NdhF

Le gène chloroplastique ndhF (sous-unité F de la NADH déshydrogénase) se rencontre chez tous les phylums de plantes vasculaires et est hautement conservé. Son fragment d'ADN chloroplastique réside dans la petite région à une seule copie du génome du chloroplaste. On suppose que sa fonction est de coder une protéine hydrophobe contenant 664 acides aminés. Sa masse est évaluée à 72,9 kDa[1].

Application

Le fragment d'ADN ndhF s'est révélé être un outil très utile pour la reconstruction phylogénétique à différents niveaux taxinomiques[2],[3],[4],[5].

Notes et références

  1. ↑ (en) Ray Neyland et Lowell E. Urbatsch, « The ndhF chloroplast gene detected in all vascular plant divisions », Planta, vol. 200, no 2,‎ , p. 273–277 P (DOI 10.1007/bf00208318, résumé).
  2. ↑ (en) Wenpan Dong, Jing Liu, Jing Yu, Ling Wang et Shiliang Zhou, « Highly Variable Chloroplast Markers for Evaluating Plant Phylogeny at Low Taxonomic Levels and for DNA Barcoding », PLoS ONE, vol. 7, no 4,‎ , e35071 (DOI 10.1371/journal.pone.0035071, Bibcode 2012PLoSO...735071D, lire en ligne).
  3. ↑ (en) T. B. Patterson et T. J. Givnish, « Phylogeny, concerted convergence, and phylogenetic niche conservatism in the core Liliales: insights from rbcL and ndhF sequence data », Evolution, vol. 56, no 2,‎ , p. 233–252 (DOI 10.1111/j.0014-3820.2002.tb01334.x, résumé).
  4. ↑ (en) T.J. Givnish, J.C. Pires, S.W. Graham, M.A. McPherson, L.M. Prince, T.B. Patterson et H.S. Rai, « Phylogeny of the monocotyledons based on the highly informative plastid gene ndhF: evidence for widespread concerted convergence », Aliso: A Journal of Systematic and Evolutionary Botany,‎ , p. 28–51 (lire en ligne).
  5. ↑ (en) T.J. Givnish, J.C. Pires, S.W. Graham, M.A. McPherson, L.M. Prince, T.B. Patterson et H.S. Rai, « Repeated evolution of net venation and fleshy fruits among monocots in shaded habitats confirms a priori predictions: evidence from an ndhF phylogeny », Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, vol. 272, no 1571,‎ , p. 1481–1490 (DOI 10.1098/rspb.2005.3067).

Voir aussi

v · m
Types
EC 1 Oxydoréductases :
  • EC 1.1
  • EC 1.2
  • EC 1.3
  • EC 1.4
  • EC 1.5
  • EC 1.6
  • EC 1.7
  • EC 1.8
  • EC 1.9
  • EC 1.10
  • EC 1.11
  • EC 1.12
  • EC 1.13
  • EC 1.14
  • EC 1.15
  • EC 1.16
  • EC 1.17
  • EC 1.18
  • EC 1.19
  • EC 1.20
  • EC 1.21
  • EC 1.97
  • EC 1.98
  • EC 1.99
EC 2 Transférases :
  • EC 2.1
  • EC 2.2
  • EC 2.3
  • EC 2.4
  • EC 2.5
  • EC 2.6
  • EC 2.7
  • EC 2.8
  • EC 2.9
EC 3 Hydrolases :
EC 4 Lyases :
  • EC 4.1
  • EC 4.2
  • EC 4.3
  • EC 4.4
  • EC 4.5
  • EC 4.6
  • EC 4.99
EC 5 Isomérases :
  • EC 5.1
  • EC 5.2
  • EC 5.3
  • EC 5.4
  • EC 5.5
  • EC 5.99
EC 6 Ligases :
  • EC 6.1
  • EC 6.2
  • EC 6.3
  • EC 6.4
  • EC 6.5
  • EC 6.6
EC 7 Translocases (en) :
  • EC 7.1
  • EC 7.2
  • EC 7.3
  • EC 7.4
  • EC 7.5
  • EC 7.6
Modulation
Cinétique
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