CABYR

Ідентифікатори

Символи

CABYR, CABYRa, CABYRc, CABYRc/d, CABYRe, CBP86, CT88, FSP-2, FSP2, calcium binding tyrosine phosphorylation regulated

Зовнішні ІД

OMIM: 612135 MGI: 1918382 HomoloGene: 49299 GeneCards: CABYR

Онтологія гена
Молекулярна функція	• SH3 domain binding • enzyme binding • calcium ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein domain specific binding • зв'язування з іоном металу • protein heterodimerization activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • sperm principal piece • cell projection • motile cilium • війка • sperm fibrous sheath • цитоскелет • клітинне ядро • sperm end piece • гіалоплазма • extracellular region
Біологічний процес	• sperm capacitation • epithelial cilium movement involved in extracellular fluid movement
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


26256


71132

Ensembl


ENSG00000154040


ENSMUSG00000024430

UniProt


O75952


Q9D424

RefSeq (мРНК)

NM_001308231 NM_012189 NM_138643 NM_138644 NM_153768
NM_153769 NM_153770


NM_001042418 NM_001042419 NM_001042420 NM_027687 NM_181731

RefSeq (білок)

NP_001295160 NP_036321 NP_619584 NP_619585 NP_722452
NP_722453 NP_722454 NP_001295160.1


NP_001035883 NP_001035884 NP_001035885 NP_081963 NP_859420

Локус (UCSC)

Хр. 18: 24.14 – 24.16 Mb

Хр. 18: 12.87 – 12.89 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CABYR (англ. Calcium binding tyrosine phosphorylation regulated) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 493 амінокислот, а молекулярна маса — 52 774^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MISSKPRLVV	PYGLKTLLEG	ISRAVLKTNP	SNINQFAAAY	FQELTMYRGN
TTMDIKDLVK	QFHQIKVEKW	SEGTTPQKKL	ECLKEPGKTS	VESKVPTQME
KSTDTDEDNV	TRTEYSDKTT	QFPSVYAVPG	TEQTEAVGGL	SSKPATPKTT
TPPSSPPPTA	VSPEFAYVPA	DPAQLAAQML	GKVSSIHSDQ	SDVLMVDVAT
SMPVVIKEVP	SSEAAEDVMV	AAPLVCSGKV	LEVQVVNQTS	VHVDLGSQPK
ENEAEPSTAS	SVPLQDEQEP	PAYDQAPEVT	LQADIEVMST	VHISSVYNDV
PVTEGVVYIE	QLPEQIVIPF	TDQVACLKEN	EQSKENEQSP	RVSPKSVVEK
TTSGMSKKSV	ESVKLAQLEE	NAKYSSVYME	AEATALLSDT	SLKGQPEVPA
QLLDAEGAIK	IGSEKSLHLE	VEITSIVSDN	TGQEESGENS	VPQEMEGKPV
LSGEAAEAVH	SGTSVKSSSG	PFPPAPEGLT	APEIEPEGES	TAE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, клітинних відростках, війках.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15569 (англ.) . Архів оригіналу за 16 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, O75952 (англ.) . Архів оригіналу за 12 грудня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.