CXXC1

CXXC1
사용 가능한 구조
PDB동원체 검색: PDBe RCSB
PDB ID 코드 목록

3QMB, 3QMC, 3QMD, 3QMG, 3QMH, 3QMI

식별자
다른 이름CXXC1, 2410002I16Rik, 5830420C16Rik, CFP1, CGBP, HsT2645, PCCX1, PHF18, SPP1, ZCGPC1, hCGBP, CXXC finger protein 1
외부 IDOMIM: 609150 MGI: 1921572 HomoloGene: 32221 GeneCards: CXXC1
유전자 위치 (인간)
18번 염색체
염색체18번 염색체[1]
18번 염색체
CXXC1의 유전자 위치
CXXC1의 유전자 위치
자리18q21.1시작50,282,343 bp[1]
50,287,839 bp[1]
유전자 위치 ()
18번 염색체 (쥐)
염색체18번 염색체 (쥐)[2]
18번 염색체 (쥐)
CXXC1의 유전자 위치
CXXC1의 유전자 위치
자리18|18 E2시작74,349,195 bp[2]
74,354,567 bp[2]
RNA 발현 패턴
Bgee
인간(동원체)
최상위 발현
  • right hemisphere of cerebellum

  • body of pancreas

  • 오른자궁관

  • 이자관세포

  • 과립구

  • right lobe of thyroid gland

  • skin of leg

  • 장딴지신경

  • 배의 피부

  • left lobe of thyroid gland
최상위 발현
  • Ileal epithelium

  • tail of embryo

  • genital tubercle

  • neural layer of retina

  • choroid plexus of fourth ventricle

  • lactiferous gland

  • entorhinal cortex

  • perirhinal cortex

  • secondary oocyte

  • otic vesicle
추가 참조 발현 데이터
BioGPS


추가 참조 발현 데이터
유전자 온톨로지
분자 함수
  • DNA 결합
  • zinc ion binding
  • 단백질 결합
  • cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
  • histone methyltransferase activity (H3-K4 specific)
  • 금속 이온 결합
  • unmethylated CpG binding
  • DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
세포 성분
  • nuclear matrix
  • nuclear speck
  • 세포핵
  • 핵질
  • histone methyltransferase complex
  • 세포액
  • Set1C/COMPASS complex
생물학적 과정
  • positive regulation of transcription, DNA-templated
  • IRE1-mediated unfolded protein response
  • histone H3-K4 methylation
  • DNA를 주형으로 한 전사의 조절
  • DNA를 주형으로 한 전사
  • regulation of transcription by RNA polymerase II
출처: Amigo / QuickGO
동원체
인간
앙트레

30827

74322

앙상블

ENSG00000154832

ENSMUSG00000024560

유니프롯

Q9P0U4

Q9CWW7

RefSeq (mRNA)

NM_001101654
NM_014593

NM_028868
NM_001378844

RefSeq(단백질)

NP_001095124
NP_055408

NP_083144
NP_001365773

위치(UCSC)Chr 18: 50.28 – 50.29 MbChr 18: 74.35 – 74.35 Mb
PubMed 검색[3][4]
위키데이터
인간 보기/편집쥐 보기/편집

CXXC 유형 아연 손가락 단백질 1(CXXC1) 또는 PHD 손가락 CXXC 도메인 함유 단백질 1(PCCX1) 또는 CpG 결합 단백질(CGBP)은 인간에서 CXXC1 유전자에 의해 암호화되는 단백질이다.[5][6][7]

CXXC1과 같은 DNA 결합 도메인 내에 CXXC 주제를 포함하는 단백질은 CpG 서열을 인식하고 유전자 발현을 조절한다.[6]

각주

  1. GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000154832 - 앙상블, May 2017
  2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000024560 - 앙상블, May 2017
  3. “Human PubMed Reference:”. 《National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine》. 
  4. “Mouse PubMed Reference:”. 《National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine》. 
  5. “PCCX1, a novel DNA-binding protein with PHD finger and CXXC domain, is regulated by proteolysis”. 《Biochem Biophys Res Commun》 271 (2): 305–310. Jun 2000. doi:10.1006/bbrc.2000.2614. PMID 10799292. 
  6. “Cloning of a mammalian transcriptional activator that binds unmethylated CpG motifs and shares a CXXC domain with DNA methyltransferase, human trithorax, and methyl-CpG binding domain protein 1”. 《Mol Cell Biol》 20 (6): 2108–2121. Mar 2000. doi:10.1128/MCB.20.6.2108-2121.2000. PMC 110827. PMID 10688657. 
  7. “Entrez Gene: CXXC1 CXXC finger 1 (PHD domain)”.