ABAT

ABAT
Ідентифікатори
Символи ABAT, Abat, 9630038C02Rik, AI255750, ENSMUSG00000051226, Gabaat, Gabat, Gm9851, I54, Laibat, X61497, GABA-AT, NPD009, 4-aminobutyrate aminotransferase
Зовнішні ІД OMIM: 137150 MGI: 2443582 HomoloGene: 542 GeneCards: ABAT
шифр КФ 2.6.1.22
Пов'язані генетичні захворювання
GABA aminotransferase deficiency[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• transferase activity
• 4-aminobutyrate transaminase activity
• protein homodimerization activity
• transaminase activity
• iron-sulfur cluster binding
• зв'язування з іоном металу
• succinate-semialdehyde dehydrogenase binding
• каталітична активність
• (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase activity
• pyridoxal phosphate binding
• 4-aminobutyrate:2-oxoglutarate transaminase activity

Клітинна компонента

• 4-aminobutyrate transaminase complex
• мітохондріальний матрикс
• neuron projection
• мітохондрія

Біологічний процес

• positive regulation of dopamine metabolic process
• positive regulation of aspartate secretion
• response to cocaine
• gamma-aminobutyric acid biosynthetic process
• response to hypoxia
• locomotory behavior
• behavioral response to cocaine
• negative regulation of blood pressure
• positive regulation of inhibitory postsynaptic potential
• response to nicotine
• GO:0010260 старіння людини
• gamma-aminobutyric acid metabolic process
• negative regulation of platelet aggregation
• cerebellum development
• копуляція
• neurotransmitter catabolic process
• response to iron ion
• negative regulation of gamma-aminobutyric acid secretion
• exploration behavior
• positive regulation of heat generation
• negative regulation of dopamine secretion
• response to ethanol
• positive regulation of uterine smooth muscle contraction
• positive regulation of insulin secretion
• positive regulation of prolactin secretion
• gamma-aminobutyric acid catabolic process

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
18
268860
Ensembl
ENSG00000183044
ENSMUSG00000057880
UniProt
P80404
P61922
RefSeq (мРНК)
NM_000663
NM_001127448
NM_020686
NM_001170978
NM_172961
RefSeq (білок)
NP_000654
NP_001120920
NP_065737
NP_001164449
NP_766549
Локус (UCSC) Хр. 16: 8.67 – 8.78 Mb Хр. 16: 8.33 – 8.44 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ABAT (англ. 4-aminobutyrate aminotransferase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 500 амінокислот, а молекулярна маса — 56 439[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MASMLLAQRLACSFQHSYRLLVPGSRHISQAAAKVDVEFDYDGPLMKTEV
PGPRSQELMKQLNIIQNAEAVHFFCNYEESRGNYLVDVDGNRMLDLYSQI
SSVPIGYSHPALLKLIQQPQNASMFVNRPALGILPPENFVEKLRQSLLSV
APKGMSQLITMACGSCSNENALKTIFMWYRSKERGQRGFSQEELETCMIN
QAPGCPDYSILSFMGAFHGRTMGCLATTHSKAIHKIDIPSFDWPIAPFPR
LKYPLEEFVKENQQEEARCLEEVEDLIVKYRKKKKTVAGIIVEPIQSEGG
DNHASDDFFRKLRDIARKHGCAFLVDEVQTGGGCTGKFWAHEHWGLDDPA
DVMTFSKKMMTGGFFHKEEFRPNAPYRIFNTWLGDPSKNLLLAEVINIIK
REDLLNNAAHAGKALLTGLLDLQARYPQFISRVRGRGTFCSFDTPDDSIR
NKLILIARNKGVVLGGCGDKSIRFRPTLVFRDHHAHLFLNIFSDILADFK

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, амінотрансфераз. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза, піридоксаль-фосфатом, залізо-сірчаною групою. Локалізований у мітохондрії.

Література

  • Osei Y.D., Churchich J.E. (1995). Screening and sequence determination of a cDNA encoding the human brain 4-aminobutyrate aminotransferase. Gene. 155: 185—187. PMID 7721088 DOI:10.1016/0378-1119(94)00858-P
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • de Biase D., Barra D., Simmaco M., John R.A., Bossa F. (1995). Primary structure and tissue distribution of human 4-aminobutyrate aminotransferase. Eur. J. Biochem. 227: 476—480. PMID 7851425 DOI:10.1111/j.1432-1033.1995.tb20412.x

Примітки

  1. ↑ Захворювання, генетично пов'язані з ABAT переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Human PubMed Reference:.
  3. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  4. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:23 (англ.) . Архів оригіналу за 15 червня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
  5. ↑ UniProt, P80404 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 16
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.