OpenBabel
![Description de l'image Open Babel computer icon.png.](http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/ce/Open_Babel_computer_icon.png/120px-Open_Babel_computer_icon.png)
Développé par | l'équipe de développement d'OpenBabel |
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Dernière version | 3.1.1 ()[1]![]() |
Dépôt | github.com/openbabel/openbabel![]() |
Écrit en | C++![]() |
Système d'exploitation | Microsoft Windows, Linux et macOS![]() |
Environnement | Multiplate-forme |
Formats lus | Chemical Markup Language, International Chemical Identifier, MDL Molfile (en), Protein Data Bank (en), FASTA, Alchemy Format (d), Gaussian Cube File (d), CDX Format (en), Crystallographic Information File, Format .xyz, Free Form Fractional format (d) et MCDL format (d)![]() |
Formats écrits | Simplified Molecular Input Line Entry Specification, Chemical Markup Language, International Chemical Identifier, InChIKey (d), MDL Molfile (en), Multilevel Neighborhoods of Atoms format (d), Free Form Fractional format (d), MCDL format (d) et CAChe MolStruct (d)![]() |
Langues | Multilingue |
Type | Bibliothèque logicielle Logiciel de chimie (d) ![]() |
Licence | Licence publique générale GNU version 2 ou ultérieure![]() |
Site web | openbabel.sourceforge.net |
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Le logiciel libre OpenBabel est un système expert principalement utilisé dans des applications de chemo-informatique pour la conversion de fichiers de structures chimiques. Ce logiciel est disponible pour Windows, Unix, et Mac OS. Il est distribué sous licence GNU GPL.
L'objectif du projet scientifique Open Babel est d'offrir aux utilisateurs et aux développeurs un ensemble de programmes et de bibliothèques logicielles multiplate-forme conçu pour la modélisation moléculaire, la chimie et de nombreux domaines connexes, tel que la conversion de format de fichiers et de données.
Historique
OpenBabel et JOELib sont dérivés de la bibliothèque logicielle OELib. OELib était basé sur des concepts issus du programme Babel et de la bibliothèque logicielle Obabel.
Principales fonctionnalités
- Système expert de chimie
- Interconvertion de nombreux formats de fichiers de données chimiques.
- Recherche de sous-structures (basée sur les descripteurs SMARTS)
- Calcul d'empreintes binaires
- Adaptateur Python
- Adaptateur Perl
Notes et références
- ↑ « Release 3.1.1 », (consulté le )
Annexes
Bibliographie
- The Blue Obelisk-Interoperability in Chemical Informatics, Rajarshi Guha, Michael T. Howard, Geoffrey R. Hutchison, Peter Murray-Rust, Henry Rzepa, Christoph Steinbeck, Jörg K. Wegner, and Egon L. Willighagen, J. Chem. Inf. Model.; 2006; DOI 10.1021/ci050400b
Articles connexes
- Ghemical, un programme de mécanique moléculaire basé sur OpenBabel
- JOELib, version Java d'OpenBabel/OELib
- XDrawChem, programme de dessin moléculaire 2D basé sur OpenBabel
Liens externes
- (en) Site d'OpenBabel
- (en) « Accueil du projet OpenBabel », sur SourceForge.net.
- (en) E-BABEL Version interactive d'OpenBabel hébergée au Virtual Computational Chemistry Laboratory
- (en) Geoff Hutchison, l'un des principaux développeurs du projet, a été interviewé sur le poadcast chemCast Episode 003
- (en) Défauts de conception du logiciel OELib
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