POLR2E

Полипептид E РНК-полимеразы II (управляемой ДНК), 25kDa
Идентификаторы
Символ POLR2E ; RPABC1; RPB5; XAP4; hRPB25; hsRPB5
Внешние ID OMIM: 180664 MGI: 1913670 HomoloGene: 2018 GeneCards: Ген POLR2E
номер EC 2.7.7.6
Функция • RNA polymerase I activity

• RNA polymerase II activity
• RNA polymerase III activity
• DNA binding
• DNA-directed RNA polymerase activity

• protein binding
Компонент клетки • nucleus

• nucleoplasm
• DNA-directed RNA polymerase II, core complex
• DNA-directed RNA polymerase III complex
• DNA-directed RNA polymerase I complex

• cytosol
Биологический процесс • mRNA splicing, via spliceosome

• DNA repair
• transcription-coupled nucleotide-excision repair
• nucleotide-excision repair
• transcription from RNA polymerase I promoter
• transcription from RNA polymerase II promoter
• transcription initiation from RNA polymerase II promoter
• transcription elongation from RNA polymerase II promoter
• 7-methylguanosine mRNA capping
• transcription from RNA polymerase III promoter
• transcription elongation from RNA polymerase III promoter
• termination of RNA polymerase III transcription
• RNA splicing
• gene expression
• viral process
• positive regulation of type I interferon production
• innate immune response

• positive regulation of viral transcription
Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
Вид Человек Мышь
Entrez 5434 66420
Ensembl ENSG00000099817 ENSMUSG00000004667
UniProt P19388 Q80UW8
RefSeq (мРНК) NM_002695 NM_025554
RefSeq (белок) NP_002686 NP_079830
Локус (UCSC) Chr 19:
1.09 – 1.1 Mb		 Chr 10:
80.04 – 80.04 Mb
Поиск в PubMed Искать Искать

Субъединица RPABC1 ДНК-зависимой РНК-полимеразы I, II и III  — белок, кодируемый у человека геном POLR2E .[1]

Этот ген кодирует пятую по величине субъединицу РНК-полимеразы II, полимеразы, ответственной за синтез РНК у эукариот. Эта субъединица является общей для двух других ДНК-зависимых РНК-полимераз и её концкентрация в два раза выше чем концентрация других субъединиц полимеразы. Было показано взаимодействие между этой субъединицей и трансактивацией белка вируса гепатита. Предполагается, что взаимодействие между активатором транскрипции и полимеразой может происходить через эту субъединицу. Псевдоген этого гнена расположен на хромосоме 11[2].

Взаимодействия

POLR2E, как было выявлено, взаимодействует с:

TAF15, [3] POLR2C, [4] POLR2G, [4] POLR2H, [4] POLR2A, [4] POLR2B, [4] POLR2L[4] и GTF2F2[5].

Примечания

  1. ↑ Acker J., Mattei M.G., Wintzerith M., Roeckel N., Depetris D., Vigneron M., Kedinger C. Chromosomal localization of human RNA polymerase II subunit genes (англ.) // Genomics : journal. — 1994. — August (vol. 20, no. 3). — P. 496—499. — doi:10.1006/geno.1994.1208. — PMID 8034326.
  2. ↑ Entrez Gene: POLR2E polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide E, 25kDa  (неопр.). Архивировано 5 декабря 2010 года.
  3. ↑ Bertolotti, A; Melot T; Acker J; Vigneron M; Delattre O; Tora L. EWS, but not EWS-FLI-1, is associated with both TFIID and RNA polymerase II: interactions between two members of the TET family, EWS and hTAFII68, and subunits of TFIID and RNA polymerase II complexes (англ.) // Molecular and Cellular Biology?! : journal. — UNITED STATES, 1998. — March (vol. 18, no. 3). — P. 1489—1497. — ISSN 0270-7306. — PMID 9488465. — PMC 108863.
  4. ↑ 1 2 3 4 5 6 Acker, J; de Graaff M; Cheynel I; Khazak V; Kedinger C; Vigneron M. Interactions between the human RNA polymerase II subunits (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — UNITED STATES, 1997. — July (vol. 272, no. 27). — P. 16815—16821. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.272.27.16815. — PMID 9201987.
  5. ↑ Wei, W; Dorjsuren D; Lin Y; Qin W; Nomura T; Hayashi N; Murakami S. Direct interaction between the subunit RAP30 of transcription factor IIF (TFIIF) and RNA polymerase subunit 5, which contributes to the association between TFIIF and RNA polymerase II (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — United States, 2001. — April (vol. 276, no. 15). — P. 12266—12273. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.M009634200. — PMID 11278533.

Литература

  • Jeang K.T. Tat, Tat-associated kinase, and transcription. (англ.) // Journal of Biomedical Science[англ.] : journal. — 1998. — Vol. 5, no. 1. — P. 24—7. — doi:10.1007/BF02253352. — PMID 9570510.
  • Yankulov K., Bentley D. Transcriptional control: Tat cofactors and transcriptional elongation. (англ.) // Current Biology : journal. — Cell Press, 1998. — Vol. 8, no. 13. — P. R447—9. — doi:10.1016/S0960-9822(98)70289-1. — PMID 9651670.
  • Romano G., Kasten M., De Falco G., et al. Regulatory functions of Cdk9 and of cyclin T1 in HIV tat transactivation pathway gene expression. (англ.) // Journal of Cellular Biochemistry[англ.] : journal. — 2000. — Vol. 75, no. 3. — P. 357—368. — doi:10.1002/(SICI)1097-4644(19991201)75:3<357::AID-JCB1>3.0.CO;2-K. — PMID 10536359.
  • Marcello A., Zoppé M., Giacca M. Multiple modes of transcriptional regulation by the HIV-1 Tat transactivator. (англ.) // IUBMB Life : journal. — 2002. — Vol. 51, no. 3. — P. 175—181. — doi:10.1080/152165401753544241. — PMID 11547919.
  • Stevens M., De Clercq E., Balzarini J. The regulation of HIV-1 transcription: molecular targets for chemotherapeutic intervention. (англ.) // Med Res Rev : journal. — 2007. — Vol. 26, no. 5. — P. 595—625. — doi:10.1002/med.20081. — PMID 16838299.
  • Harrich D., McMillan N., Munoz L., et al. Will diverse Tat interactions lead to novel antiretroviral drug targets? (англ.) // Current drug targets : journal. — 2007. — Vol. 7, no. 12. — P. 1595—1606. — doi:10.2174/138945006779025338. — PMID 17168834.
  • Kato H., Sumimoto H., Pognonec P., et al. HIV-1 Tat acts as a processivity factor in vitro in conjunction with cellular elongation factors. (англ.) // Genes & Development : journal. — 1992. — Vol. 6, no. 4. — P. 655—666. — doi:10.1101/gad.6.4.655. — PMID 1559613.
  • Pati U.K., Weissman S.M. Isolation and molecular characterization of a cDNA encoding the 23-kDa subunit of human RNA polymerase II. (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1991. — Vol. 266, no. 20. — P. 13468. — PMID 2071613.
  • Southgate C., Zapp M.L., Green M.R. Activation of transcription by HIV-1 Tat protein tethered to nascent RNA through another protein. (англ.) // Nature : journal. — 1990. — Vol. 345, no. 6276. — P. 640—642. — doi:10.1038/345640a0. — PMID 2190099.
  • Pati U.K., Weissman S.M. Isolation and molecular characterization of a cDNA encoding the 23-kDa subunit of human RNA polymerase II. (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1989. — Vol. 264, no. 22. — P. 13114—13121. — PMID 2753903.
  • Wu-Baer F., Sigman D., Gaynor R.B. Specific binding of RNA polymerase II to the human immunodeficiency virus trans-activating region RNA is regulated by cellular cofactors and Tat. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1995. — Vol. 92, no. 16. — P. 7153—7157. — doi:10.1073/pnas.92.16.7153. — PMID 7638159. — PMC 41297.
  • Cheong J.H., Yi M., Lin Y., Murakami S. Human RPB5, a subunit shared by eukaryotic nuclear RNA polymerases, binds human hepatitis B virus X protein and may play a role in X transactivation. (англ.) // The EMBO Journal?! : journal. — 1995. — Vol. 14, no. 1. — P. 143—150. — PMID 7828586. — PMC 398061.
  • Herrmann C.H., Rice A.P. Lentivirus Tat proteins specifically associate with a cellular protein kinase, TAK, that hyperphosphorylates the carboxyl-terminal domain of the large subunit of RNA polymerase II: candidate for a Tat cofactor. (англ.) // Journal of Virology[англ.] : journal. — 1995. — Vol. 69, no. 3. — P. 1612—1620. — PMID 7853496. — PMC 188757.
  • Keen N.J., Gait M.J., Karn J. Human immunodeficiency virus type-1 Tat is an integral component of the activated transcription-elongation complex. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1996. — Vol. 93, no. 6. — P. 2505—2510. — doi:10.1073/pnas.93.6.2505. — PMID 8637904. — PMC 39827.
  • Yang X., Herrmann C.H., Rice A.P. The human immunodeficiency virus Tat proteins specifically associate with TAK in vivo and require the carboxyl-terminal domain of RNA polymerase II for function. (англ.) // Journal of Virology[англ.] : journal. — 1996. — Vol. 70, no. 7. — P. 4576—4584. — PMID 8676484. — PMC 190394.
  • Agostini I., Navarro J.M., Rey F., et al. The human immunodeficiency virus type 1 Vpr transactivator: cooperation with promoter-bound activator domains and binding to TFIIB. (англ.) // Journal of Molecular Biology[англ.] : journal. — 1996. — Vol. 261, no. 5. — P. 599—606. — doi:10.1006/jmbi.1996.0485. — PMID 8800208.
  • Zhou Q., Sharp P.A. Tat-SF1: cofactor for stimulation of transcriptional elongation by HIV-1 Tat. (англ.) // Science : journal. — 1996. — Vol. 274, no. 5287. — P. 605—610. — doi:10.1126/science.274.5287.605. — PMID 8849451.
  • Okamoto H., Sheline C.T., Corden J.L., et al. Trans-activation by human immunodeficiency virus Tat protein requires the C-terminal domain of RNA polymerase II. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1996. — Vol. 93, no. 21. — P. 11575—11579. — doi:10.1073/pnas.93.21.11575. — PMID 8876177. — PMC 38099.
  • Chun R.F., Jeang K.T. Requirements for RNA polymerase II carboxyl-terminal domain for activated transcription of human retroviruses human T-cell lymphotropic virus I and HIV-1. (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1996. — Vol. 271, no. 44. — P. 27888—27894. — doi:10.1074/jbc.271.44.27888. — PMID 8910388.