C16orf62 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

C16orf62

Ідентифікатори

Символи

VPS35L, chromosome 16 open reading frame 62, VPS35 endosomal protein sorting factor like, C16orf62, EC97, RTSC3

Зовнішні ІД

MGI: 1918767 HomoloGene: 10659 GeneCards: VPS35L

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • ендосома • early endosome • мембрана • клітинна мембрана • ficolin-1-rich granule membrane
Біологічний процес	• protein transport • Golgi to plasma membrane transport • neutrophil degranulation • endocytic recycling
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


57020


71517

Ensembl


ENSG00000103544


ENSMUSG00000030982

UniProt


Q7Z3J2


Q8BWQ6

RefSeq (мРНК)


NM_001300743 NM_020314 NM_001365293 NM_001365294 NM_001365295


NM_027815

RefSeq (білок)


NP_001287672 NP_064710 NP_001352222 NP_001352223 NP_001352224


NP_082091

Локус (UCSC)

Хр. 16: 19.56 – 19.71 Mb

Хр. 7: 118.34 – 118.44 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

C16orf62 (англ. Chromosome 16 open reading frame 62) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 963 амінокислот, а молекулярна маса — 109 563^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAVFPWHSRN	RNYKAEFASC	RLEAVPLEFG	DYHPLKPITV	TESKTKKVNR
KGSTSSTSSS	SSSSVVDPLS	SVLDGTDPLS	MFAATADPAA	LAAAMDSSRR
KRDRDDNSVV	GSDFEPWTNK	RGEILARYTT	TEKLSINLFM	GSEKGKAGTA
TLAMSEKVRT	RLEELDDFEE	GSQKELLNLT	QQDYVNRIEE	LNQSLKDAWA
SDQKVKALKI	VIQCSKLLSD	TSVIQFYPSK	FVLITDILDT	FGKLVYERIF
SMCVDSRSVL	PDHFSPENAN	DTAKETCLNW	FFKIASIREL	IPRFYVEASI
LKCNKFLSKT	GISECLPRLT	CMIRGIGDPL	VSVYARAYLC	RVGMEVAPHL
KETLNKNFFD	FLLTFKQIHG	DTVQNQLVVQ	GVELPSYLPL	YPPAMDWIFQ
CISYHAPEAL	LTEMMERCKK	LGNNALLLNS	VMSAFRAEFI	ATRSMDFIGM
IKECDESGFP	KHLLFRSLGL	NLALADPPES	DRLQILNEAW	KVITKLKNPQ
DYINCAEVWV	EYTCKHFTKR	EVNTVLADVI	KHMTPDRAFE	DSYPQLQLII
KKVIAHFHDF	SVLFSVEKFL	PFLDMFQKES	VRVEVCKCIM	DAFIKHQQEP
TKDPVILNAL	LHVCKTMHDS	VNALTLEDEK	RMLSYLINGF	IKMVSFGRDF
EQQLSFYVES	RSMFCNLEPV	LVQLIHSVNR	LAMETRKVMK	GNHSRKTAAF
VRACVAYCFI	TIPSLAGIFT	RLNLYLHSGQ	VALANQCLSQ	ADAFFKAAIS
LVPEVPKMIN	IDGKMRPSES	FLLEFLCNFF	STLLIVPDHP	EHGVLFLVRE
LLNVIQDYTW	EDNSDEKIRI	YTCVLHLLSA	MSQETYLYHI	DKVDSNDSLY
GGDSKFLAEN	NKLCETVMAQ	ILEHLKTLAK	DEALKRQSSL	GLSFFNSILA
HGDLRNNKLN	QLSVNLWHLA	QRHGCADTRT	MVKTLEYIKK	QSKQPDMTHL
TELALRLPLQ	TRT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, ендосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24641 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q7Z3J2 (англ.) . Архів оригіналу за 26 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.