CTCF

CTCF
사용 가능한 구조
PDB동원체 검색: PDBe RCSB
PDB ID 코드 목록

1X6H, 2CT1

식별자
다른 이름CTCF, MRD21, CCCTC-binding factor, FAP108, CFAP108
외부 IDOMIM: 604167 MGI: 109447 HomoloGene: 4786 GeneCards: CTCF
유전자 위치 (인간)
16번 염색체
염색체16번 염색체[1]
16번 염색체
CTCF의 유전자 위치
CTCF의 유전자 위치
자리16q22.1시작67,562,467 bp[1]
67,639,177 bp[1]
유전자 위치 ()
8번 염색체 (쥐)
염색체8번 염색체 (쥐)[2]
8번 염색체 (쥐)
CTCF의 유전자 위치
CTCF의 유전자 위치
자리8|8 D3시작105,636,568 bp[2]
105,682,922 bp[2]
RNA 발현 패턴
Bgee
인간(동원체)
최상위 발현
  • ventricular zone

  • ganglionic eminence

  • 가슴샘

  • cerebellar vermis

  • paraflocculus of cerebellum

  • 림프절

  • 해면뼈

  • Skeletal muscle tissue of rectus abdominis

  • 골수

  • skin of thigh
최상위 발현
  • Rostral migratory stream

  • 가슴샘

  • neural layer of retina

  • tail of embryo

  • 구형낭

  • genital tubercle

  • otic placode

  • ventricular zone

  • otic vesicle

  • 위판
추가 참조 발현 데이터
BioGPS
추가 참조 발현 데이터
유전자 온톨로지
분자 함수
  • DNA 결합
  • transcription corepressor activity
  • DNA-binding transcription factor activity
  • zinc ion binding
  • 금속 이온 결합
  • chromatin insulator sequence binding
  • RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
  • DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
  • 단백질 결합
  • nucleic acid binding
  • DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
  • sequence-specific DNA binding
  • DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
  • chromatin binding
세포 성분
  • 핵질
  • 염색체
  • 핵소체
  • 동원체
  • condensed chromosome
  • 세포핵
생물학적 과정
  • DNA를 주형으로 한 전사의 조절
  • regulation of gene expression, epigenetic
  • regulation of centromeric sister chromatid cohesion
  • chromosome segregation
  • DNA를 주형으로 한 전사
  • positive regulation of transcription, DNA-templated
  • negative regulation of transcription, DNA-templated
  • protein localization to chromosome, centromeric region
  • negative regulation of cell population proliferation
  • chromatin organization
  • negative regulation of transcription by RNA polymerase II
  • positive regulation of gene expression
  • DNA 메틸화
  • regulation of gene expression by genetic imprinting
  • maintenance of DNA methylation
  • negative regulation of gene expression
  • regulation of histone methylation
  • regulation of histone acetylation
  • positive regulation of transcription by RNA polymerase II
출처: Amigo / QuickGO
동원체
인간
앙트레

10664

13018

앙상블

ENSG00000102974

ENSMUSG00000005698

유니프롯

P49711

Q61164

RefSeq (mRNA)

NM_001191022
NM_006565
NM_001363916

NM_181322
NM_001358924

RefSeq(단백질)

NP_001177951
NP_006556
NP_001350845

NP_851839
NP_001345853
NP_001390652
NP_001390653
NP_001390654

NP_001390655
NP_001390656
NP_001390657
NP_001390658
NP_001390659
NP_001390660
NP_001390661

위치(UCSC)Chr 16: 67.56 – 67.64 MbChr 8: 105.64 – 105.68 Mb
PubMed 검색[3][4]
위키데이터
인간 보기/편집쥐 보기/편집

11-아연 핑거 단백질(11-zinc finger protein) 또는 CCCTC 결합 인자(Transcriptional repressor CTCF)로도 알려진 전사 억제자 CTCF는 인간에서 CTCF 유전자에 의해 암호화되는 전사인자이다. CTCF는 전사 조절, 절연체 활성, V(D)J 재조합 및 염색질 구조 조절을 포함한 많은 세포 과정에 관여한다.

발견

CCCTC 결합 인자(CTCF)는 처음에 닭 c-myc 유전자의 음성 조절 인자로 발견되었다. 이 단백질은 핵심 서열 CCCTC의 3개의 규칙적인 간격의 반복에 결합하는 것으로 밝혀졌으며 이에 따라 CCCTC 결합 인자로 명명되었다.

외부 링크

  • 의학주제표목 (MeSH)의 CCCTC-binding+factor
  • FactorBook CTCF
  • 인간 CTCF 게놈 위치와 CTCF 유전자의 상세한 설명은 UCSC 게놈 브라우저에 있습니다.
  • https://www.ctcfemory.com/ A Group for families affected by CTCF mutations
  1. GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000102974 - 앙상블, May 2017
  2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000005698 - 앙상블, May 2017
  3. “Human PubMed Reference:”. 《National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine》. 
  4. “Mouse PubMed Reference:”. 《National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine》.