SETDB1

SET domain, bifurcated 1
Estructuras disponibles
PDB

Buscar ortólogos: PDBe, RCSB

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3DLM
 Estructuras enzimáticas
RCSB PDB, PDBe, PDBsum
Identificadores
Símbolos SETDB1 (HGNC: 10761) ESET, KG1T, KIAA0067
Identificadores
externos
  • OMIM: 604396
  • HomoloGene: 32157
  • EBI: SETDB1
  • GeneCards: Gen SETDB1
  • UniProt: SETDB1
 Bases de datos de enzimas
IntEnz: entrada en IntEnz
BRENDA: entrada en BRENDA
ExPASy: NiceZime view
KEGG: entrada en KEEG
PRIAM: perfil PRIAM
ExplorEnz: entrada en ExplorEnz
MetaCyc: vía metabólica
Número EC 2.1.1.43
Locus Cr. 1 q21.2
              
Ontología génica
Referencias: AmiGO / QuickGO
Patrón de expresión de ARNm
ancho=250px
ancho=250px
Más información
Ortólogos
Especies
Humano Ratón
Entrez
9869 84505
Ensembl
Véase HS Véase MM
UniProt
Q15047 D3YYC3
RefSeq
(ARNm)
NM_001145415 NM_001163641
RefSeq
(proteína) NCBI
NP_001138887 NP_001157113
Ubicación (UCSC)
Cr. 1:
150.9 – 150.94 Mb 		Cr. 3:
95.32 – 95.36 Mb
PubMed (Búsqueda)
[1]


[2]
  • v
  • t
  • e
[editar datos en Wikidata]

La histona-lisina N-metiltransferasa SETDB1 es una enzima codificada en humanos por el gen setdb1.[1]​[2]​

El dominio SET se encuentra altamente conservado y se conforma de una secuencia de aproximadamente 150 aminoácidos implicada en la modulación de la estructura de la cromatina. Fue originalmente identificada como parte de una extensa región conservada presente en la proteína Trithorax de Drosophila y fue posteriormente identificada en las proteínas Su(var)3-9 y Enhancer of zeste de Drosophila, de donde deriva el acrónimo SET. Estudios posteriores han sugerido que el dominio SET podría ser una "firma" de las proteínas que modulan transcripcionalmente los estados activos o reprimidos de la cromatina por medio del reordenamiento de esta.[2]​

Interacciones

La proteína SETDB1 ha demostrado ser capaz de interaccionar con:

Referencias

  1. ↑ Harte PJ, Wu W, Carrasquillo MM, Matera AG (Jun de 1999). «Assignment of a novel bifurcated SET domain gene, SETDB1, to human chromosome band 1q21 by in situ hybridization and radiation hybrids». Cytogenet Cell Genet 84 (1-2): 83-6. PMID 10343109. 
  2. ↑ a b «Entrez Gene: SETDB1 SET domain, bifurcated 1». 
  3. ↑ Schultz, David C; Ayyanathan Kasirajan, Negorev Dmitri, Maul Gerd G, Rauscher Frank J (Apr. de 2002). «SETDB1: a novel KAP-1-associated histone H3, lysine 9-specific methyltransferase that contributes to HP1-mediated silencing of euchromatic genes by KRAB zinc-finger proteins». Genes Dev. (United States) 16 (8): 919-32. ISSN 0890-9369. PMID 11959841. doi:10.1101/gad.973302.  La referencia utiliza el parámetro obsoleto |coautores= (ayuda)

Enlaces externos

  • MeSH: SETDB1+protein,+human (en inglés)
Control de autoridades
  • Proyectos Wikimedia
  • Wd Datos: Q18034745
  • Identificadores médicos
  • OMIM: 604396
  • UMLS: C1335812
  • Identificadores biológicos
  • HomoloGene: 32157
  • Wd Datos: Q18034745