Аполіпротеїн D |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2HZQ, 2HZR | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | APOD, Apod, apolipoprotein D |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 107740 MGI: 88056 HomoloGene: 1246 GeneCards: APOD |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • lipid transporter activity • transporter activity • cholesterol binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • small molecule binding • lipid binding |
---|
Клітинна компонента | • cytosolic ribosome • внутрішньоклітинний • neuronal cell body • дендрит (нейробіологія) • ендоплазматичний ретикулум • perinuclear region of cytoplasm • екзосома • міжклітинний простір • extracellular region • цитоплазма |
---|
Біологічний процес | • negative regulation of T cell migration • negative regulation of platelet-derived growth factor receptor signaling pathway • negative regulation of monocyte chemotactic protein-1 production • negative regulation of smooth muscle cell proliferation • tissue regeneration • lipid metabolism • GO:0001315 response to reactive oxygen species • negative regulation of smooth muscle cell-matrix adhesion • GO:0010260 старіння людини • negative regulation of lipoprotein lipid oxidation • brain development • peripheral nervous system axon regeneration • response to axon injury • Ангіогенез • glucose metabolic process • negative regulation of focal adhesion assembly • negative regulation of protein import into nucleus • negative regulation of cytokine production involved in inflammatory response • lipid transport • GO:0015915 транспорт |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_001301353 NM_001301354 NM_007470 |
|
---|
RefSeq (білок) | | | NP_001288282 NP_001288283 NP_031496 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 3: 195.57 – 195.58 Mb | Хр. 16: 31.12 – 31.13 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
Аполіпротеїн D (англ. Apolipoprotein D) – білок, який кодується геном APOD, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 189 амінокислот, а молекулярна маса — 21 276[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MVMLLLLLSA | | LAGLFGAAEG | | QAFHLGKCPN | | PPVQENFDVN | | KYLGRWYEIE |
KIPTTFENGR | | CIQANYSLME | | NGKIKVLNQE | | LRADGTVNQI | | EGEATPVNLT |
EPAKLEVKFS | | WFMPSAPYWI | | LATDYENYAL | | VYSCTCIIQL | | FHVDFAWILA |
RNPNLPPETV | | DSLKNILTSN | | NIDVKKMTVT | | DQVNCPKLS |
Задіяний у такому біологічному процесі як транспорт. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Секретований назовні.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Holzfeind P., Merschak P., Dieplinger H., Redl B. (1995). The human lacrimal gland synthesizes apolipoprotein D mRNA in addition to tear prealbumin mRNA, both species encoding members of the lipocalin superfamily. Exp. Eye Res. 61: 495—500. PMID 8549691 DOI:10.1016/S0014-4835(05)80145-9
- Balbin M., Freije J.M.P., Fueyo A., Sanchez L.M., Lopez-Otin C. (1990). Apolipoprotein D is the major protein component in cyst fluid from women with human breast gross cystic disease. Biochem. J. 271: 803—807. PMID 2244881 DOI:10.1042/bj2710803
- Bunkenborg J., Pilch B.J., Podtelejnikov A.V., Wisniewski J.R. (2004). Screening for N-glycosylated proteins by liquid chromatography mass spectrometry. Proteomics. 4: 454—465. PMID 14760718 DOI:10.1002/pmic.200300556
- Halim A., Nilsson J., Ruetschi U., Hesse C., Larson G. (2011). Human urinary glycoproteomics; attachment site specific analysis of N-and O-linked glycosylations by CID and ECD. Mol. Cell. Proteomics: —. PMID 22171320 DOI:10.1074/mcp.M111.013649
- Schindler P.A., Settineri C.A., Collet X., Fielding C.J., Burlingame A.L. (1995). Site-specific detection and structural characterization of the glycosylation of human plasma proteins lecithin:cholesterol acyltransferase and apolipoprotein D using HPLC/electrospray mass spectrometry and sequential glycosidase digestion. Protein Sci. 4: 791—803. PMID 7613477 DOI:10.1002/pro.5560040419
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:612 (англ.) . Процитовано 30 січня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, P05090 (англ.) . Архів оригіналу за 5 лютого 2017. Процитовано 30 січня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |