RCOR1

Корепрессор REST 1
PDB представлено на примере 2iw5.PDB представлено на примере 2iw5.
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB

2IW5, 2UXN, 2UXX, 2V1D, 2X0L, 2XAF, 2XAG, 2XAH, 2XAJ, 2XAQ, 2XAS, 2Y48, 3ZMS, 3ZMT, 3ZMU, 3ZMV, 3ZMZ, 3ZN0, 3ZN1, 4BAY, 4KUM

Идентификаторы
Символ RCOR1 ; COREST; RCOR
Внешние ID OMIM: 607675 MGI: 106340 HomoloGene: 32246 GeneCards: Ген RCOR1
Функция • RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific DNA binding transcription factor activity involved in negative regulation of transcription

• chromatin binding
• protein binding

• transcription regulatory region DNA binding
Компонент клетки • nucleus

• nucleoplasm
• nucleolus

• transcriptional repressor complex
Биологический процесс • negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter

• transcription, DNA-templated
• blood coagulation
• viral process
• negative regulation of transcription, DNA-templated

• histone H4 deacetylation
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Вид Человек Мышь
Entrez 23186 217864
Ensembl ENSG00000089902 ENSMUSG00000037896
UniProt Q9UKL0 Q8CFE3
RefSeq (мРНК) NM_015156 NM_198023
RefSeq (белок) NP_055971 NP_932140
Локус (UCSC) Chr 14:
103.06 – 103.2 Mb		 Chr 12:
111.04 – 111.12 Mb
Поиск в PubMed Искать Искать

Корепрессор REST 1, который также известен как CoREST  — белок, кодируемый у человека геном RCOR1 .[1][2]

Функция

Этот ген кодирует белок, который хорошо сохраняется, подавляется при рождении и со специфической ролью в определении дифференциации нервных клеток. Кодируемый белок связывается с С-концевым доменом REST (репрессор транскрипционного фактора сайленсинга элемента 1 (англ. repressor element-1 silencing transcription factor).[2]

Взаимодействия

RCOR1,как было выявлено, взаимодействует с:

  • HDAC1,[3][4]
  • HDAC2,[3][4]
  • HMG20B,[3]
  • REST (биология)[англ.][5] и
  • PHF21A.[3][6]

Примечания

  1. ↑ Andrés M.E., Burger C., Peral-Rubio M.J., Battaglioli E., Anderson M.E., Grimes J., Dallman J., Ballas N., Mandel G. CoREST: a functional corepressor required for regulation of neural-specific gene expression (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1999. — September (vol. 96, no. 17). — P. 9873—9878. — doi:10.1073/pnas.96.17.9873. — PMID 10449787. — PMC 22303.
  2. ↑ 1 2 Entrez Gene: RCOR1 REST corepressor 1  (неопр.). Архивировано 5 декабря 2010 года.
  3. ↑ 1 2 3 4 Hakimi M.A., Bochar D.A., Chenoweth J., Lane W.S., Mandel G., Shiekhattar R. A core-BRAF35 complex containing histone deacetylase mediates repression of neuronal-specific genes (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2002. — May (vol. 99, no. 11). — P. 7420—7425. — doi:10.1073/pnas.112008599. — PMID 12032298. — PMC 124246.
  4. ↑ 1 2 You A., Tong J.K., Grozinger C.M., Schreiber S.L. CoREST is an integral component of the CoREST- human histone deacetylase complex (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2001. — February (vol. 98, no. 4). — P. 1454—1458. — doi:10.1073/pnas.98.4.1454. — PMID 11171972. — PMC 29278.
  5. ↑ Andrés M.E., Burger C., Peral-Rubio M.J., Battaglioli E., Anderson M.E., Grimes J., Dallman J., Ballas N., Mandel G. CoREST: a functional corepressor required for regulation of neural-specific gene expression (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1999. — August (vol. 96, no. 17). — P. 9873—9878. — doi:10.1073/pnas.96.17.9873. — PMID 10449787. — PMC 22303.
  6. ↑ Iwase S., Januma A., Miyamoto K., Shono N., Honda A., Yanagisawa J., Baba T. Characterization of BHC80 in BRAF-HDAC complex, involved in neuron-specific gene repression (англ.) // Biochemical and Biophysical Research Communications[англ.] : journal. — 2004. — September (vol. 322, no. 2). — P. 601—608. — doi:10.1016/j.bbrc.2004.07.163. — PMID 15325272.

Литература

  • Nomura N., Nagase T., Miyajima N., Sazuka T., Tanaka A., Sato S., Seki N., Kawarabayasi Y., Ishikawa K., Tabata S. Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. II. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0041-KIAA0080) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1 (англ.) // DNA Research[англ.] : journal. — 1994. — Vol. 1, no. 5. — P. 223—229. — doi:10.1093/dnares/1.5.223. — PMID 7584044.
  • Andersson B., Wentland M.A., Ricafrente J.Y., Liu W., Gibbs R.A. A "double adaptor" method for improved shotgun library construction (англ.) // Analytical Biochemistry[англ.] : journal. — 1996. — Vol. 236, no. 1. — P. 107—113. — doi:10.1006/abio.1996.0138. — PMID 8619474.
  • Yu W., Andersson B., Worley K.C., Muzny D.M., Ding Y., Liu W., Ricafrente J.Y., Wentland M.A., Lennon G., Gibbs R.A. Large-scale concatenation cDNA sequencing (англ.) // Genome Research[англ.] : journal. — 1997. — Vol. 7, no. 4. — P. 353—358. — doi:10.1101/gr.7.4.353. — PMID 9110174. — PMC 139146.
  • Grimes J.A., Nielsen S.J., Battaglioli E., Miska E.A., Speh J.C., Berry D.L., Atouf F., Holdener B.C., Mandel G., Kouzarides T. The co-repressor mSin3A is a functional component of the REST-CoREST repressor complex (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2000. — Vol. 275, no. 13. — P. 9461—9467. — doi:10.1074/jbc.275.13.9461. — PMID 10734093.
  • Hartley J.L., Temple G.F., Brasch M.A. DNA cloning using in vitro site-specific recombination (англ.) // Genome Research[англ.] : journal. — 2000. — Vol. 10, no. 11. — P. 1788—1795. — doi:10.1101/gr.143000. — PMID 11076863. — PMC 310948.
  • Humphrey G.W., Wang Y., Russanova V.R., Hirai T., Qin J., Nakatani Y., Howard B.H. Stable histone deacetylase complexes distinguished by the presence of SANT domain proteins CoREST/kiaa0071 and Mta-L1 (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 9. — P. 6817—6824. — doi:10.1074/jbc.M007372200. — PMID 11102443.
  • You A., Tong J.K., Grozinger C.M., Schreiber S.L. CoREST is an integral component of the CoREST- human histone deacetylase complex (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2001. — Vol. 98, no. 4. — P. 1454—1458. — doi:10.1073/pnas.98.4.1454. — PMID 11171972. — PMC 29278.
  • Ballas N., Battaglioli E., Atouf F., Andres M.E., Chenoweth J., Anderson M.E., Burger C., Moniwa M., Davie J.R., Bowers W.J., Federoff H.J., Rose D.W., Rosenfeld M.G., Brehm P., Mandel G. Regulation of neuronal traits by a novel transcriptional complex (англ.) // Neuron[англ.] : journal. — Cell Press, 2001. — Vol. 31, no. 3. — P. 353—365. — doi:10.1016/S0896-6273(01)00371-3. — PMID 11516394.
  • Hakimi M.A., Bochar D.A., Chenoweth J., Lane W.S., Mandel G., Shiekhattar R. A core-BRAF35 complex containing histone deacetylase mediates repression of neuronal-specific genes (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2002. — Vol. 99, no. 11. — P. 7420—7425. — doi:10.1073/pnas.112008599. — PMID 12032298. — PMC 124246.
  • Battaglioli E., Andrés M.E., Rose D.W., Chenoweth J.G., Rosenfeld M.G., Anderson M.E., Mandel G. REST repression of neuronal genes requires components of the hSWI.SNF complex (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 43. — P. 41038—41045. — doi:10.1074/jbc.M205691200. — PMID 12192000.
  • Lunyak V.V., Burgess R., Prefontaine G.G., Nelson C., Sze S.H., Chenoweth J., Schwartz P., Pevzner P.A., Glass C., Mandel G., Rosenfeld M.G. Corepressor-dependent silencing of chromosomal regions encoding neuronal genes (англ.) // Science : journal. — 2002. — Vol. 298, no. 5599. — P. 1747—1752. — doi:10.1126/science.1076469. — PMID 12399542.
  • Hakimi M.A., Dong Y., Lane W.S., Speicher D.W., Shiekhattar R. A candidate X-linked mental retardation gene is a component of a new family of histone deacetylase-containing complexes (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2003. — Vol. 278, no. 9. — P. 7234—7239. — doi:10.1074/jbc.M208992200. — PMID 12493763.
  • Iwase S., Januma A., Miyamoto K., Shono N., Honda A., Yanagisawa J., Baba T. Characterization of BHC80 in BRAF-HDAC complex, involved in neuron-specific gene repression (англ.) // Biochemical and Biophysical Research Communications[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 322, no. 2. — P. 601—608. — doi:10.1016/j.bbrc.2004.07.163. — PMID 15325272.
  • Gu H., Liang Y., Mandel G., Roizman B. Components of the REST/CoREST/histone deacetylase repressor complex are disrupted, modified, and translocated in HSV-1-infected cells (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2005. — Vol. 102, no. 21. — P. 7571—7576. — doi:10.1073/pnas.0502658102. — PMID 15897453. — PMC 1140450.
  • Lee M.G., Wynder C., Cooch N., Shiekhattar R. An essential role for CoREST in nucleosomal histone 3 lysine 4 demethylation (англ.) // Nature : journal. — 2005. — Vol. 437, no. 7057. — P. 432—435. — doi:10.1038/nature04021. — PMID 16079794.
  • Shi Y.J., Matson C., Lan F., Iwase S., Baba T., Shi Y. Regulation of LSD1 histone demethylase activity by its associated factors (англ.) // Molecular Cell[англ.] : journal. — 2005. — Vol. 19, no. 6. — P. 857—864. — doi:10.1016/j.molcel.2005.08.027. — PMID 16140033.
  • Nousiainen M., Silljé H.H., Sauer G., Nigg E.A., Körner R. Phosphoproteome analysis of the human mitotic spindle (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2006. — Vol. 103, no. 14. — P. 5391—5396. — doi:10.1073/pnas.0507066103. — PMID 16565220. — PMC 1459365.