ANKRD27

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4B93, 4CYM, 4CZ2

Ідентифікатори

Символи

ANKRD27, VARP, PP12899, ankyrin repeat domain 27

Зовнішні ІД

MGI: 2444103 HomoloGene: 12956 GeneCards: ANKRD27

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • guanyl-nucleotide exchange factor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • SNARE binding
Клітинна компонента	• ендосома • late endosome • мембрана • Меланосома • клітинна мембрана • transport vesicle • tubular endosome • early endosome • лізосома • cytoplasmic vesicle membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • гіалоплазма • neuron projection
Біологічний процес	• negative regulation of SNARE complex assembly • early endosome to late endosome transport • positive regulation of dendrite morphogenesis • endosome to melanosome transport • protein transport • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • neuron projection morphogenesis • GO:0015915 транспорт • regulation of molecular function • positive regulation of neuron projection development
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


84079


245886

Ensembl


ENSG00000105186


ENSMUSG00000034867

UniProt


Q96NW4


Q3UMR0

RefSeq (мРНК)


NM_032139


NM_145633 NM_178263 NM_001358876

RefSeq (білок)


NP_115515


NP_663608 NP_839994 NP_001345805

Локус (UCSC)

Хр. 19: 32.6 – 32.68 Mb

Хр. 7: 35.29 – 35.34 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ANKRD27 (англ. Ankyrin repeat domain 27) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 050 амінокислот, а молекулярна маса — 116 984^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MALYDEDLLK	NPFYLALQKC	RPDLCSKVAQ	IHGIVLVPCK	GSLSSSIQST
CQFESYILIP	VEEHFQTLNG	KDVFIQGNRI	KLGAGFACLL	SVPILFEETF
YNEKEESFSI	LCIAHPLEKR	ESSEEPLAPS	DPFSLKTIED	VREFLGRHSE
RFDRNIASFH	RTFRECERKS	LRHHIDSANA	LYTKCLQQLL	RDSHLKMLAK
QEAQMNLMKQ	AVEIYVHHEI	YNLIFKYVGT	MEASEDAAFN	KITRSLQDLQ
QKDIGVKPEF	SFNIPRAKRE	LAQLNKCTSP	QQKLVCLRKV	VQLITQSPSQ
RVNLETMCAD	DLLSVLLYLL	VKTEIPNWMA	NLSYIKNFRF	SSLAKDELGY
CLTSFEAAIE	YIRQGSLSAK	PPESEGFGDR	LFLKQRMSLL	SQMTSSPTDC
LFKHIASGNQ	KEVERLLSQE	DHDKDTVQKM	CHPLCFCDDC	EKLVSGRLND
PSVVTPFSRD	DRGHTPLHVA	AVCGQASLID	LLVSKGAMVN	ATDYHGATPL
HLACQKGYQS	VTLLLLHYKA	SAEVQDNNGN	TPLHLACTYG	HEDCVKALVY
YDVESCRLDI	GNEKGDTPLH	IAARWGYQGV	IETLLQNGAS	TEIQNRLKET
PLKCALNSKI	LSVMEAYHLS	FERRQKSSEA	PVQSPQRSVD	SISQESSTSS
FSSMSASSRQ	EETKKDYREV	EKLLRAVADG	DLEMVRYLLE	WTEEDLEDAE
DTVSAADPEF	CHPLCQCPKC	APAQKRLAKV	PASGLGVNVT	SQDGSSPLHV
AALHGRADLI	PLLLKHGANA	GARNADQAVP	LHLACQQGHF	QVVKCLLDSN
AKPNKKDLSG	NTPLIYACSG	GHHELVALLL	QHGASINASN	NKGNTALHEA
VIEKHVFVVE	LLLLHGASVQ	VLNKRQRTAV	DCAEQNSKIM	ELLQVVPSCV
ASLDDVAETD	RKEYVTVKIR	KKWNSKLYDL	PDEPFTRQFY	FVHSAGQFKG
KTSREIMARD	RSVPNLTEGS	LHEPGRQSVT	LRQNNLPAQS	GSHAAEKGNS
DWPERPGLTQ	TGPGHRRMLR	RHTVEDAVVS	QGPEAAGPLS	TPQEVSASRS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, цитоплазматичних везикулах, лізосомі, ендосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zhang X., He X., Fu X.-Y., Chang Z. (2006). Varp is a Rab21 guanine nucleotide exchange factor and regulates endosome dynamics. J. Cell Sci. 119: 1053—1062. PMID 16525121 DOI:10.1242/jcs.02810
Nottingham R.M., Ganley I.G., Barr F.A., Lambright D.G., Pfeffer S.R. (2011). RUTBC1 protein, a Rab9A effector that activates GTP hydrolysis by Rab32 and Rab33B proteins. J. Biol. Chem. 286: 33213—33222. PMID 21808068 DOI:10.1074/jbc.M111.261115

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25310 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q96NW4 (англ.) . Архів оригіналу за 9 квітня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.