ATG4D |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | ATG4D, APG4-D, APG4D, AUTL4, autophagy related 4D cysteine peptidase, HsAPG4D |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 611340 MGI: 2444308 HomoloGene: 13156 GeneCards: ATG4D |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type peptidase activity • hydrolase activity • cysteine-type endopeptidase activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • мітохондріальний матрикс • мітохондрія |
---|
Біологічний процес | • автофагія • protein transport • autophagy of nucleus • C-terminal protein lipidation • protein delipidation • autophagy of mitochondrion • autophagosome assembly • протеоліз • protein targeting to membrane • GO:0097285 апоптоз |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 19: 10.54 – 10.55 Mb | Хр. 9: 21.18 – 21.19 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ATG4D (англ. Autophagy related 4D cysteine peptidase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 474 амінокислот, а молекулярна маса — 52 922[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MNSVSPAAAQ | | YRSSSPEDAR | | RRPEARRPRG | | PRGPDPNGLG | | PSGASGPALG |
SPGAGPSEPD | | EVDKFKAKFL | | TAWNNVKYGW | | VVKSRTSFSK | | ISSIHLCGRR |
YRFEGEGDIQ | | RFQRDFVSRL | | WLTYRRDFPP | | LPGGCLTSDC | | GWGCMLRSGQ |
MMLAQGLLLH | | FLPRDWTWAE | | GMGLGPPELS | | GSASPSRYHG | | PARWMPPRWA |
QGAPELEQER | | RHRQIVSWFA | | DHPRAPFGLH | | RLVELGQSSG | | KKAGDWYGPS |
LVAHILRKAV | | ESCSDVTRLV | | VYVSQDCTVY | | KADVARLVAR | | PDPTAEWKSV |
VILVPVRLGG | | ETLNPVYVPC | | VKELLRCELC | | LGIMGGKPRH | | SLYFIGYQDD |
FLLYLDPHYC | | QPTVDVSQAD | | FPLESFHCTS | | PRKMAFAKMD | | PSCTVGFYAG |
DRKEFETLCS | | ELTRVLSSSS | | ATERYPMFTL | | AEGHAQDHSL | | DDLCSQLAQP |
TLRLPRTGRL | | LRAKRPSSED | | FVFL |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, транспорт, транспорт білків, убіквітинування білків, автофагія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мітохондрії.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Betin V.M., Lane J.D. (2009). Caspase cleavage of Atg4D stimulates GABARAP-L1 processing and triggers mitochondrial targeting and apoptosis. J. Cell Sci. 122: 2554—2566. PMID 19549685 DOI:10.1242/jcs.046250
- Betin V.M., MacVicar T.D., Parsons S.F., Anstee D.J., Lane J.D. (2012). A cryptic mitochondrial targeting motif in Atg4D links caspase cleavage with mitochondrial import and oxidative stress. Autophagy. 8: 664—676. PMID 22441018 DOI:10.4161/auto.19227
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20789 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q86TL0 (англ.) . Архів оригіналу за 28 квітня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |