ATG4D

Ідентифікатори

Символи

ATG4D, APG4-D, APG4D, AUTL4, autophagy related 4D cysteine peptidase, HsAPG4D

Зовнішні ІД

OMIM: 611340 MGI: 2444308 HomoloGene: 13156 GeneCards: ATG4D

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type peptidase activity • hydrolase activity • cysteine-type endopeptidase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • мітохондріальний матрикс • мітохондрія
Біологічний процес	• автофагія • protein transport • autophagy of nucleus • C-terminal protein lipidation • protein delipidation • autophagy of mitochondrion • autophagosome assembly • протеоліз • protein targeting to membrane • GO:0097285 апоптоз
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


84971


235040

Ensembl


ENSG00000130734


ENSMUSG00000002820

UniProt


Q86TL0


Q8BGV9

RefSeq (мРНК)


NM_001281504 NM_032885


NM_153583

RefSeq (білок)


NP_001268433 NP_116274


NP_705811

Локус (UCSC)

Хр. 19: 10.54 – 10.55 Mb

Хр. 9: 21.18 – 21.19 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ATG4D (англ. Autophagy related 4D cysteine peptidase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 474 амінокислот, а молекулярна маса — 52 922^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNSVSPAAAQ	YRSSSPEDAR	RRPEARRPRG	PRGPDPNGLG	PSGASGPALG
SPGAGPSEPD	EVDKFKAKFL	TAWNNVKYGW	VVKSRTSFSK	ISSIHLCGRR
YRFEGEGDIQ	RFQRDFVSRL	WLTYRRDFPP	LPGGCLTSDC	GWGCMLRSGQ
MMLAQGLLLH	FLPRDWTWAE	GMGLGPPELS	GSASPSRYHG	PARWMPPRWA
QGAPELEQER	RHRQIVSWFA	DHPRAPFGLH	RLVELGQSSG	KKAGDWYGPS
LVAHILRKAV	ESCSDVTRLV	VYVSQDCTVY	KADVARLVAR	PDPTAEWKSV
VILVPVRLGG	ETLNPVYVPC	VKELLRCELC	LGIMGGKPRH	SLYFIGYQDD
FLLYLDPHYC	QPTVDVSQAD	FPLESFHCTS	PRKMAFAKMD	PSCTVGFYAG
DRKEFETLCS	ELTRVLSSSS	ATERYPMFTL	AEGHAQDHSL	DDLCSQLAQP
TLRLPRTGRL	LRAKRPSSED	FVFL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, транспорт, транспорт білків, убіквітинування білків, автофагія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мітохондрії.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Betin V.M., Lane J.D. (2009). Caspase cleavage of Atg4D stimulates GABARAP-L1 processing and triggers mitochondrial targeting and apoptosis. J. Cell Sci. 122: 2554—2566. PMID 19549685 DOI:10.1242/jcs.046250
Betin V.M., MacVicar T.D., Parsons S.F., Anstee D.J., Lane J.D. (2012). A cryptic mitochondrial targeting motif in Atg4D links caspase cleavage with mitochondrial import and oxidative stress. Autophagy. 8: 664—676. PMID 22441018 DOI:10.4161/auto.19227

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20789 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q86TL0 (англ.) . Архів оригіналу за 28 квітня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.