CAVIN1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | CAVIN1, CAVIN, CGL4, cavin-1, FKSG13, PTRF, polymerase I and transcript release factor, caveolae associated protein 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603198 MGI: 1277968 HomoloGene: 7499 GeneCards: CAVIN1 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
congenital generalized lipodystrophy type 4[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • rRNA binding • rRNA primary transcript binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • identical protein binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • мембрана • нуклеоплазма • ендоплазматичний ретикулум • мітохондрія • caveola • membrane raft • клітинне ядро • клітинна мембрана • внутрішньоклітинна мембранна органела • GO:0009327 protein-containing complex |
---|
Біологічний процес | • termination of RNA polymerase I transcription • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription initiation from RNA polymerase I promoter • DNA-templated transcription, termination • transcription, DNA-templated • rRNA transcription • positive regulation of cell motility • protein secretion |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/a/a8/PBB_GE_PTRF_208790_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_PTRF_208790_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/3/39/PBB_GE_PTRF_208789_at_fs.png/250px-PBB_GE_PTRF_208789_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_008986 NM_001359105 NM_027160 |
|
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 17: 42.4 – 42.42 Mb | Хр. 11: 100.85 – 100.86 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CAVIN1 (англ. Caveolae associated protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 390 амінокислот, а молекулярна маса — 43 476[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MEDPTLYIVE | | RPLPGYPDAE | | APEPSSAGAQ | | AAEEPSGAGS | | EELIKSDQVN |
GVLVLSLLDK | | IIGAVDQIQL | | TQAQLEERQA | | EMEGAVQSIQ | | GELSKLGKAH |
ATTSNTVSKL | | LEKVRKVSVN | | VKTVRGSLER | | QAGQIKKLEV | | NEAELLRRRN |
FKVMIYQDEV | | KLPAKLSISK | | SLKESEALPE | | KEGEELGEGE | | RPEEDAAALE |
LSSDEAVEVE | | EVIEESRAER | | IKRSGLRRVD | | DFKKAFSKEK | | MEKTKVRTRE |
NLEKTRLKTK | | ENLEKTRHTL | | EKRMNKLGTR | | LVPAERREKL | | KTSRDKLRKS |
FTPDHVVYAR | | SKTAVYKVPP | | FTFHVKKIRE | | GQVEVLKATE | | MVEVGADDDE |
GGAERGEAGD | | LRRGSSPDVH | | ALLEITEESD | | AVLVDKSDSD |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК, рРНК. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані, мітохондрії, ендоплазматичному ретикулумі, мікросомах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Jansa P., Mason S.W., Hoffmann-Rohrer U., Grummt I. (1998). Cloning and functional characterization of PTRF, a novel protein which induces dissociation of paused ternary transcription complexes. EMBO J. 17: 2855—2864. PMID 9582279 DOI:10.1093/emboj/17.10.2855
- Aboulaich N., Vainonen J.P., Stralfors P., Vener A.V. (2004). Vectorial proteomics reveal targeting, phosphorylation and specific fragmentation of polymerase I and transcript release factor (PTRF) at the surface of caveolae in human adipocytes. Biochem. J. 383: 237—248. PMID 15242332 DOI:10.1042/BJ20040647
- Aboulaich N., Oertegren U., Vener A.V., Stralfors P. (2006). Association and insulin regulated translocation of hormone-sensitive lipase with PTRF. Biochem. Biophys. Res. Commun. 350: 657—661. PMID 17026959 DOI:10.1016/j.bbrc.2006.09.094
- Liu L., Pilch P.F. (2008). A critical role of cavin (polymerase I and transcript release factor) in caveolae formation and organization. J. Biol. Chem. 283: 4314—4322. PMID 18056712 DOI:10.1074/jbc.M707890200
- Hansen C.G., Bright N.A., Howard G., Nichols B.J. (2009). SDPR induces membrane curvature and functions in the formation of caveolae. Nat. Cell Biol. 11: 807—814. PMID 19525939 DOI:10.1038/ncb1887
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з CAVIN1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9688 (англ.) . Архів оригіналу за 11 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q6NZI2 (англ.) . Архів оригіналу за 6 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |