ラクトバシラス目 |
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分類 |
ドメイン | : | 細菌 Bacteria | 門 | : | フィルミクテス門 Firmicutes | 綱 | : | バシラス綱 Bacilli | 目 | : | ラクトバシラス目 Lactobacillales | |
科 |
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ラクトバシラス目(Lactobacillales)とは、乳酸菌を主とした菌を含むフィルミクテス門の細菌の目の一つである。自然界で生成され、土や水、動植物にも存在する。ヨーグルトやチーズ、バター、バターミルクのような乳酸菌を含む醗酵食品にも広く使用されている。
乳酸菌としての分類の歴史
乳酸菌の分類体系は、1900年代にグラム陽性、乳酸発酵(ホモ発酵またはヘテロ発酵)によりラクトバシラス属、ペディオコッカス属、ストレプトコッカス属、ロイコノストック属の4属とされた。これに形状(桿菌及び球菌)、カタラーゼ陰性が条件に加えられた。1980年台には細胞壁ペプチドグリカン組成、菌体脂肪酸組成によりストレプトコッカス属からラクトコッカス属とエンテロコッカス属が独立し、ラクトバシラス属からカルノバクテリウム属が独立した。同時期にDNAのGC含量が利用されるようになり、乳酸菌はグラム陽性の低GC含量群に含められた。1990年代、16S rRNA系統解析が導入された結果、乳酸菌のほとんどがラクトバシラス目に含まれることとなった。Bergey's Manual of Systematic Bacteriology 第2版により、ラクトバシラス目は、アエロコックス科、カルノバクテリウム科、エンテロコッカス科、ラクトバシラス科、ロイコノストック科、レンサ球菌科(ストレプトコッカス科)の6科に分類された[1]。
系統樹
現在受け入れられている分類法は、List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclatureの原核生物名リストに基づいており[2] [3]、系統分類は、'The All-Species Living Tree' Projectの16S rRNA系統解析のLTPリリース106に基づいている[4]。
ラクトバシラス目 | | Aerosphaera taetra ♠ Hutson & Collins 2000 | | | Carnococcus allantoicus ♠ Tanner et al. 1995 | | | Aerococcaceae | | | | Granulicatella Collins and Lawson 2000 | | | | | Atopobacter phocae Lawson et al. 2000 | | | Bavariicoccus seileri Schmidt et al. 2009 | | | | | | Trichococcus Scheff et al. 1984 emend. Liu et al. 2002 | | | | | Lactobacillus algidus Kato et al. 2000 | | | | Lactobacillus species group 2 | | | | Lactobacillus Beijerinck 1901 emend. Cai et al. 2012 | | | | Leuconostocaceae | | | | Lactobacillus species group 3 | | | | Lactobacillus species group 4 | | | | Lactobacillus species group 5 | | | | Lactobacillus species group 6 | | | | Pediococcus Claussen 1903 | | | Lactobacillus species group 7 | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Carnobacterium Collins et al. 1987 | | | | Isobaculum melis Collins et al. 2002 | | | | Carnobacteriaceae 2 [incl. various Carnobacterium sp.] | | | | Desemzia incerta (Steinhaus 1941) Stackebrandt et al. 1999 | | Enterococcaceae & Streptococcaceae | (続く) | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
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Lactobacillales part 2 (続き)
Lactobacillales part 2 | | Vagococcus fessus Hoyles et al. 2000 | | | | Vagococcus Collins et al. 1990 | | | | Catellicoccus marimammalium Lawson et al. 2006 | | | | Enterococcus (ex Thiercelin and Jouhaud 1903) Schleifer and Kilpper-Bälz 1984 | | | | Enterococcus phoeniculicola Law-Brown and Meyers 2003 | | | | Enterococcus species group 2 [incl. Melissococcus plutonius & Tetragenococcus] | | | | Enterococcus species group 3 | | | | Enterococcus species group 4 | | | | Enterococcus raffinosus Collins et al. 1989 | | | Enterococcus avium (ex Nowlan and Deibel 1967) Collins et al. 1984 | | | | Enterococcus pallens Tyrrell et al. 2002 | | | | Enterococcus hermanniensis Koort et al. 2004 | | | | Pilibacter termitis Higashiguchi et al. 2006 | | | Streptococcaceae | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
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脚注
- ^ 石川森夫「近年の乳酸菌の分類体系とCarnobacteriaceae 科およびAerococcaceae 科の分類学的特徴」『日本乳酸菌学会誌』第23巻第1号、日本乳酸菌学会、2012年、14-23頁、CRID 1390001204470567552、doi:10.4109/jslab.23.14、ISSN 1343-327X。
- ^ See the w:List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature. Data extracted from J.P. Euzéby. “Bacilli”. 2013年1月27日時点のオリジナルよりアーカイブ。2012年5月17日閲覧。
- ^ See the NCBI webpage on Bacilli Data extracted from Sayers. “NCBI Taxonomy Browser”. w:National Center for Biotechnology Information. 2012年5月17日閲覧。
- ^ See the w:'The All-Species Living Tree' Project [1]. Data extracted from the “16S rRNA-based LTP release 106 (full tree)”. w:Silva Comprehensive Ribosomal RNA Database. 2012年5月17日閲覧。
典拠管理データベース: 国立図書館 | |
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