Elongacioni faktor G

Sinteza peptida

EF-G ili elongacioni faktor G (istorijski poznata kao translokaza) jedan je od prokariotskih elongacionih faktora.

Funkcija

Faktor EF-G katalizuje translokaciju tRNK i iRNK duž ribozoma na kraju svakog kruga polipeptidne elongacije. Homologan je sa EF-Tu + tRNA. EF-G se takođe vezuje za ribozom u njegovom GTP-vezanom stanju. Kad se asocira sa A mestom, EF-G uzrokuje da tRNK koja je prethodno okupirala to mesto zauzme intermedijarnu A/P poziciju (pri čeum se vezuje za A mesto male ribozomne podjedinice i za P mesto velike podjedinice), i tRNA u P mestu se pomera u P/E hibridno stanje. EF-G hidroliza GTP-a uzrokuje konformacionu promenu, usled čega A/P tRNK poputuno zauzima P mesto, P/E tRNK potupuno zauzima E mesto (i napušta ribozomni kompleks), i iRNK se pomera za tri nukleotida u odnosu na ribozom usled njene asocijacije sa tim tRNK molekulima. EF-G molekul vezan za se zatim disocira od kompleksa, ostavljajući slobodno A-mesto, gde elongacioni ciklus može ponovo da počne.

Osim njegove uloge u translokaciji, EF-G, deluje da zajedno sa ribozomskim reciklacionim faktorom promoviše reciklaciju ribozoma u GTP zavisnom maniru.[1]

Klinički značaj

Ovaj enzim obično inhibira fusidinska kiselina. Pojedine varijante enzima su otporne.[2][3]

Evolucija

EF-G ima kompleksnu evolucionu istoriju. Brojne paralogne verzije faktora su prisutne kod bakterija, što sugestira subfunkcionalizaciju različitih EF-G varijanti.[4]

Reference

  1. Zavialov AV, Hauryliuk VV, Ehrenberg M. (2005). „Splitting of the posttermination ribosome into subunits by the concerted action of RRF and EF-G”. Molecular Cell 18 (6): 675–686. DOI:10.1016/j.molcel.2005.05.016. PMID 15949442. 
  2. Macvanin M, Hughes D (June 2005). „Hyper-susceptibility of a fusidic acid-resistant mutant of Salmonella to different classes of antibiotics”. FEMS microbiology letters 247 (2): 215–20. DOI:10.1016/j.femsle.2005.05.007. PMID 15935566. 
  3. Macvanin M, Johanson U, Ehrenberg M, Hughes D (July 2000). „Fusidic acid-resistant EF-G perturbs the accumulation of ppGpp”. Molecular microbiology 37 (1): 98–107. DOI:10.1046/j.1365-2958.2000.01967.x. PMID 10931308. [mrtav link]
  4. G C Atkinson, S L Baldauf (2011). „Evolution of elongation factor G and the origins of mitochondrial and chloroplast forms”. Molecular Biology and Evolution 28 (3): 1281–92. DOI:10.1093/molbev/msq316. PMID 21097998. 

Spoljašnje veze

  • MeSH Peptide+Elongation+Factor+G
  • p
  • r
  • u
Hidrolaze: Hidrolaze kiselinskih anhidrida (EC 3.6)
3.6.1
Pirofosfataza (Neorganska, Tiamin)  Apiraza  Tiamin trifosfataza
3.6.2
Adenililsulfataza  Fosfoadenililsulfataza
3.6.3-4: ATPaza
3.6.3
Cu++ (3.6.3.4)
Menkes/ATP7A  Vilson/ATP7B
Ca+ (3.6.3.8)
SERCA (ATP2A1, ATP2A2, ATP2A3)  Membrana plazme (ATP2B1, ATP2B2, ATP2B3, ATP2B4)  SPCA (ATP2C1, ATP2C2)
Na+/K+ (3.6.3.9)
ATP1A1  ATP1A2  ATP1A3  ATP1A4  ATP1B1  ATP1B2  ATP1B3  ATP1B4
H+/K+ (3.6.3.10)
ATP4A
Druge P-tip ATPaze
ATP8B1  ATP10A  ATP11B  ATP12A  ATP13A2  ATP13A3 
3.6.4
Dinein  Kinezin  Miozin
3.6.5: GTPaze
Gαs  Gαi (GNAI1, GNAI2, GNAI3 Gαq/11 (GNAQ, GNA11 Gα12/13 (GNA12, GNA13 Transducin (GNAT1, GNAT2)
Ras  Rab (Rab27)  Arf (Arf6)  Ran  Rheb  Ro familija (RhoA, RhoB, CDC42, Rac1)  Rap
3.6.5.3: Protein-sintetišuće GTPaze
Prokariotski (IF-2, EF-Tu, EF-G Eukariotski
3.6.5.5-6: Polimerizacioni motori
B enzm: 1.1/2/3/4/5/6/7/8/10/11/13/14/15-18, 2.1/2/3/4/5/6/7/8, 2.7.10, 2.7.11-12, 3.1/2/3/4/5/6/7, 3.1.3.48, 3.4.21/22/23/24, 4.1/2/3/4/5/6, 5.1/2/3/4/99, 6.1-3/4/5-6
  • p
  • r
  • u
30S
Tetraciklini
50S
EF-G
Steroidni antibiotici

M: BAC

bact (clas)

gr+f/gr+a (t)/gr-p (c)/gr-o

drug (J1p, w, n, m, vacc)