ARHGAP45 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 3D25, 3FT3 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | ARHGAP45, HA-1, HLA-HA1, HMHA1, histocompatibility (minor) HA-1, Rho GTPase activating protein 45 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 601155 MGI: 1917969 HomoloGene: 69120 GeneCards: ARHGAP45 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity |
---|
Клітинна компонента | • гіалоплазма • extracellular region • secretory granule lumen • azurophil granule lumen • цитоплазма • клітинна мембрана • мембрана • ruffle membrane • cell projection |
---|
Біологічний процес | • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • GO:0007243 intracellular signal transduction • regulation of small GTPase mediated signal transduction • GO:0072468 сигнальна трансдукція • neutrophil degranulation |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/9/97/PBB_GE_HMHA1_217614_at_fs.png/250px-PBB_GE_HMHA1_217614_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/1/16/PBB_GE_HMHA1_212873_at_fs.png/250px-PBB_GE_HMHA1_212873_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001258328 NM_001282334 NM_001282335 NM_012292 NM_001321232 |
| | NM_001142701 NM_027521 NM_001347074 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001245257 NP_001269263 NP_001269264 NP_001308161 NP_036424 |
| | NP_001136173 NP_001334003 NP_081797 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 19: 1.07 – 1.09 Mb | Хр. 10: 79.85 – 79.87 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ARHGAP45 (англ. Rho GTPase activating protein 45) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 136 амінокислот, а молекулярна маса — 124 614[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MFSRKKRELM | | KTPSISKKNR | | AGSPSPQPSG | | ELPRKDGADA | | VFPGPSLEPP |
AGSSGVKATG | | TLKRPTSLSR | | HASAAGFPLS | | GAASWTLGRS | | HRSPLTAASP |
GELPTEGAGP | | DVVEDISHLL | | ADVARFAEGL | | EKLKECVLRD | | DLLEARRPRA |
HECLGEALRV | | MHQIISKYPL | | LNTVETLTAA | | GTLIAKVKAF | | HYESNNDLEK |
QEFEKALETI | | AVAFSSTVSE | | FLMGEVDSST | | LLAVPPGDSS | | QSMESLYGPG |
SEGTPPSLED | | CDAGCLPAEE | | VDVLLQRCEG | | GVDAALLYAK | | NMAKYMKDLI |
SYLEKRTTLE | | MEFAKGLQKI | | AHNCRQSVMQ | | EPHMPLLSIY | | SLALEQDLEF |
GHSMVQAVGT | | LQTQTFMQPL | | TLRRLEHEKR | | RKEIKEAWHR | | AQRKLQEAES |
NLRKAKQGYV | | QRCEDHDKAR | | FLVAKAEEEQ | | AGSAPGAGST | | ATKTLDKRRR |
LEEEAKNKAE | | EAMATYRTCV | | ADAKTQKQEL | | EDTKVTALRQ | | IQEVIRQSDQ |
TIKSATISYY | | QMMHMQTAPL | | PVHFQMLCES | | SKLYDPGQQY | | ASHVRQLQRD |
QEPDVHYDFE | | PHVSANAWSP | | VMRARKSSFN | | VSDVARPEAA | | GSPPEEGGCT |
EGTPAKDHRA | | GRGHQVHKSW | | PLSISDSDSG | | LDPGPGAGDF | | KKFERTSSSG |
TMSSTEELVD | | PDGGAGASAF | | EQADLNGMTP | | ELPVAVPSGP | | FRHEGLSKAA |
RTHRLRKLRT | | PAKCRECNSY | | VYFQGAECEE | | CCLACHKKCL | | ETLAIQCGHK |
KLQGRLQLFG | | QDFSHAARSA | | PDGVPFIVKK | | CVCEIERRAL | | RTKGIYRVNG |
VKTRVEKLCQ | | AFENGKELVE | | LSQASPHDIS | | NVLKLYLRQL | | PEPLISFRLY |
HELVGLAKDS | | LKAEAEAKAA | | SRGRQDGSES | | EAVAVALAGR | | LRELLRDLPP |
ENRASLQYLL | | RHLRRIVEVE | | QDNKMTPGNL | | GIVFGPTLLR | | PRPTEATVSL |
SSLVDYPHQA | | RVIETLIVHY | | GLVFEEEPEE | | TPGGQDESSN | | QRAEVVVQVP |
YLEAGEAVVY | | PLQEAAADGC | | RESRVVSNDS | | DSDLEEASEL | | LSSSEASALG |
HLSFLEQQQS | | EASLEVASGS | | HSGSEEQLEA | | TAREDGDGDE | | DGPAQQLSGF |
NTNQSNNVLQ | | APLPPMRLRG | | GRMTLGSCRE | | RQPEFV |
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних відростках.
Література
- Kaminski W.E., Piehler A., Schmitz G. (2000). Genomic organization of the human cholesterol-responsive ABC transporter ABCA7: tandem linkage with the minor histocompatibility antigen HA-1 gene. Biochem. Biophys. Res. Commun. 278: 782—789. PMID 11095984 DOI:10.1006/bbrc.2000.3880
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Graziano C., Giorgi M., Malentacchi C., Mattiuz P.L., Porfirio B. (2005). Sequence diversity within the HA-1 gene as detected by melting temperature assay without oligonucleotide probes. BMC Med. Genet. 6: 36—36. PMID 16202172 DOI:10.1186/1471-2350-6-36
- van Lochem E., van der Keur M., Mommaas A.M., de Gast G.C., Goulmy E. (1996). Functional expression of minor histocompatibility antigens on human peripheral blood dendritic cells and epidermal Langerhans cells. Transpl. Immunol. 4: 151—157. PMID 8843592 DOI:10.1016/S0966-3274(96)80009-8
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
- Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17102 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q92619 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |