Open Babel

Open Babel
A computer graphics image. On the left is a ball and stick molecule model. In the middle is an orange fish, tail down, face up. On the right is a space-filling molecule model.
開発元 Open Babel development team
初版 2005年6月2日 (19年前) (2005-06-02)
最新版
3.1.1 / 2021年5月9日 (3年前) (2021-05-09)
リポジトリ github.com/openbabel/openbabel
プログラミング
言語
C++ (wxWidgets[1])
対応OS Windows, macOS, Linux, Android
プラットフォーム IA-32, x86-64
対応言語 英語
サポート状況 Active
種別 ケモインフォマティクス分子モデリング
ライセンス GPL 2.0
公式サイト openbabel.org
テンプレートを表示

Open Babelフリーソフトウェアであり、主に化学構造ファイルフォーマット(英語版)を変換するために用いられる化学ツールである[2]情報学との関連が強いため、このプログラムは分子モデリング(英語版)というよりはケモインフォマティクスに属するものといえる。WindowsUNIXLinuxmacOS、Androidで利用可能で、GNU GPL 2.0ライセンスのもとで配布されている。

このプロジェクトでは、「Open Babelが、クロスプラットフォームなプログラムとして、ユーザーと開発者をともに支援するコミュニティ指向の科学的プロジェクトとなり、ファイル形式とデータの内部変換を含む分子構造モデリング(英語版)、化学、その他の多くの関連分野を支援するように設計されたライブラリとなる」ことを目標と掲げている。

歴史

Open BabelとJOELib(英語版)OELib(英語版) ケモインフォマティクスライブラリから派生した。同様にOELib(英語版)は、元の化学プログラム Babel と"OBabel"と呼ばれる非公開のオブジェクト指向ライブラリにあったアイディアを基本にしていた。

主な機能

脚注

  1. ^ “Debian -- Details of package openbabel-gui in jessie”. 2017年3月10日閲覧。
  2. ^ O'Boyle, N. M.; Banck, M.; James, C. A.; Morley, C.; Vandermeersch, T.; Hutchison, G. R. (2011). “Open Babel: An open chemical toolbox”. Journal of Cheminformatics 3: 33. doi:10.1186/1758-2946-3-33. PMC 3198950. PMID 21982300. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3198950/. 

参考文献

  • The Blue Obelisk-Interoperability in Chemical Informatics, Rajarshi Guha, Michael T. Howard, Geoffrey R. Hutchison, Peter Murray-Rust, Henry Rzepa, Christoph Steinbeck, Jörg K. Wegner, and Egon L. Willighagen, J. Chem. Inf. Model.; 2006; doi:10.1021/ci050400b

関連項目

ポータル FLOSS
  • 化学データベース
  • Ghemical(英語版) - Openbabelに基づいた分子力学プログラム
  • JOELib(英語版) - OpenBabel/OELib(英語版)のJava版
  • XDrawChem - OpenBabelに基づいた2D 描画プログラム
  • 分子モデリングソフトウェア(英語版)
  • Blue Obelisk(英語版)

外部リンク

  • OpenBabelホームページ
  • blueobelisk.org
  • E-BABEL 対話式のOpenBabel - Virtual Computational Chemistry Laboratory
  • Online Molecule Format Converter
  • Geoff Hutchison(プロジェクトの先導的開発者)のポッドキャストでのインタビュー chemCast Episode 003
  • Design flaws in OELib
計算化学ソフトウェア
ケモインフォマティクス
オープンソース
  • Avalon Cheminformatics Toolkit
  • Bioclipse
  • Blue Obelisk
  • Chemistry Development Kit
  • ECCE
  • JOELib
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  • Open Babel
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