Limfotoksin alfa

edit

Limfotoksin alfa (TNF superfamilija, član 1)

PDB prikaz baziran na 1tnr.

Dostupne strukture

1tnr

Identifikatori

Simboli

LTA; LT; TNFB; TNFSF1

Vanjski ID

OMIM: 153440 MGI: 104797 HomoloGene: 497 GeneCards: LTA Gene

Ontologija gena
Molekularna funkcija	• aktivnost endopeptidaze cisteinskog tipa • citokinska aktivnost • vezivanje za receptor faktora nekroze tumora
Celularna komponenta	• ekstracelularni prostor • membrana
Biološki proces	• proteoliza • indukcija apoptoze • imunski odgovor • humoralni imunski odgovor • prenos signala • interćelijska signalizacija • razvoj limfnih čvorova

Pregled RNK izražavanja

podaci

Ortolozi

Vrsta

Čovek

Miš

Entrez

4049

16992

Ensembl

ENSG00000204496

ENSMUSG00000024402

UniProt

P01374

Q542S2

RefSeq (mRNA)

NM_000595

NM_010735

RefSeq (protein)

NP_000586

NP_034865

Lokacija (UCSC)

Chr 6:
31.65 - 31.65 Mb

Chr 17:
34.81 - 34.81 Mb

PubMed pretraga

[1]

[2]

Limfotoksin-alfa je protein koji je kod ljudi kodiran LTA genom.^[1]^[2]

Limfotoksin alfa, član familije faktora nekroze tumora, je citokin koga proizvode limfociti. LTA je visoko induktivan i izlučiv. On postoji kao homotrimerni molekul. LTA formira heterotrimere sa limfotoksinom-beta, čime se limfotoksin-alfa učvršćuje za ćelijsku površinu. LTA posreduje širok niz inflamatornih, imunostimulatornih, i antiviralnih odgovora. LTA takođe učestvuje u formaciji sekundarnih limfoidnih organa tokom razvoja, i ima ulogu u apoptozi.^[3]

Interakcije

Za limfotoksin alfa je bilo pokazano da interaguje sa LTB.^[4]^[5]^[6]

Reference

↑ Nedwin GE, Naylor SL, Sakaguchi AY, Smith D, Jarrett-Nedwin J, Pennica D, Goeddel DV, Gray PW (Nov 1985). „Human lymphotoxin and tumor necrosis factor genes: structure, homology and chromosomal localization”. Nucleic Acids Res 13 (17): 6361–73. DOI:10.1093/nar/13.17.6361. PMC 321958. PMID 2995927.
↑ Aggarwal BB, Eessalu TE, Hass PE (Feb 1986). „Characterization of receptors for human tumour necrosis factor and their regulation by gamma-interferon”. Nature 318 (6047): 665–7. PMID 3001529.
↑ „Entrez Gene: LTA lymphotoxin alpha (TNF superfamily, member 1)”.
↑ Williams-Abbott, L; Walter B N, Cheung T C, Goh C R, Porter A G, Ware C F (August 1997). „The lymphotoxin-alpha (LTalpha) subunit is essential for the assembly, but not for the receptor specificity, of the membrane-anchored LTalpha1beta2 heterotrimeric ligand”. J. Biol. Chem. (UNITED STATES) 272 (31): 19451–6. DOI:10.1074/jbc.272.31.19451. ISSN 0021-9258. PMID 9235946.
↑ Browning, J L; Sizing I D, Lawton P, Bourdon P R, Rennert P D, Majeau G R, Ambrose C M, Hession C, Miatkowski K, Griffiths D A, Ngam-ek A, Meier W, Benjamin C D, Hochman P S (October 1997). „Characterization of lymphotoxin-alpha beta complexes on the surface of mouse lymphocytes”. J. Immunol. (UNITED STATES) 159 (7): 3288–98. ISSN 0022-1767. PMID 9317127.
↑ Browning, J L; Dougas I, Ngam-ek A, Bourdon P R, Ehrenfels B N, Miatkowski K, Zafari M, Yampaglia A M, Lawton P, Meier W (January 1995). „Characterization of surface lymphotoxin forms. Use of specific monoclonal antibodies and soluble receptors”. J. Immunol. (UNITED STATES) 154 (1): 33–46. ISSN 0022-1767. PMID 7995952.

Literatura

Körner H, Sedgwick JD (1997). „Tumour necrosis factor and lymphotoxin: molecular aspects and role in tissue-specific autoimmunity.”. Immunol. Cell Biol. 74 (5): 465–72. DOI:10.1038/icb.1996.77. PMID 8912010.
Wang Q (2005). „Molecular genetics of coronary artery disease.”. Curr. Opin. Cardiol. 20 (3): 182–8. DOI:10.1097/01.hco.0000160373.77190.f1. PMC 1579824. PMID 15861005.
Copeland KF (2006). „Modulation of HIV-1 transcription by cytokines and chemokines.”. Mini reviews in medicinal chemistry 5 (12): 1093–101. DOI:10.2174/138955705774933383. PMID 16375755.
Elewaut D, Ware CF (2007). „The unconventional role of LT alpha beta in T cell differentiation.”. Trends Immunol. 28 (4): 169–75. DOI:10.1016/j.it.2007.02.005. PMID 17336158.

Povezano

Limfotoksin

Ćelijska komunikacija: Citokini

Po familiji

Interleukin

IL-1 superfamilija	1 (1Ra) • 18 • 33
poput IL-6/gp130 koristeći	6 • 11 • 27 • 30 • 31 (+ne IL Onkostatin M, Inhibitorni faktor leukemije, Cilijarni neurotrofni faktor, Kardiotrofin 1)
IL-10 familija	10 • 19 • 20 • 22 • 24 • 26
Interferon tip III	28 • 29
Zajednički γ-lanac familija	2/15 • 3 • 4 • 7 • 9 • 13 • 21
IL-12 familija	12 (B) • 23 • 27 • 35
Drugi	5 • 8 • 14 • 16 • 17/25 (A) • 32 • 34

Hemokini

CCL	1 • 2 • 3 • 4 • 5 • 6 • 7 • 8 • 9 • 10 • 11 • 12 • 13 • 14 • 15 • 16 • 17 • 18 • 19 • 20 • 21 • 22 • 23 • 24 • 25 • 26 • 27 • 28
CXCL	1 • 2 • 3 • 4 • 5 • 6 • 7 • 8 • 9 • 10 • 11 • 12 • 13 • 14 • 15 • 16 • 17
CX3CL	1
XCL	1 • 2

TNF

Glavni	TNF-alfa
TNF (ligand) superfamilija	4-1BB ligand • Faktor aktivacije B-ćelija • FAS ligand • Limfotoksin • OX40L • RANKL • TRAIL
Klaster diferencijacije	CD70 • CD153 • CD154

Interferon

I	alfa ( Pegilirani 2a, Pegilirani 2b), beta (1a, 1b)
II	Gama
III	IL-28 • IL-29

Drugi

Monokin • Limfokin (Limfotoksin, Faktor transfera) • Faktor rasta • Hematopoeza (Faktor stem ćelija, Faktor stimulacije kolonije) • Faktor autokrinog motiliteta • Osteopontin

Po funkciji

proinflamatorni citokin (IL-1, TNF-alfa) • T_h1 (INF-gama i TNF-beta) • T_h2 (IL-4, IL-5, IL-6, IL-10, IL-13) • T_h17 (IL-17,IL-22)

B trdu: peptidi (nrpl/grfl/cytl/horl), receptori (lgic, enzr, gprc, igsr, intg, nrpr/grfr/cytr), itra (adap, gbpr, mapk), calc, lipd, signalni putevi (hedp, wntp, tgfp+mapp, notp, jakp, fsap, hipp, tlrp)

PDB Galerija