VPS33B

VPS33B
Identifiants
AliasesVPS33B
IDs externesOMIM: 608552 MGI: 2446237 HomoloGene: 10261 GeneCards: VPS33B
Position du gène (Homme)
Chromosome 15 humain
Chr.Chromosome 15 humain[1]
Chromosome 15 humain
Localisation génomique pour VPS33B
Localisation génomique pour VPS33B
Locus15q26.1Début90,998,673 bp[1]
Fin91,022,603 bp[1]
Position du gène (Souris)
Chromosome 7 (souris)
Chr.Chromosome 7 (souris)[2]
Chromosome 7 (souris)
Localisation génomique pour VPS33B
Localisation génomique pour VPS33B
Locus7|7 D2Début79,919,397 bp[2]
Fin79,941,502 bp[2]
Expression génétique
Bgee
HumainSouris (orthologue)
Fortement exprimé dans
  • pancreatic ductal cell

  • Brodmann area 23

  • gyrus temporal moyen

  • liquide amniotique

  • cellule endothéliale

  • primary visual cortex

  • gingival epithelium

  • cerebellar hemisphere

  • right hemisphere of cerebellum

  • épithélium pigmentaire rétinien
Fortement exprimé dans
  • secondary oocyte

  • zygote

  • noyau supraoptique

  • tail of embryo

  • saccule

  • neural layer of retina

  • otic vesicle

  • primary oocyte

  • tubercule génital

  • granulocyte
Plus de données d'expression de référence
BioGPS


Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology
Fonction moléculaire
  • liaison protéique
Composant cellulaire
  • cytoplasme
  • HOPS complex
  • platelet alpha granule
  • recycling endosome
  • AP-3 adaptor complex
  • endosome
  • late endosome
  • early endosome membrane
  • membrane
  • late endosome membrane
  • clathrine
  • lysosomal membrane
  • early endosome
  • perinuclear region of cytoplasm
  • lysosome
  • vésicule cytoplasmique
  • clathrin-coated vesicle
Processus biologique
  • megakaryocyte development
  • endosome to lysosome transport
  • platelet alpha granule organization
  • fusion de membranes
  • melanosome localization
  • endosome organization
  • vesicle docking involved in exocytosis
  • autophagosome maturation
  • lysosome localization
  • transport
  • protein transport
  • vesicle-mediated transport
  • regulation of platelet aggregation
Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
EspècesHommeSouris
Entrez

26276

233405

Ensembl

ENSG00000184056

ENSMUSG00000030534

UniProt

Q9H267

P59016

RefSeq (mRNA)

NM_001289148
NM_001289149
NM_018668

NM_178070

RefSeq (protéine)

NP_001276077
NP_001276078
NP_061138

NP_835171

Localisation (UCSC)Chr 15: 91 – 91.02 MbChr 7: 79.92 – 79.94 Mb
Publication PubMed[3][4]
Wikidata
Voir/Editer HumainVoir/Editer Souris

Le VPS33B (pour « Vacuolar protein sorting-associated protein 33B » est une protéine intervenant dans la genèse des vacuoles. Son gène est le VPS33B situé sur le chromosome 15 humain.

Structure

Le VPS33 est constitué, chez l'être humain, de deux isoformes, le VPS33A (en) et le VPS33B. Cette famille est présente sous d'autres isoformes dans de nombreuses autres espèces, mammifères, insectes, levures[5]… Ces protéines sont membres de la famille des SEC1/MUNC18.

Rôles

Le VPS33B est nécessaire pour la formation des granules alpha des plaquettes sanguines[6]. Il se fixe sur la sous unité bêta des intégrines, modulant leur fonction et intervenant dans l'agrégabilité de ces dernières[7].

Avec la protéine VIPAR, le VPS33BB forme un complexe qui interagit avec le RAB11A, agissant au niveau des reins et du foie[8].

En médecine

Une mutation du gène VPS33B provoque un syndrome associant une arthrogrypose, une atteinte rénale et une cholestase hépatique[9].

Notes et références

  1. a b et c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000184056 - Ensembl, May 2017
  2. a b et c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000030534 - Ensembl, May 2017
  3. « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  4. « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  5. (en) Gissen P, Johnson CA, Gentle D et al. « Comparative evolutionary analysis of VPS33 homologues: genetic and functional insights » Hum Mol Genet, 2005;14:1261–1270
  6. (en) Lo B, Li L, Gissen P et al. « Requirement of VPS33B, a member of the Sec1/Munc18 protein family, in megakaryocyte and platelet alpha-granule biogenesis » Blood, 2005;106:4159–4166
  7. (en) Xiang B, Zhang G, Ye S et al. « Characterization of a novel integrin binding protein, VPS33B, which is important for platelet activation and in vivo thrombosis and hemostasis » Circulation, 2015;132:2334-2344
  8. (en) Cullinane AR, Straatman-Iwanowska A, Zaucker A et al. « Mutations in VIPAR cause an arthrogryposis, renal dysfunction and cholestasis syndrome phenotype with defects in epithelial polarization » Nat Genet, 2010;42:303–312
  9. (en) Gissen P, Johnson CA, Morgan NV et al. « Mutations in VPS33B, encoding a regulator of SNARE-dependent membrane fusion, cause arthrogryposis-renal dysfunction-cholestasis (ARC) syndrome » Nat Genet, 2004;36:400–404
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