 with RNA polymerase II». EMBO J. (England) 21 (18): 4950-8. ISSN 0261-4189. PMID 12234934.  La referencia utiliza el parámetro obsoleto |coautores= (ayuda)
  21. ↑ Suñé, C; Hayashi T, Liu Y, Lane W S, Young R A, Garcia-Blanco M A (Oct. de 1997). «CA150, a nuclear protein associated with the RNA polymerase II holoenzyme, is involved in Tat-activated human immunodeficiency virus type 1 transcription». Mol. Cell. Biol. (UNITED STATES) 17 (10): 6029-39. ISSN 0270-7306. PMID 9315662.  La referencia utiliza el parámetro obsoleto |coautores= (ayuda)
  22. ↑ Zhao, K; Wang W, Rando O J, Xue Y, Swiderek K, Kuo A, Crabtree G R (Nov. de 1998). «Rapid and phosphoinositol-dependent binding of the SWI/SNF-like BAF complex to chromatin after T lymphocyte receptor signaling». Cell (UNITED STATES) 95 (5): 625-36. ISSN 0092-8674. PMID 9845365.  La referencia utiliza el parámetro obsoleto |coautores= (ayuda)
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