ABCA9 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | ABCA9, EST640918, ATP binding cassette subfamily A member 9 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 612507 MGI: 2386796 HomoloGene: 33332 GeneCards: ABCA9 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nucleotide binding • ATPase activity • ATP binding • ATPase-coupled transmembrane transporter activity • lipid transporter activity |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • мембрана • внутрішньоклітинна мембранна органела |
---|
Біологічний процес | • lipid transport • трансмембранний транспорт |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 17: 68.97 – 69.06 Mb | Хр. 11: 109.99 – 110.06 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ABCA9 (англ. ATP binding cassette subfamily A member 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 624 амінокислот, а молекулярна маса — 184 362[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSKRRMSVGQ | | QTWALLCKNC | | LKKWRMKRQT | | LLEWLFSFLL | | VLFLYLFFSN |
LHQVHDTPQM | | SSMDLGRVDS | | FNDTNYVIAF | | APESKTTQEI | | MNKVASAPFL |
KGRTIMGWPD | | EKSMDELDLN | | YSIDAVRVIF | | TDTFSYHLKF | | SWGHRIPMMK |
EHRDHSAHCQ | | AVNEKMKCEG | | SEFWEKGFVA | | FQAAINAAII | | EIATNHSVME |
QLMSVTGVHM | | KILPFVAQGG | | VATDFFIFFC | | IISFSTFIYY | | VSVNVTQERQ |
YITSLMTMMG | | LRESAFWLSW | | GLMYAGFILI | | MATLMALIVK | | SAQIVVLTGF |
VMVFTLFLLY | | GLSLITLAFL | | MSVLIKKPFL | | TGLVVFLLIV | | FWGILGFPAL |
YTRLPAFLEW | | TLCLLSPFAF | | TVGMAQLIHL | | DYDVNSNAHL | | DSSQNPYLII |
ATLFMLVFDT | | LLYLVLTLYF | | DKILPAEYGH | | RCSPLFFLKS | | CFWFQHGRAN |
HVVLENETDS | | DPTPNDCFEP | | VSPEFCGKEA | | IRIKNLKKEY | | AGKCERVEAL |
KGVVFDIYEG | | QITALLGHSG | | AGKTTLLNIL | | SGLSVPTSGS | | VTVYNHTLSR |
MADIENISKF | | TGFCPQSNVQ | | FGFLTVKENL | | RLFAKIKGIL | | PHEVEKEVQR |
VVQELEMENI | | QDILAQNLSG | | GQNRKLTFGI | | AILGDPQVLL | | LDEPTAGLDP |
LSRHRIWNLL | | KEGKSDRVIL | | FSTQFIDEAD | | ILADRKVFIS | | NGKLKCAGSS |
LFLKKKWGIG | | YHLSLHLNER | | CDPESITSLV | | KQHISDAKLT | | AQSEEKLVYI |
LPLERTNKFP | | ELYRDLDRCS | | NQGIEDYGVS | | ITTLNEVFLK | | LEGKSTIDES |
DIGIWGQLQT | | DGAKDIGSLV | | ELEQVLSSFH | | ETRKTISGVA | | LWRQQVCAIA |
KVRFLKLKKE | | RKSLWTILLL | | FGISFIPQLL | | EHLFYESYQK | | SYPWELSPNT |
YFLSPGQQPQ | | DPLTHLLVIN | | KTGSTIDNFL | | HSLRRQNIAI | | EVDAFGTRNG |
TDDPSYNGAI | | IVSGDEKDHR | | FSIACNTKRL | | NCFPVLLDVI | | SNGLLGIFNS |
SEHIQTDRST | | FFEEHMDYEY | | GYRSNTFFWI | | PMAASFTPYI | | AMSSIGDYKK |
KAHSQLRISG | | LYPSAYWFGQ | | ALVDVSLYFL | | ILLLMQIMDY | | IFSPEEIIFI |
IQNLLIQILC | | SIGYVSSLVF | | LTYVISFIFR | | NGRKNSGIWS | | FFFLIVVIFS |
IVATDLNEYG | | FLGLFFGTML | | IPPFTLIGSL | | FIFSEISPDS | | MDYLGASESE |
IVYLALLIPY | | LHFLIFLFIL | | RCLEMNCRKK | | LMRKDPVFRI | | SPRSNAIFPN |
PEEPEGEEED | | IQMERMRTVN | | AMAVRDFDET | | PVIIASCLRK | | EYAGKKKNCF |
SKRKKKIATR | | NVSFCVKKGE | | VIGLLGHNGA | | GKSTTIKMIT | | GDTKPTAGQV |
ILKGSGGGEP | | LGFLGYCPQE | | NALWPNLTVR | | QHLEVYAAVK | | GLRKGDAMIA |
ITRLVDALKL | | QDQLKAPVKT | | LSEGIKRKLC | | FVLSILGNPS | | VVLLDEPSTG |
MDPEGQQQMW | | QVIRATFRNT | | ERGALLTTHY | | MAEAEAVCDR | | VAIMVSGRLR |
CIGSIQHLKS | | KFGKDYLLEM | | KLKNLAQMEP | | LHAEILRLFP | | QAAQQERFSS |
LMVYKLPVED | | VRPLSQAFFK | | LEIVKQSFDL | | EEYSLSQSTL | | EQVFLELSKE |
QELGDLEEDF | | DPSVKWKLLL | | QEEP |
Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у мембрані.
Література
- Piehler A., Kaminski W.E., Wenzel J.J., Langmann T., Schmitz G. (2002). Molecular structure of a novel cholesterol-responsive A subclass ABC transporter, ABCA9. Biochem. Biophys. Res. Commun. 295: 408—416. PMID 12150964 DOI:10.1016/S0006-291X(02)00659-9
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:39 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q8IUA7 (англ.) . Архів оригіналу за 9 лютого 2018. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |