Légende | PK | Désignation |
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| | Ligne de Mâcon à Ambérieu | vers Mâcon-Ville |
| 33,570 | Passage sous la ligne de Chalon-sur-Saône à Bourg-en-Bresse | vers Chalon-sur-Saône |
| 36,033 | Sous-station 63 / 1,5 kV – CC des Cadalles |
| | Ligne de Mouchard à Bourg-en-Bresse | vers Mouchard |
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| | Bourg-en-Bresse (241 m) |
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| 37,506 | Passage sous la D 1083 |
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| | Limite d'électrification 1,5 kV vers Lyon-Saint-Clair |
| | Ligne de Lyon-Saint-Clair à Bourg-en-Bresse | vers Lyon-Part-Dieu |
| | Ligne de Mâcon à Ambérieu | vers Ambérieu-en-B. |
| 2,4xx | Passage sous la D 1075 |
| 3,545 | Pont sur la Reyssouze | (16 m) |
| 4,075 | Section de séparation 1,5 kV – CC / 25 kV – 50 Hz |
| 4,247 | PN no 7 sur la D 979 |
| 4,8xx | Passage sous la D 117A (rocade de Bourg-en-Bresse) |
| 7,040 | Pont sur l'A 40 | (73 m) |
| 9,864 | Ceyzériat (325 m) |
| 11,582 | PN no 18 sur la D 979 |
| 11,944 | Tunnel de Sénissiat | (187 m) |
| 12,842 | Sénissiat-Revonnas (396 m) |
| 14,127 | PN no 20 sur la D 979 |
| 15,149 | Viaduc de Ramasse | (135 m) |
| 17,823 | Pont sur le Suran | (23 m) |
| 18,901 | Villereversure (298 m) |
| 22,351 | Simandre-sur-Suran (315 m) |
| 22,918 | Tunnel de Racouse | (1 689 m) |
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| 24,768 | Viaduc de Cize-Bolozon (Ain) | (245 m) |
| 25,061 | Cize - Bolozon (318 m) |
| 25,982 | Sous-station 225 / 25 kV – 50 Hz de Cize |
| 27,846 | Tunnel de Bolozon 1 | (200 m) |
| 28,204 | Tunnel de Bolozon 2 | (818 m) |
| 29,914 | Tunnel de Mornay | (2 589 m) |
| | (passage sous la D 979) |
| 33,048 | Nurieux (ancienne gare ; 484 m) |
| 33,468 | Nurieux (484 m) |
| 34,217 | Pont sur l'Oignin | (31 m) |
| | Origine des déviation de tracé et du racc. de La Cluse |
| | Brion - Montréal-la-Cluse (479 m) |
| 35,77x | Passage sous l'A 404 |
| | Ligne d'Andelot-en-Montagne à La Cluse | vers Andelot |
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| 36,292 | Pont sur l'Ange | (20 m) |
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| | La Cluse (480 m) |
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| 37,148 | Pont sur le Bras du Lac | (20 m) |
| 37,305 | PN no 42 sur la D 1084 |
| 38,421 | Tunnel de la Mulatière ; lac de Nantua | (282 m) |
| 39,858 | Pont sur le Bras du Lac | (6 m) |
| 40,427 | Nantua (479 m) |
| 40,670 | Pont sur le Bras du Lac | (12 m) |
| 41,788 | Passage sous le viaduc de Nantua (A 40) |
| | Origine du tracé actuel (1932) |
| | Origine de la déviation provisoire de 1922 |
| | [1] tracé originel affecté par l'éboulement de 1922 |
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| 43,199 | Les Neyrolles (533 m) |
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| 45,702 | Tunnel de Sylans | (619 m) |
| 49,069 | Charix - Lalleyriat (587 m) |
| 50,0xx | Pont sur la D 1084 |
| 51,526 | Passage sous le viaduc de Frébuge (A 40) |
| 52,667 | Viaduc de La Voûte | (42 m) |
| 53,372 | PN no 60 sur la D 1084 |
| 53,748 | Saint-Germain-de-Joux (496 m) |
| 55,403 | Viaduc du Tacon | (115 m) |
| 55,579 | Tunnel de Trébillet | (87 m) |
| 57,187 | Tunnel de La Crotte (supprimé) | (137 m) |
| 57,378 | PN no 67 sur la D 1084 |
| 59,214 | Châtillon-en-Michaille (461 m) |
| 59,779 | Tunnel de Châtillon | (258 m) |
| | (Entre les PK 62,000 et 64,000, il y a 1 915 m) |
| 63,200 | Tunnel de Musinens (passage sous la D 1084) | (574 m) |
| | Bellegarde ( ) |
| | Bellegarde (374 m) |
| | Bif., sur la ligne de Lyon-Perrache à Genève (frontière) | vers |