SIN3B

Член B семейства регуляторов транскрипции SIN3
PDB представлено на основе 1e91.PDB представлено на основе 1e91.
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB

1e91, 1pd7, 2cr7, 2czy, 2f05

Идентификаторы
Символ SIN3B ; KIAA0700
Внешние ID OMIM: 607777 MGI: 107158 HomoloGene: 81810 GeneCards: Ген SIN3B
Функция • chromatin binding

• transcription corepressor activity

• protein binding
Компонент клетки • X chromosome

• Y chromosome
• XY body
• nucleus
• nucleoplasm
• cytoplasm

• autosome
Биологический процесс • transcription, DNA-templated

• skeletal muscle tissue development
• cellular lipid metabolic process
• small molecule metabolic process
• negative regulation of transcription, DNA-templated
• rhythmic process

• cardiac muscle tissue development
Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
Вид Человек Мышь
Entrez 23309 20467
Ensembl ENSG00000127511 ENSMUSG00000031622
UniProt O75182 Q62141
RefSeq (мРНК) NM_001297595 NM_001113248
RefSeq (белок) NP_001284524 NP_001106719
Локус (UCSC) Chr 19:
16.94 – 16.99 Mb		 Chr 8:
72.72 – 72.76 Mb
Поиск в PubMed Искать Искать

SIN3B (англ. Paired amphipathic helix protein Sin3a — белок парной амфипатической спирали Sin3b) — белок, кодируемый у человека геном SIN3B [1][2].

Взаимодействия с другими белками

SIN3B, как было выявлено, взаимодействует с HDAC1[3][4], цинковым пальцем и ВТВ доменом, содержащим белок 16[5], SUDS3[6] и IKZF1[4][7].

Примечания

  1. ↑ Ishikawa K., Nagase T., Suyama M., Miyajima N., Tanaka A., Kotani H., Nomura N., Ohara O. Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. X. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which can code for large proteins in vitro (англ.) // DNA Res[англ.] : journal. — 1998. — December (vol. 5, no. 3). — P. 169—176. — doi:10.1093/dnares/5.3.169. — PMID 9734811.
  2. ↑ Entrez Gene: SIN3B SIN3 homolog B, transcription regulator (yeast)  (неопр.). Архивировано 5 декабря 2010 года.
  3. ↑ Zhang, Y; Ng H H; Erdjument-Bromage H; Tempst P; Bird A; Reinberg D. Analysis of the NuRD subunits reveals a histone deacetylase core complex and a connection with DNA methylation (англ.) // Genes Dev. : journal. — UNITED STATES, 1999. — August (vol. 13, no. 15). — P. 1924—1935. — ISSN 0890-9369. — doi:10.1101/gad.13.15.1924. — PMID 10444591. — PMC 316920.
  4. ↑ 1 2 Koipally, J; Renold A; Kim J; Georgopoulos K. Repression by Ikaros and Aiolos is mediated through histone deacetylase complexes (англ.) // EMBO J.?! : journal. — ENGLAND, 1999. — June (vol. 18, no. 11). — P. 3090—3100. — ISSN 0261-4189. — doi:10.1093/emboj/18.11.3090. — PMID 10357820. — PMC 1171390.
  5. ↑ David, G; Alland L; Hong S H; Wong C W; DePinho R A; Dejean A. Histone deacetylase associated with mSin3A mediates repression by the acute promyelocytic leukemia-associated PLZF protein (англ.) // Oncogene?! : journal. — ENGLAND, 1998. — May (vol. 16, no. 19). — P. 2549—2556. — ISSN 0950-9232. — doi:10.1038/sj.onc.1202043. — PMID 9627120.
  6. ↑ Alland, Leila; David Gregory, Shen-Li Hong, Potes Jason, Muhle Rebecca, Lee Hye-Chun, Hou Harry, Chen Ken, DePinho Ronald A. Identification of Mammalian Sds3 as an Integral Component of the Sin3/Histone Deacetylase Corepressor Complex (англ.) // Mol. Cell. Biol.?! : journal. — United States, 2002. — April (vol. 22, no. 8). — P. 2743—2750. — ISSN 0270-7306. — doi:10.1128/MCB.22.8.2743-2750.2002. — PMID 11909966. — PMC 133736.
  7. ↑ Koipally, Joseph; Georgopoulos Katia. A molecular dissection of the repression circuitry of Ikaros (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — United States, 2002. — August (vol. 277, no. 31). — P. 27697—27705. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.M201694200. — PMID 12015313.

Литература

  • Ayer D.E., Lawrence Q.A., Eisenman R.N. Mad-Max transcriptional repression is mediated by ternary complex formation with mammalian homologs of yeast repressor Sin3 (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1995. — Vol. 80, no. 5. — P. 767—776. — doi:10.1016/0092-8674(95)90355-0. — PMID 7889570.
  • David G., Alland L., Hong S.H., et al. Histone deacetylase associated with mSin3A mediates repression by the acute promyelocytic leukemia-associated PLZF protein (англ.) // Oncogene?! : journal. — 1998. — Vol. 16, no. 19. — P. 2549—2556. — doi:10.1038/sj.onc.1202043. — PMID 9627120.
  • Koipally J., Renold A., Kim J., Georgopoulos K. Repression by Ikaros and Aiolos is mediated through histone deacetylase complexes (англ.) // EMBO J.?! : journal. — 1999. — Vol. 18, no. 11. — P. 3090—3100. — doi:10.1093/emboj/18.11.3090. — PMID 10357820. — PMC 1171390.
  • Naruse Y., Aoki T., Kojima T., Mori N. Neural restrictive silencer factor recruits mSin3 and histone deacetylase complex to repress neuron-specific target genes (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2000. — Vol. 96, no. 24. — P. 13691—13696. — doi:10.1073/pnas.96.24.13691. — PMID 10570134. — PMC 24126.
  • Spronk C.A., Tessari M., Kaan A.M., et al. The Mad1-Sin3B interaction involves a novel helical fold (англ.) // Nat. Struct. Biol. : journal. — 2001. — Vol. 7, no. 12. — P. 1100—1104. — doi:10.1038/81944. — PMID 11101889.
  • Spronk C.A., Jansen J.F., Tessari M., et al. Sequence-specific assignment of the PAH2 domain of Sin3B free and bound to Mad1 (англ.) // J. Biomol. NMR[англ.] : journal. — 2001. — Vol. 19, no. 4. — P. 377—378. — doi:10.1023/A:1011262214741. — PMID 11370785.
  • Alland L., David G., Shen-Li H., et al. Identification of Mammalian Sds3 as an Integral Component of the Sin3/Histone Deacetylase Corepressor Complex (англ.) // Mol. Cell. Biol.?! : journal. — 2002. — Vol. 22, no. 8. — P. 2743—2750. — doi:10.1128/MCB.22.8.2743-2750.2002. — PMID 11909966. — PMC 133736.
  • Rayman J.B., Takahashi Y., Indjeian V.B., et al. E2F mediates cell cycle-dependent transcriptional repression in vivo by recruitment of an HDAC1/mSin3B corepressor complex (англ.) // Genes Dev. : journal. — 2002. — Vol. 16, no. 8. — P. 933—947. — doi:10.1101/gad.969202. — PMID 11959842. — PMC 152357.
  • Koipally J., Georgopoulos K. A molecular dissection of the repression circuitry of Ikaros (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 31. — P. 27697—27705. — doi:10.1074/jbc.M201694200. — PMID 12015313.
  • Yang L., Mei Q., Zielinska-Kwiatkowska A., et al. An ERG (ets-related gene)-associated histone methyltransferase interacts with histone deacetylases 1/2 and transcription co-repressors mSin3A/B (англ.) // Biochem. J.[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 369, no. Pt 3. — P. 651—657. — doi:10.1042/BJ20020854. — PMID 12398767. — PMC 1223118.
  • Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H., et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
  • Petrie K., Guidez F., Howell L., et al. The histone deacetylase 9 gene encodes multiple protein isoforms (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2003. — Vol. 278, no. 18. — P. 16059—16072. — doi:10.1074/jbc.M212935200. — PMID 12590135.
  • Wysocka J., Myers M.P., Laherty C.D., et al. Human Sin3 deacetylase and trithorax-related Set1/Ash2 histone H3-K4 methyltransferase are tethered together selectively by the cell-proliferation factor HCF-1 (англ.) // Genes Dev. : journal. — 2003. — Vol. 17, no. 7. — P. 896—911. — doi:10.1101/gad.252103. — PMID 12670868. — PMC 196026.
  • Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T., et al. Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 2004. — Vol. 36, no. 1. — P. 40—5. — doi:10.1038/ng1285. — PMID 14702039.
  • Dugast-Darzacq C., Pirity M., Blanck J.K., et al. Mxi1-SRalpha: a novel Mxi1 isoform with enhanced transcriptional repression potential (англ.) // Oncogene?! : journal. — 2004. — Vol. 23, no. 55. — P. 8887—8899. — doi:10.1038/sj.onc.1208107. — PMID 15467743.
  • Gerhard D.S., Wagner L., Feingold E.A., et al. The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC) (англ.) // Genome Res.[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.
  • Rampalli S., Pavithra L., Bhatt A., et al. Tumor Suppressor SMAR1 Mediates Cyclin D1 Repression by Recruitment of the SIN3/Histone Deacetylase 1 Complex (англ.) // Mol. Cell. Biol.?! : journal. — 2005. — Vol. 25, no. 19. — P. 8415—8429. — doi:10.1128/MCB.25.19.8415-8429.2005. — PMID 16166625. — PMC 1265755.
  • Xu Y., Sengupta P.K., Seto E., Smith B.D. RFX family proteins differentially interact with HDACs to repress collagen alpha 2(I) gene (COL1A2) expression (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2006. — Vol. 281, no. 14. — P. 9260—9270. — doi:10.1074/jbc.M511724200. — PMID 16464847. — PMC 1434794.