RAP1B

RAP1B, član RAS familije onkogena
PDB prikaz baziran na 1c1y​.
Dostupne strukture
3BRW​, 3CF6
Identifikatori
Simboli RAP1B; K-REV; RAL1B
Vanjski ID OMIM: 179530 MGI: 894315 HomoloGene: 68719 GeneCards: RAP1B Gene
Ontologija gena
Molekularna funkcija vezivanje nukleotida
aktivnost GTPaze
proteinsko vezivanje
GTP vezivanje
GDP vezivanje
Celularna komponenta intracelularni
citoplazma
citosol
ćelijska membrana
međućelijski spoj
membrana
Biološki proces metabolički proces energijske rezerve
GTP katabolički proces
prenos signala
prenos signala posredovan malim GTPazama
koagulacija krvi
ćelijska proliferacija
aktivacija trombocita
metabolički proces malih molekula
regulacija sekrecije insulina
regulacija uspostavljanja ćelijske polarnosti
Ortolozi
Vrsta Čovek Miš
Entrez 5908 215449
Ensembl ENSG00000127314 ENSMUSG00000052681
UniProt P61224 Q99JI6
RefSeq (mRNA) NM_001010942.2 NM_024457.2
RefSeq (protein) NP_001010942.1 NP_077777.1
Lokacija (UCSC) Chr 12:
69 - 69.05 Mb
Chr 10:
117.25 - 117.28 Mb
PubMed pretraga [1] [2]

Ras srodni protein Rap-1b, takođe poznat kao GTP vezujući protein smg p21B, je protein koji je kod ljudi kodiran RAP1B genom.[1][2][3][4]

Reference

  1. ^ „Entrez Gene: RAP1B”. 
  2. ^ Pizon V, Lerosey I, Chardin P, Tavitian A (1988). „Nucleotide sequence of a human cDNA encoding a ras-related protein (rap1B)”. Nucleic Acids Res. 16 (15): 7719. PMC 338441 Слободан приступ. PMID 3137530. doi:10.1093/nar/16.15.7719. 
  3. ^ Matsui Y, Kikuchi A, Kawata M, Kondo J, Teranishi Y, Takai Y (1990). „Molecular cloning of smg p21B and identification of smg p21 purified from bovine brain and human platelets as smg p21B”. Biochem. Biophys. Res. Commun. 166 (2): 1010—6. PMID 2105724. doi:10.1016/0006-291X(90)90911-6. 
  4. ^ Rousseau-Merck MF, Pizon V, Tavitian A, Berger R (1990). „Chromosome mapping of the human RAS-related RAP1A, RAP1B, and RAP2 genes to chromosomes 1p12----p13, 12q14, and 13q34, respectively”. Cytogenet. Cell Genet. 53 (1): 2—4. PMID 2108841. 

Literatura

  • Rehmann H; Arias-Palomo E; Hadders MA; et al. (2008). „Structure of Epac2 in complex with a cyclic AMP analogue and RAP1B.”. Nature. 455 (7209): 124—7. PMID 18660803. doi:10.1038/nature07187. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Gyan E; Frew M; Bowen D; et al. (2005). „Mutation in RAP1 is a rare event in myelodysplastic syndromes.”. Leukemia. 19 (9): 1678—80. PMID 16118622. doi:10.1038/sj.leu.2403882. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Schwamborn JC, Müller M, Becker AH, Püschel AW (2007). „Ubiquitination of the GTPase Rap1B by the ubiquitin ligase Smurf2 is required for the establishment of neuronal polarity.”. EMBO J. 26 (5): 1410—22. PMID 17318188. doi:10.1038/sj.emboj.7601580. 
  • Carmona G; Göttig S; Orlandi A; et al. (2009). „Role of the small GTPase Rap1 for integrin activity regulation in endothelial cells and angiogenesis.”. Blood. 113 (2): 488—97. PMID 18805968. doi:10.1182/blood-2008-02-138438. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Shattil SJ (2005). „Integrins and Src: dynamic duo of adhesion signaling.”. Trends Cell Biol. 15 (8): 399—403. PMID 16005629. doi:10.1016/j.tcb.2005.06.005. 
  • Malchinkhuu E; Sato K; Maehama T; et al. (2009). „Role of Rap1B and tumor suppressor PTEN in the negative regulation of lysophosphatidic acid--induced migration by isoproterenol in glioma cells.”. Mol. Biol. Cell. 20 (24): 5156—65. PMID 19864456. doi:10.1091/mbc.E09-08-0692. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Daumke O; Weyand M; Chakrabarti PP; et al. (2004). „The GTPase-activating protein Rap1GAP uses a catalytic asparagine.”. Nature. 429 (6988): 197—201. PMID 15141215. doi:10.1038/nature02505. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Gerhard DS; Wagner L; Feingold EA; et al. (2004). „The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).”. Genome Res. 14 (10B): 2121—7. PMC 528928 Слободан приступ. PMID 15489334. doi:10.1101/gr.2596504. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Edreira MM; Li S; Hochbaum D; et al. (2009). „Phosphorylation-induced conformational changes in Rap1b: allosteric effects on switch domains and effector loop.”. J. Biol. Chem. 284 (40): 27480—6. PMID 19651783. doi:10.1074/jbc.M109.011312. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Scrima A, Thomas C, Deaconescu D, Wittinghofer A (2008). „The Rap-RapGAP complex: GTP hydrolysis without catalytic glutamine and arginine residues.”. EMBO J. 27 (7): 1145—53. PMID 18309292. doi:10.1038/emboj.2008.30. 
  • Mehrle A; Rosenfelder H; Schupp I; et al. (2006). „The LIFEdb database in 2006.”. Nucleic Acids Res. 34 (Database issue): D415—8. PMC 1347501 Слободан приступ. PMID 16381901. doi:10.1093/nar/gkj139. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Canobbio I; Trionfini P; Guidetti GF; et al. (2008). „Targeting of the small GTPase Rap2b, but not Rap1b, to lipid rafts is promoted by palmitoylation at Cys176 and Cys177 and is required for efficient protein activation in human platelets.”. Cell. Signal. 20 (9): 1662—70. PMID 18582561. doi:10.1016/j.cellsig.2008.05.016. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Bernardi B; Guidetti GF; Campus F; et al. (2006). „The small GTPase Rap1b regulates the cross talk between platelet integrin alpha2beta1 and integrin alphaIIbbeta3.”. Blood. 107 (7): 2728—35. PMID 16357324. doi:10.1182/blood-2005-07-3023. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Matsuse M; Mitsutake N; Rogounovitch T; et al. (2009). „Mutation analysis of RAP1 gene in papillary thyroid carcinomas.”. Endocr. J. 56 (1): 161—4. PMID 18948674. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Wiemann S; Arlt D; Huber W; et al. (2004). „From ORFeome to biology: a functional genomics pipeline.”. Genome Res. 14 (10B): 2136—44. PMC 528930 Слободан приступ. PMID 15489336. doi:10.1101/gr.2576704. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Li YH, Werner H, Püschel AW (2008). „Rheb and mTOR regulate neuronal polarity through Rap1B.”. J. Biol. Chem. 283 (48): 33784—92. PMID 18842593. doi:10.1074/jbc.M802431200. 
  • Lova P; Campus F; Lombardi R; et al. (2004). „Contribution of protease-activated receptors 1 and 4 and glycoprotein Ib-IX-V in the G(i)-independent activation of platelet Rap1B by thrombin.”. J. Biol. Chem. 279 (24): 25299—306. PMID 15078882. doi:10.1074/jbc.M313199200. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Yan J, Li F, Ingram DA, Quilliam LA (2008). „Rap1a is a key regulator of fibroblast growth factor 2-induced angiogenesis and together with Rap1b controls human endothelial cell functions.”. Mol. Cell. Biol. 28 (18): 5803—10. PMID 18625726. doi:10.1128/MCB.00393-08. 
  • Campus F; Lova P; Bertoni A; et al. (2005). „Thrombopoietin complements G(i)- but not G(q)-dependent pathways for integrin {alpha}(IIb){beta}(3) activation and platelet aggregation.”. J. Biol. Chem. 280 (26): 24386—95. PMID 15863506. doi:10.1074/jbc.M501174200. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Defilippi P, Di Stefano P, Cabodi S (2006). „p130Cas: a versatile scaffold in signaling networks.”. Trends Cell Biol. 16 (5): 257—63. PMID 16581250. doi:10.1016/j.tcb.2006.03.003. 
  • п
  • р
  • у
PDB Galerija
  • 1c1y​: Kristalna struktura RAP.GMPPNP u kompleksu sa Ras vezujućim domenom C-Raf1 kinaze (RAFRBD).
    1c1y: Kristalna struktura RAP.GMPPNP u kompleksu sa Ras vezujućim domenom C-Raf1 kinaze (RAFRBD).
  • 1gua​: Ljudski RAP1A, ostaci 1-167, dvostruki mutant (E30D,K31E) u kompleksu sa GPPNHP i RAS vezujućim domenom ljudskog C-RAF1, ostaci 51-131
    1gua: Ljudski RAP1A, ostaci 1-167, dvostruki mutant (E30D,K31E) u kompleksu sa GPPNHP i RAS vezujućim domenom ljudskog C-RAF1, ostaci 51-131
  • 3brw​: Struktura Rap-RapGAP kompleksa
    3brw: Struktura Rap-RapGAP kompleksa
  • 3cf6​: Struktura Epac2 u kompleksu sa cikličnim AMP i Rap
    3cf6: Struktura Epac2 u kompleksu sa cikličnim AMP i Rap