ARID1A
ARID1A | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
![]() | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | ARID1A, B120, BAF250, BAF250a, BM029, C1orf4, ELD, MRD14, OSA1, P270, SMARCF1, hELD, hOSA1, CSS2, AT-rich interaction domain 1A | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 603024 MGI: 1935147 HomoloGene: 21216 GeneCards: ARID1A | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
Coffin-Siris syndrome 2, liver carcinoma[1] | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
![]() ![]() ![]() | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 1: 26.69 – 26.78 Mb | Хр. 4: 133.68 – 133.76 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | [2] | [3] | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
ARID1A (англ. AT-rich interaction domain 1A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 285 амінокислот, а молекулярна маса — 242 045[5].
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MAAQVAPAAA | SSLGNPPPPP | PSELKKAEQQ | QREEAGGEAA | AAAAAERGEM | ||||
KAAAGQESEG | PAVGPPQPLG | KELQDGAESN | GGGGGGGAGS | GGGPGAEPDL | ||||
KNSNGNAGPR | PALNNNLTEP | PGGGGGGSSD | GVGAPPHSAA | AALPPPAYGF | ||||
GQPYGRSPSA | VAAAAAAVFH | QQHGGQQSPG | LAALQSGGGG | GLEPYAGPQQ | ||||
NSHDHGFPNH | QYNSYYPNRS | AYPPPAPAYA | LSSPRGGTPG | SGAAAAAGSK | ||||
PPPSSSASAS | SSSSSFAQQR | FGAMGGGGPS | AAGGGTPQPT | ATPTLNQLLT | ||||
SPSSARGYQG | YPGGDYSGGP | QDGGAGKGPA | DMASQCWGAA | AAAAAAAAAS | ||||
GGAQQRSHHA | PMSPGSSGGG | GQPLARTPQP | SSPMDQMGKM | RPQPYGGTNP | ||||
YSQQQGPPSG | PQQGHGYPGQ | PYGSQTPQRY | PMTMQGRAQS | AMGGLSYTQQ | ||||
IPPYGQQGPS | GYGQQGQTPY | YNQQSPHPQQ | QQPPYSQQPP | SQTPHAQPSY | ||||
QQQPQSQPPQ | LQSSQPPYSQ | QPSQPPHQQS | PAPYPSQQST | TQQHPQSQPP | ||||
YSQPQAQSPY | QQQQPQQPAP | STLSQQAAYP | QPQSQQSQQT | AYSQQRFPPP | ||||
QELSQDSFGS | QASSAPSMTS | SKGGQEDMNL | SLQSRPSSLP | DLSGSIDDLP | ||||
MGTEGALSPG | VSTSGISSSQ | GEQSNPAQSP | FSPHTSPHLP | GIRGPSPSPV | ||||
GSPASVAQSR | SGPLSPAAVP | GNQMPPRPPS | GQSDSIMHPS | MNQSSIAQDR | ||||
GYMQRNPQMP | QYSSPQPGSA | LSPRQPSGGQ | IHTGMGSYQQ | NSMGSYGPQG | ||||
GQYGPQGGYP | RQPNYNALPN | ANYPSAGMAG | GINPMGAGGQ | MHGQPGIPPY | ||||
GTLPPGRMSH | ASMGNRPYGP | NMANMPPQVG | SGMCPPPGGM | NRKTQETAVA | ||||
MHVAANSIQN | RPPGYPNMNQ | GGMMGTGPPY | GQGINSMAGM | INPQGPPYSM | ||||
GGTMANNSAG | MAASPEMMGL | GDVKLTPATK | MNNKADGTPK | TESKSKKSSS | ||||
STTTNEKITK | LYELGGEPER | KMWVDRYLAF | TEEKAMGMTN | LPAVGRKPLD | ||||
LYRLYVSVKE | IGGLTQVNKN | KKWRELATNL | NVGTSSSAAS | SLKKQYIQCL | ||||
YAFECKIERG | EDPPPDIFAA | ADSKKSQPKI | QPPSPAGSGS | MQGPQTPQST | ||||
SSSMAEGGDL | KPPTPASTPH | SQIPPLPGMS | RSNSVGIQDA | FNDGSDSTFQ | ||||
KRNSMTPNPG | YQPSMNTSDM | MGRMSYEPNK | DPYGSMRKAP | GSDPFMSSGQ | ||||
GPNGGMGDPY | SRAAGPGLGN | VAMGPRQHYP | YGGPYDRVRT | EPGIGPEGNM | ||||
STGAPQPNLM | PSNPDSGMYS | PSRYPPQQQQ | QQQQRHDSYG | NQFSTQGTPS | ||||
GSPFPSQQTT | MYQQQQQNYK | RPMDGTYGPP | AKRHEGEMYS | VPYSTGQGQP | ||||
QQQQLPPAQP | QPASQQQAAQ | PSPQQDVYNQ | YGNAYPATAT | AATERRPAGG | ||||
PQNQFPFQFG | RDRVSAPPGT | NAQQNMPPQM | MGGPIQASAE | VAQQGTMWQG | ||||
RNDMTYNYAN | RQSTGSAPQG | PAYHGVNRTD | EMLHTDQRAN | HEGSWPSHGT | ||||
RQPPYGPSAP | VPPMTRPPPS | NYQPPPSMQN | HIPQVSSPAP | LPRPMENRTS | ||||
PSKSPFLHSG | MKMQKAGPPV | PASHIAPAPV | QPPMIRRDIT | FPPGSVEATQ | ||||
PVLKQRRRLT | MKDIGTPEAW | RVMMSLKSGL | LAESTWALDT | INILLYDDNS | ||||
IMTFNLSQLP | GLLELLVEYF | RRCLIEIFGI | LKEYEVGDPG | QRTLLDPGRF | ||||
SKVSSPAPME | GGEEEEELLG | PKLEEEEEEE | VVENDEEIAF | SGKDKPASEN | ||||
SEEKLISKFD | KLPVKIVQKN | DPFVVDCSDK | LGRVQEFDSG | LLHWRIGGGD | ||||
TTEHIQTHFE | SKTELLPSRP | HAPCPPAPRK | HVTTAEGTPG | TTDQEGPPPD | ||||
GPPEKRITAT | MDDMLSTRSS | TLTEDGAKSS | EAIKESSKFP | FGISPAQSHR | ||||
NIKILEDEPH | SKDETPLCTL | LDWQDSLAKR | CVCVSNTIRS | LSFVPGNDFE | ||||
MSKHPGLLLI | LGKLILLHHK | HPERKQAPLT | YEKEEEQDQG | VSCNKVEWWW | ||||
DCLEMLRENT | LVTLANISGQ | LDLSPYPESI | CLPVLDGLLH | WAVCPSAEAQ | ||||
DPFSTLGPNA | VLSPQRLVLE | TLSKLSIQDN | NVDLILATPP | FSRLEKLYST | ||||
MVRFLSDRKN | PVCREMAVVL | LANLAQGDSL | AARAIAVQKG | SIGNLLGFLE | ||||
DSLAATQFQQ | SQASLLHMQN | PPFEPTSVDM | MRRAARALLA | LAKVDENHSE | ||||
FTLYESRLLD | ISVSPLMNSL | VSQVICDVLF | LIGQS |
Кодований геном білок за функціями належить до регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, нейрогенез, поліморфізм, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Takeuchi T., Chen B.-K., Qiu Y., Sonobe H., Ohtsuki Y. (1997). Molecular cloning and expression of a novel human cDNA containing CAG repeats. Gene. 204: 71—77. PMID 9434167 DOI:10.1016/S0378-1119(97)00525-8
- Lemon B., Inouye C., King D.S., Tjian R. (2001). Selectivity of chromatin-remodelling cofactors for ligand-activated transcription. Nature. 414: 924—928. PMID 11780067 DOI:10.1038/414924a
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
- Martens J.A., Winston F. (2003). Recent advances in understanding chromatin remodeling by SWI/SNF complexes. Curr. Opin. Genet. Dev. 13: 136—142. PMID 12672490 DOI:10.1016/S0959-437X(03)00022-4
- Kim S., Zhang Z., Upchurch S., Isern N., Chen Y. (2004). Structure and DNA-binding sites of the SWI1 AT-rich interaction domain (ARID) suggest determinants for sequence-specific DNA recognition. J. Biol. Chem. 279: 16670—16676. PMID 14722072 DOI:10.1074/jbc.M312115200
- Hurlstone A.F., Olave I.A., Barker N., van Noort M., Clevers H. (2002). Cloning and characterization of hELD/OSA1, a novel BRG1 interacting protein. Biochem. J. 364: 255—264. PMID 11988099
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з ARID1A переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11110 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, O14497 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
- Хромосома 1
![]() | Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
|