CBFB

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1CL3, 1E50, 1H9D, 4N9F

Ідентифікатори

Символи

CBFB, PEBP2B, core-binding factor, beta subunit, core-binding factor beta subunit, core-binding factor subunit beta

Зовнішні ІД

OMIM: 121360 MGI: 99851 HomoloGene: 11173 GeneCards: CBFB

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001104 transcription coregulator activity • sequence-specific DNA binding
Клітинна компонента	• клітинне ядро • мембрана • нуклеоплазма • core-binding factor complex
Біологічний процес	• definitive hemopoiesis • myeloid cell differentiation • protein polyubiquitination • cell maturation • transcription by RNA polymerase II • осифікація • osteoblast differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • lymphocyte differentiation • regulation of cytokine-mediated signaling pathway • regulation of Wnt signaling pathway • regulation of intracellular estrogen receptor signaling pathway • regulation of regulatory T cell differentiation • regulation of keratinocyte differentiation • regulation of myeloid cell differentiation • regulation of megakaryocyte differentiation • regulation of B cell receptor signaling pathway • regulation of hematopoietic stem cell differentiation • regulation of bicellular tight junction assembly • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of CD4-positive, alpha-beta T cell differentiation • positive regulation of CD8-positive, alpha-beta T cell differentiation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


865


12400

Ensembl


ENSG00000067955


ENSMUSG00000031885

UniProt


Q13951


Q08024

RefSeq (мРНК)

NM_001755 NM_022845 NM_001368707 NM_001368708 NM_001368709
NM_001368710


NM_001161456 NM_001161457 NM_001161458 NM_022309

RefSeq (білок)

NP_001746 NP_074036 NP_001355636 NP_001355637 NP_001355638
NP_001355639


NP_001154928 NP_001154929 NP_001154930 NP_071704

Локус (UCSC)

Хр. 16: 67.03 – 67.1 Mb

Хр. 8: 105.9 – 105.94 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CBFB (англ. Core-binding factor beta subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 182 амінокислот, а молекулярна маса — 21 508^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPRVVPDQRS	KFENEEFFRK	LSRECEIKYT	GFRDRPHEER	QARFQNACRD
GRSEIAFVAT	GTNLSLQFFP	ASWQGEQRQT	PSREYVDLER	EAGKVYLKAP
MILNGVCVIW	KGWIDLQRLD	GMGCLEFDEE	RAQQEDALAQ	QAFEEARRRT
REFEDRDRSH	REEMEVRVSQ	LLAVTGKKTT	RP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hajra A., Collins F.S. (1995). Structure of the leukemia-associated human CBFB gene. Genomics. 26: 571—579. PMID 7607682 DOI:10.1016/0888-7543(95)80177-N
Hajra A., Collins F.S. (1996). Genomics. 38: 107—107. {{cite journal}}: Пропущений або порожній |title= (довідка) PMID 9064279 DOI:10.1006/geno.1996.0603
Warren A.J., Bravo J., Williams R.L., Rabbitts T.H. (2000). Structural basis for the heterodimeric interaction between the acute leukaemia-associated transcription factors AML1 and CBFbeta. EMBO J. 19: 3004—3015. PMID 10856244 DOI:10.1093/emboj/19.12.3004
Bravo J., Li Z., Speck N.A., Warren A.J. (2001). The leukemia-associated AML1 (Runx1) -- CBF beta complex functions as a DNA-induced molecular clamp. Nat. Struct. Biol. 8: 371—378. PMID 11276260 DOI:10.1038/86264

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1539 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q13951 (англ.) . Архів оригіналу за 31 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.