AKAP8L

Ідентифікатори

Символи

AKAP8L, HA95, HAP95, NAKAP, NAKAP95, A-kinase anchoring protein 8 like

Зовнішні ІД

OMIM: 609475 MGI: 1860606 HomoloGene: 8658 GeneCards: AKAP8L

Реагує на сполуку

Viroporin 3a^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу • lamin binding • histone deacetylase binding • DEAD/H-box RNA helicase binding • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • protein kinase A regulatory subunit binding
Клітинна компонента	• nuclear matrix • Хроматин • nuclear speck • PML body • клітинне ядро • цитоплазма • Рибонуклеопротеїни
Біологічний процес	• positive regulation of histone deacetylation • nuclear membrane disassembly • regulation of mRNA export from nucleus • mitotic chromosome condensation • cell cycle G2/M phase transition • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • Сплайсинг РНК • mRNA processing
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


26993


54194

Ensembl


ENSG00000011243


ENSMUSG00000002625

UniProt


Q9ULX6


Q9R0L7

RefSeq (мРНК)


NM_001291478 NM_014371


NM_017476

RefSeq (білок)


NP_001278407 NP_055186


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 19: 15.38 – 15.42 Mb

Хр. 17: 32.32 – 32.35 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

AKAP8L (англ. A-kinase anchoring protein 8 like) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 646 амінокислот, а молекулярна маса — 71 649^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSYTGFVQGS	ETTLQSTYSD	TSAQPTCDYG	YGTWNSGTNR	GYEGYGYGYG
YGQDNTTNYG	YGMATSHSWE	MPSSDTNANT	SASGSASADS	VLSRINQRLD
MVPHLETDMM	QGGVYGSGGE	RYDSYESCDS	RAVLSERDLY	RSGYDYSELD
PEMEMAYEGQ	YDAYRDQFRM	RGNDTFGPRA	QGWARDARSG	RPMASGYGRM
WEDPMGARGQ	CMSGASRLPS	LFSQNIIPEY	GMFQGMRGGG	AFPGGSRFGF
GFGNGMKQMR	RTWKTWTTAD	FRTKKKKRKQ	GGSPDEPDSK	ATRTDCSDNS
DSDNDEGTEG	EATEGLEGTE	AVEKGSRVDG	EDEEGKEDGR	EEGKEDPEKG
ALTTQDENGQ	TKRKLQAGKK	SQDKQKKRQR	DRMVERIQFV	CSLCKYRTFY
EDEMASHLDS	KFHKEHFKYV	GTKLPKQTAD	FLQEYVTNKT	KKTEELRKTV
EDLDGLIHQI	YRDQDLTQEI	AMEHFVKKVE	AAHCAACDLF	IPMQFGIIQK
HLKTMDHNRN	RRLMMEQSKK	SSLMVARSIL	NNKLISKKLE	RYLKGENPFT
DSPEEEKEQE	EAEGGALDEG	AQGEAAGISE	GAEGVPAQPP	VPPEPAPGAV
SPPPPPPPEE	EEEGAVPLLG	GALQRQIRGI	PGLDVEDDEE	GGGGAP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Westberg C., Yang J.-P., Tang H., Reddy T.R., Wong-Staal F. (2000). A novel shuttle protein binds to RNA helicase A and activates the retroviral constitutive transport element. J. Biol. Chem. 275: 21396—21401. PMID 10748171 DOI:10.1074/jbc.M909887199
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Yang J.P., Tang H., Reddy T.R., Wong-Staal F. (2001). Mapping the functional domains of HAP95, a protein that binds RNA helicase A and activates the constitutive transport element of type D retroviruses. J. Biol. Chem. 276: 30694—30700. PMID 11402034 DOI:10.1074/jbc.M102809200
Martins S., Eikvar S., Furukawa K., Collas P. (2003). HA95 and LAP2 beta mediate a novel chromatin-nuclear envelope interaction implicated in initiation of DNA replication. J. Cell Biol. 160: 177—188. PMID 12538639 DOI:10.1083/jcb.200210026
Martins S.B., Marstad A., Collas P. (2003). In vitro modulation of the interaction between HA95 and LAP2beta by cAMP signaling. Biochemistry. 42: 10456—10461. PMID 12950172 DOI:10.1021/bi0350699
Sayer J.A., Manczak M., Akileswaran L., Reddy P.H., Coghlan V.M. (2005). Interaction of the nuclear matrix protein NAKAP with HypA and huntingtin: implications for nuclear toxicity in Huntington's disease pathogenesis. NeuroMolecular Med. 7: 297—310. PMID 16391387 DOI:10.1385/NMM:7:4:297

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з A-kinase anchoring protein 8 like переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29857 (англ.) . Архів оригіналу за 28 травня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9ULX6 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.