MTA2

Ассоциированное с метастазами семейство 1, член 2
Идентификаторы
Символ MTA2 ; MTA1L1; PID
Внешние ID OMIM: 603947 MGI: 1346340 HomoloGene: 3480 GeneCards: Ген MTA2
Функция • RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific DNA binding

• RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific DNA binding
• transcription factor binding transcription factor activity
• RNA polymerase II transcription factor binding
• RNA polymerase II repressing transcription factor binding
• sequence-specific DNA binding transcription factor activity
• histone deacetylase activity
• protein binding
• zinc ion binding

• nucleosomal DNA binding
Компонент клетки • histone deacetylase complex

• nuclear chromatin
• nucleus
• transcription factor complex
• nucleolus
• membrane
• NuRD complex

• protein complex
Биологический процесс • negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter

• DNA methylation
• chromatin assembly or disassembly
• histone deacetylation
• ATP-dependent chromatin remodeling

• positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
Вид Человек Мышь
Entrez 9219 23942
Ensembl ENSG00000149480 ENSMUSG00000071646
UniProt O94776 Q9R190
RefSeq (мРНК) NM_004739 NM_011842
RefSeq (белок) NP_004730 NP_035972
Локус (UCSC) Chr 11:
62.36 – 62.37 Mb		 Chr 19:
8.94 – 8.95 Mb
Поиск в PubMed Искать Искать

Ассоциированный с метастазами белок MTA2  — белок, кодируемый у человека геном MTA2 [1][2].

Этот ген кодирует белок, который был идентифицирован как компонент NuRD, белок нуклеосомной реконструкции деацетилазного комплекса, определённого в ядрах клеток человека. Он показывает очень широкую экспрессию матриц и сильно выражен во многих тканях. Он может быть одним из членов небольшого семейства генов, которые кодируют различные, но взаимосвязанные белки, участвующие прямо или косвенно в регуляции транскрипции. Их косвенное воздействие на регуляцию транскрипции может включать в себя ремоделирование хроматина. Он тесно связан с другим членом этого семейства, белком, который коррелирует с метастатическим потенциалом некоторых карцином. Эти два белка связаны настолько тесно, что они разделяют одни и те же типы доменов. Эти домены включают два ДНК-связывающий домена, домен димеризации и домен, обычно встречающийся в белках, которые метилируют ДНК. Один из таких белков известен как белок назначения для продукта гена p53. Деактилация р53 коррелирует с потерей ингибирования роста в трансформированных клетках, поддерживающих связь между этими членами семейства генов и метастазов[2].

Взаимодействия

MTA2, как было выявлено, взаимодействует со следующими структурами: HDAC1[3][4][5][6], гистондезацетилаза 2[3][5][7], MTA1[3], CHD4[3], RBBP7[3][5], RBBP4[3][5], MBD3[5][8][9] и SATB1[6].

Примечания

  1. ↑ Futamura M., Nishimori H., Shiratsuchi T., Saji S., Nakamura Y., Tokino T. Molecular cloning, mapping, and characterization of a novel human gene, MTA1-L1, showing homology to a metastasis-associated gene, MTA1 (англ.) // Journal of Human Genetics[англ.] : journal. — 1999. — March (vol. 44, no. 1). — P. 52—6. — doi:10.1007/s100380050107. — PMID 9929979.
  2. ↑ 1 2 Entrez Gene: MTA2 metastasis associated 1 family, member 2  (неопр.).
  3. ↑ 1 2 3 4 5 6 Yao, Ya-Li; Yang Wen-Ming. The metastasis-associated proteins 1 and 2 form distinct protein complexes with histone deacetylase activity (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — United States, 2003. — October (vol. 278, no. 43). — P. 42560—42568. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.M302955200. — PMID 12920132.
  4. ↑ You, A; Tong J K; Grozinger C M; Schreiber S L. CoREST is an integral component of the CoREST- human histone deacetylase complex (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — United States, 2001. — February (vol. 98, no. 4). — P. 1454—1458. — ISSN 0027-8424. — doi:10.1073/pnas.98.4.1454. — PMID 11171972. — PMC 29278.
  5. ↑ 1 2 3 4 5 Zhang, Y; Ng H H; Erdjument-Bromage H; Tempst P; Bird A; Reinberg D. Analysis of the NuRD subunits reveals a histone deacetylase core complex and a connection with DNA methylation (англ.) // Genes & Development : journal. — UNITED STATES, 1999. — August (vol. 13, no. 15). — P. 1924—1935. — ISSN 0890-9369. — doi:10.1101/gad.13.15.1924. — PMID 10444591. — PMC 316920.
  6. ↑ 1 2 Yasui, Dag; Miyano Masaru, Cai Shutao, Varga-Weisz Patrick, Kohwi-Shigematsu Terumi. SATB1 targets chromatin remodelling to regulate genes over long distances (англ.) // Nature : journal. — England, 2002. — October (vol. 419, no. 6907). — P. 641—645. — ISSN 0028-0836. — doi:10.1038/nature01084. — PMID 12374985.
  7. ↑ Hakimi, Mohamed-Ali; Dong Yuanshu; Lane William S; Speicher David W; Shiekhattar Ramin. A candidate X-linked mental retardation gene is a component of a new family of histone deacetylase-containing complexes (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — United States, 2003. — February (vol. 278, no. 9). — P. 7234—7239. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.M208992200. — PMID 12493763.
  8. ↑ Sakai, Hirotaka; Urano Takeshi; Ookata Kayoko; Kim Mi-Hyun; Hirai Yugo; Saito Motoki; Nojima Yoshihisa; Ishikawa Fuyuki. MBD3 and HDAC1, two components of the NuRD complex, are localized at Aurora-A-positive centrosomes in M phase (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — United States, 2002. — December (vol. 277, no. 50). — P. 48714—48723. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.M208461200. — PMID 12354758.
  9. ↑ Saito, Motoki; Ishikawa Fuyuki. The mCpG-binding domain of human MBD3 does not bind to mCpG but interacts with NuRD/Mi2 components HDAC1 and MTA2 (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — United States, 2002. — September (vol. 277, no. 38). — P. 35434—35439. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.M203455200. — PMID 12124384.

Литература

  • Zhang Y., LeRoy G., Seelig H.P., et al. The dermatomyositis-specific autoantigen Mi2 is a component of a complex containing histone deacetylase and nucleosome remodeling activities. (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1998. — Vol. 95, no. 2. — P. 279—289. — doi:10.1016/S0092-8674(00)81758-4. — PMID 9790534.
  • Tong J.K., Hassig C.A., Schnitzler G.R., et al. Chromatin deacetylation by an ATP-dependent nucleosome remodelling complex. (англ.) // Nature : journal. — 1998. — Vol. 395, no. 6705. — P. 917—921. — doi:10.1038/27699. — PMID 9804427.
  • Xue Y., Wong J., Moreno G.T., et al. NURD, a novel complex with both ATP-dependent chromatin-remodeling and histone deacetylase activities. (англ.) // Molecular Cell[англ.] : journal. — 1999. — Vol. 2, no. 6. — P. 851—861. — doi:10.1016/S1097-2765(00)80299-3. — PMID 9885572.
  • Zhang Y., Ng H.H., Erdjument-Bromage H., et al. Analysis of the NuRD subunits reveals a histone deacetylase core complex and a connection with DNA methylation. (англ.) // Genes & Development : journal. — 1999. — Vol. 13, no. 15. — P. 1924—1935. — doi:10.1101/gad.13.15.1924. — PMID 10444591. — PMC 316920.
  • Wade P.A., Gegonne A., Jones P.L., et al. Mi-2 complex couples DNA methylation to chromatin remodelling and histone deacetylation. (англ.) // Nature Genetics : journal. — 1999. — Vol. 23, no. 1. — P. 62—6. — doi:10.1038/12664. — PMID 10471500.
  • Luo J., Su F., Chen D., et al. Deacetylation of p53 modulates its effect on cell growth and apoptosis. (англ.) // Nature : journal. — 2000. — Vol. 408, no. 6810. — P. 377—381. — doi:10.1038/35042612. — PMID 11099047.
  • Humphrey G.W., Wang Y., Russanova V.R., et al. Stable histone deacetylase complexes distinguished by the presence of SANT domain proteins CoREST/kiaa0071 and Mta-L1. (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 9. — P. 6817—6824. — doi:10.1074/jbc.M007372200. — PMID 11102443.
  • Feng Q., Zhang Y. The MeCP1 complex represses transcription through preferential binding, remodeling, and deacetylating methylated nucleosomes. (англ.) // Genes & Development : journal. — 2001. — Vol. 15, no. 7. — P. 827—832. — doi:10.1101/gad.876201. — PMID 11297506. — PMC 312663.
  • Shi Y., Downes M., Xie W., et al. Sharp, an inducible cofactor that integrates nuclear receptor repression and activation. (англ.) // Genes & Development : journal. — 2001. — Vol. 15, no. 9. — P. 1140—1151. — doi:10.1101/gad.871201. — PMID 11331609. — PMC 312688.
  • Saito M., Ishikawa F. The mCpG-binding domain of human MBD3 does not bind to mCpG but interacts with NuRD/Mi2 components HDAC1 and MTA2. (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 38. — P. 35434—35439. — doi:10.1074/jbc.M203455200. — PMID 12124384.
  • Yasui D., Miyano M., Cai S., et al. SATB1 targets chromatin remodelling to regulate genes over long distances. (англ.) // Nature : journal. — 2002. — Vol. 419, no. 6907. — P. 641—645. — doi:10.1038/nature01084. — PMID 12374985.
  • Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H., et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
  • Hakimi M.A., Dong Y., Lane W.S., et al. A candidate X-linked mental retardation gene is a component of a new family of histone deacetylase-containing complexes. (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2003. — Vol. 278, no. 9. — P. 7234—7239. — doi:10.1074/jbc.M208992200. — PMID 12493763.
  • Fujita N., Jaye D.L., Kajita M., et al. MTA3, a Mi-2/NuRD complex subunit, regulates an invasive growth pathway in breast cancer. (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 2003. — Vol. 113, no. 2. — P. 207—219. — doi:10.1016/S0092-8674(03)00234-4. — PMID 12705869.
  • Yao Y.L., Yang W.M. The metastasis-associated proteins 1 and 2 form distinct protein complexes with histone deacetylase activity. (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2004. — Vol. 278, no. 43. — P. 42560—42568. — doi:10.1074/jbc.M302955200. — PMID 12920132.
  • Zoltewicz J.S., Stewart N.J., Leung R., Peterson A.S. Atrophin 2 recruits histone deacetylase and is required for the function of multiple signaling centers during mouse embryogenesis. (англ.) // Development : journal. — 2004. — Vol. 131, no. 1. — P. 3—14. — doi:10.1242/dev.00908. — PMID 14645126.
  • Miaczynska M., Christoforidis S., Giner A., et al. APPL proteins link Rab5 to nuclear signal transduction via an endosomal compartment. (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 2004. — Vol. 116, no. 3. — P. 445—456. — doi:10.1016/S0092-8674(04)00117-5. — PMID 15016378.
  • Jiang C.L., Jin S.G., Pfeifer G.P. MBD3L1 is a transcriptional repressor that interacts with methyl-CpG-binding protein 2 (MBD2) and components of the NuRD complex. (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2005. — Vol. 279, no. 50. — P. 52456—52464. — doi:10.1074/jbc.M409149200. — PMID 15456747.
  • Gerhard D.S., Wagner L., Feingold E.A., et al. The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). (англ.) // Genome Research : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.