CBX8

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3I91, 5EQ0, 2N4Q

Ідентифікатори

Символи

CBX8, PC3, RC1, chromobox 8

Зовнішні ІД

OMIM: 617354 MGI: 1353589 HomoloGene: 32199 GeneCards: CBX8

Онтологія гена
Молекулярна функція	• methylated histone binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • single-stranded RNA binding • ubiquitin-protein transferase activator activity
Клітинна компонента	• ubiquitin ligase complex • нуклеоплазма • GO:0035328 Гетерохроматин • PRC1 complex • PcG protein complex • клітинне ядро
Біологічний процес	• positive regulation of collagen biosynthetic process • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1900404 positive regulation of DNA repair • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • positive regulation of cell population proliferation • GO:0048552 regulation of catalytic activity • histone ubiquitination • cellular response to hydrogen peroxide • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


57332


30951

Ensembl


ENSG00000141570


ENSMUSG00000025578

UniProt


Q9HC52


Q9QXV1

RefSeq (мРНК)


NM_020649


NM_013926

RefSeq (білок)


NP_065700


NP_038954

Локус (UCSC)

Хр. 17: 79.79 – 79.8 Mb

Хр. 11: 118.93 – 118.93 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CBX8 (англ. Chromobox 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 389 амінокислот, а молекулярна маса — 43 396^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MELSAVGERV	FAAEALLKRR	IRKGRMEYLV	KWKGWSQKYS	TWEPEENILD
ARLLAAFEER	EREMELYGPK	KRGPKPKTFL	LKAQAKAKAK	TYEFRSDSAR
GIRIPYPGRS	PQDLASTSRA	REGLRNMGLS	PPASSTSTSS	TCRAEAPRDR
DRDRDRDRER	DRERERERER	ERERERERER	GTSRVDDKPS	SPGDSSKKRG
PKPRKELPDP	SQRPLGEPSA	GLGEYLKGRK	LDDTPSGAGK	FPAGHSVIQL
ARRQDSDLVQ	CGVTSPSSAE	ATGKLAVDTF	PARVIKHRAA	FLEAKGQGAL
DPNGTRVRHG	SGPPSSGGGL	YRDMGAQGGR	PSLIARIPVA	RILGDPEEES
WSPSLTNLEK	VVVTDVTSNF	LTVTIKESNT	DQGFFKEKR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Локалізований у ядрі.

Література

Bardos J.I., Saurin A.J., Tissot C., Duprez E., Freemont P.S. (2000). HPC3 is a new human polycomb orthologue that interacts and associates with RING1 and Bmi1 and has transcriptional repression properties. J. Biol. Chem. 275: 28785—28792. PMID 10825164 DOI:10.1074/jbc.M001835200
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Vandamme J., Volkel P., Rosnoblet C., Le Faou P., Angrand P.O. (2011). Interaction proteomics analysis of polycomb proteins defines distinct PRC1 Complexes in mammalian cells. Mol. Cell. Proteomics: —. PMID 21282530 DOI:10.1074/mcp.M110.002642

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15962 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9HC52 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.