CBX5

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3FDT, 3I3C

Ідентифікатори

Символи

CBX5, HEL25, HP1, HP1A, chromobox 5

Зовнішні ІД

OMIM: 604478 MGI: 109372 HomoloGene: 7257 GeneCards: CBX5

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein homodimerization activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein-macromolecule adaptor activity • chromatin binding • histone deacetylase binding • methylated histone binding • ribonucleoprotein complex binding • GO:0032403 protein-containing complex binding • identical protein binding
Клітинна компонента	• кінетохор • клітинне ядро • nuclear envelope • pericentric heterochromatin • ядерце • histone deacetylase complex • нуклеоплазма • chromocenter • GO:0035328 Гетерохроматин • центромера • histone methyltransferase complex • transcription repressor complex • хромосома • PML body • GO:0009327 protein-containing complex • Рибонуклеопротеїни • site of DNA damage
Біологічний процес	• зсідання крові • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0022415 viral process • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of G0 to G1 transition • cellular response to DNA damage stimulus
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23468


12419

Ensembl


ENSG00000094916


ENSMUSG00000009575

UniProt


P45973


Q61686

RefSeq (мРНК)


NM_012117 NM_001127321 NM_001127322


NM_001076789 NM_001110216 NM_007626 NM_001358950

RefSeq (білок)


NP_001120793 NP_001120794 NP_036249


NP_001070257 NP_001103686 NP_031652 NP_001345879

Локус (UCSC)

Хр. 12: 54.23 – 54.28 Mb

Хр. 15: 103.1 – 103.15 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CBX5 (англ. Chromobox 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 191 амінокислот, а молекулярна маса — 22 225^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGKKTKRTAD	SSSSEDEEEY	VVEKVLDRRV	VKGQVEYLLK	WKGFSEEHNT
WEPEKNLDCP	ELISEFMKKY	KKMKEGENNK	PREKSESNKR	KSNFSNSADD
IKSKKKREQS	NDIARGFERG	LEPEKIIGAT	DSCGDLMFLM	KWKDTDEADL
VLAKEANVKC	PQIVIAFYEE	RLTWHAYPED	AENKEKETAK	S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, ацетилювання. Локалізований у ядрі, хромосомах, центромерах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Ye Q., Worman H.J. (1996). Interaction between an integral protein of the nuclear envelope inner membrane and human chromodomain proteins homologous to Drosophila HP1. J. Biol. Chem. 271: 14653—14656. PMID 8663349 DOI:10.1074/jbc.271.25.14653
Ye Q., Callebaut I., Pezhman A., Courvalin J.-C., Worman H.J. (1997). Domain-specific interactions of human HP1-type chromodomain proteins and inner nuclear membrane protein LBR. J. Biol. Chem. 272: 14983—14989. PMID 9169472 DOI:10.1074/jbc.272.23.14983
Minc E., Allory Y., Worman H.J., Courvalin J.-C., Buendia B. (1999). Localization and phosphorylation of HP1 proteins during the cell cycle in mammalian cells. Chromosoma. 108: 220—234. PMID 10460410 DOI:10.1007/s004120050372
Lachner M., O'Carroll D., Rea S., Mechtler K., Jenuwein T. (2001). Methylation of histone H3 lysine 9 creates a binding site for HP1 proteins. Nature. 410: 116—120. PMID 11242053 DOI:10.1038/35065132
Lechner M.S., Schultz D.C., Negorev D., Maul G.G., Rauscher F.J. III (2005). The mammalian heterochromatin protein 1 binds diverse nuclear proteins through a common motif that targets the chromoshadow domain. Biochem. Biophys. Res. Commun. 331: 929—937. PMID 15882967 DOI:10.1016/j.bbrc.2005.04.016

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1555 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P45973 (англ.) . Архів оригіналу за 30 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.