BCR |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1K1F, 2AIN | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | BCR, Bcr, 5133400C09Rik, AI561783, AI853148, mKIAA3017, ALL, BCR1, CML, D22S11, D22S662, PHL, RhoGEF and GTPase activating protein, BCR gene, BCR activator of RhoGEF and GTPase |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 151410 MGI: 88141 HomoloGene: 3192 GeneCards: BCR |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
натуральна віспа, Філадельфійська хромосома[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • transferase activity • nucleotide binding • guanyl-nucleotide exchange factor activity • kinase activity • protein serine/threonine kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • enzyme binding • protein tyrosine kinase activity • ATP binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • postsynaptic membrane • мембрана • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • клітинна мембрана • синапс • міжклітинні контакти • екзосома • GO:0009327 protein-containing complex • Schaffer collateral - CA1 synapse • glutamatergic synapse • postsynaptic density, intracellular component • внутрішньоклітинний |
---|
Біологічний процес | • positive regulation of phagocytosis • GO:0007243 intracellular signal transduction • neuromuscular process controlling balance • фосфорилювання • regulation of cell cycle • negative regulation of blood vessel remodeling • protein phosphorylation • negative regulation of cellular extravasation • response to lipopolysaccharide • brain development • regulation of vascular permeability • negative regulation of cell migration • negative regulation of neutrophil degranulation • inner ear morphogenesis • protein autophosphorylation • platelet-derived growth factor receptor signaling pathway • regulation of Rho protein signal transduction • regulation of small GTPase mediated signal transduction • negative regulation of inflammatory response • actin cytoskeleton organization • GO:0072468 сигнальна трансдукція • peptidyl-tyrosine phosphorylation • renal system process • homeostasis of number of cells • regulation of nitrogen compound metabolic process • definitive hemopoiesis • negative regulation of respiratory burst • intracellular protein transmembrane transport • cellular response to lipopolysaccharide • negative regulation of reactive oxygen species metabolic process • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • modulation of chemical synaptic transmission • small GTPase mediated signal transduction • keratinocyte differentiation • focal adhesion assembly • GO:0032861, GO:0032862, GO:0032856 activation of GTPase activity |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 22: 23.18 – 23.32 Mb | Хр. 10: 74.9 – 75.02 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
BCR (англ. BCR, Breakpoint Cluster Region, RhoGEF and GTPase activating protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 271 амінокислот, а молекулярна маса — 142 819[5].
BCR є одним з двох генів комплексу BCR-ABL, який пов’язаний з Філадельфійською хромосомою.
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MVDPVGFAEA | | WKAQFPDSEP | | PRMELRSVGD | | IEQELERCKA | | SIRRLEQEVN |
QERFRMIYLQ | | TLLAKEKKSY | | DRQRWGFRRA | | AQAPDGASEP | | RASASRPQPA |
PADGADPPPA | | EEPEARPDGE | | GSPGKARPGT | | ARRPGAAASG | | ERDDRGPPAS |
VAALRSNFER | | IRKGHGQPGA | | DAEKPFYVNV | | EFHHERGLVK | | VNDKEVSDRI |
SSLGSQAMQM | | ERKKSQHGAG | | SSVGDASRPP | | YRGRSSESSC | | GVDGDYEDAE |
LNPRFLKDNL | | IDANGGSRPP | | WPPLEYQPYQ | | SIYVGGMMEG | | EGKGPLLRSQ |
STSEQEKRLT | | WPRRSYSPRS | | FEDCGGGYTP | | DCSSNENLTS | | SEEDFSSGQS |
SRVSPSPTTY | | RMFRDKSRSP | | SQNSQQSFDS | | SSPPTPQCHK | | RHRHCPVVVS |
EATIVGVRKT | | GQIWPNDGEG | | AFHGDADGSF | | GTPPGYGCAA | | DRAEEQRRHQ |
DGLPYIDDSP | | SSSPHLSSKG | | RGSRDALVSG | | ALESTKASEL | | DLEKGLEMRK |
WVLSGILASE | | ETYLSHLEAL | | LLPMKPLKAA | | ATTSQPVLTS | | QQIETIFFKV |
PELYEIHKEF | | YDGLFPRVQQ | | WSHQQRVGDL | | FQKLASQLGV | | YRAFVDNYGV |
AMEMAEKCCQ | | ANAQFAEISE | | NLRARSNKDA | | KDPTTKNSLE | | TLLYKPVDRV |
TRSTLVLHDL | | LKHTPASHPD | | HPLLQDALRI | | SQNFLSSINE | | EITPRRQSMT |
VKKGEHRQLL | | KDSFMVELVE | | GARKLRHVFL | | FTDLLLCTKL | | KKQSGGKTQQ |
YDCKWYIPLT | | DLSFQMVDEL | | EAVPNIPLVP | | DEELDALKIK | | ISQIKNDIQR |
EKRANKGSKA | | TERLKKKLSE | | QESLLLLMSP | | SMAFRVHSRN | | GKSYTFLISS |
DYERAEWREN | | IREQQKKCFR | | SFSLTSVELQ | | MLTNSCVKLQ | | TVHSIPLTIN |
KEDDESPGLY | | GFLNVIVHSA | | TGFKQSSNLY | | CTLEVDSFGY | | FVNKAKTRVY |
RDTAEPNWNE | | EFEIELEGSQ | | TLRILCYEKC | | YNKTKIPKED | | GESTDRLMGK |
GQVQLDPQAL | | QDRDWQRTVI | | AMNGIEVKLS | | VKFNSREFSL | | KRMPSRKQTG |
VFGVKIAVVT | | KRERSKVPYI | | VRQCVEEIER | | RGMEEVGIYR | | VSGVATDIQA |
LKAAFDVNNK | | DVSVMMSEMD | | VNAIAGTLKL | | YFRELPEPLF | | TDEFYPNFAE |
GIALSDPVAK | | ESCMLNLLLS | | LPEANLLTFL | | FLLDHLKRVA | | EKEAVNKMSL |
HNLATVFGPT | | LLRPSEKESK | | LPANPSQPIT | | MTDSWSLEVM | | SQVQVLLYFL |
QLEAIPAPDS | | KRQSILFSTE | | V |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.
Література
- Mes-Masson A.-M., McLaughlin J., Daley G.Q., Paskind M., Witte O.N. (1986). Overlapping cDNA clones define the complete coding region for the P210c-abl gene product associated with chronic myelogenous leukemia cells containing the Philadelphia chromosome. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 83: 9768—9772. PMID 3540951 DOI:10.1073/pnas.83.24.9768
- Heisterkamp N., Stam K., Groffen J., de Klein A., Grosveld G. (1985). Structural organization of the bcr gene and its role in the Ph' translocation. Nature. 315: 758—761. PMID 2989703 DOI:10.1038/315758a0
- Zhu Q.S., Heisterkamp N., Groffen J. (1990). Unique organization of the human BCR gene promoter. Nucleic Acids Res. 18: 7119—7125. PMID 2263470 DOI:10.1093/nar/18.23.7119
- Shah N.P., Witte O.N., Denny C.T. (1991). Characterization of the BCR promoter in Philadelphia chromosome-positive and -negative cell lines. Mol. Cell. Biol. 11: 1854—1860. PMID 1900918 DOI:10.1128/MCB.11.4.1854
- Pendergast A.M., Muller A.J., Havlik M.H., Maru Y., Witte O.N. (1991). BCR sequences essential for transformation by the BCR-ABL oncogene bind to the ABL SH2 regulatory domain in a non-phosphotyrosine-dependent manner. Cell. 66: 161—171. PMID 1712671 DOI:10.1016/0092-8674(91)90148-R
- Maru Y., Witte O.N. (1991). The BCR gene encodes a novel serine/threonine kinase activity within a single exon. Cell. 67: 459—468. PMID 1657398 DOI:10.1016/0092-8674(91)90521-Y
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з BCR переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1014 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, P11274 (англ.) . Архів оригіналу за 2 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |