CD300LF

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2NMS

Ідентифікатори

Символи

CD300LF, CD300f, CLM-1, CLM1, IREM-1, IREM1, IgSF13, LMIR3, NKIR, CD300 molecule like family member f

Зовнішні ІД

OMIM: 609807 MGI: 2442359 HomoloGene: 51396 GeneCards: CD300LF

Онтологія гена
Молекулярна функція	• phosphatidylserine binding • interleukin-4 receptor binding • ceramide binding • lipid binding
Клітинна компонента	• мембрана • integral component of membrane • клітинна мембрана
Біологічний процес	• процес імунної системи • regulation of immune response • negative regulation of mast cell activation • negative regulation of MyD88-dependent toll-like receptor signaling pathway • TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway • interleukin-13-mediated signaling pathway • positive regulation of interleukin-4-mediated signaling pathway • negative regulation of apoptotic cell clearance • positive regulation of apoptotic cell clearance
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


146722


246746

Ensembl


ENSG00000186074


ENSMUSG00000047798

UniProt


Q8TDQ1


Q6SJQ7

RefSeq (мРНК)

NM_001289082 NM_001289083 NM_001289084 NM_001289085 NM_001289086
NM_001289087 NM_139018


NM_001169153 NM_145634 NM_001347648

RefSeq (білок)

NP_001276011 NP_001276012 NP_001276013 NP_001276014 NP_001276015
NP_001276016 NP_620587


NP_001162624 NP_001334577 NP_663609

Локус (UCSC)

Хр. 17: 74.69 – 74.71 Mb

Хр. 11: 115.01 – 115.02 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CD300LF (англ. CD300 molecule like family member f) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 290 амінокислот, а молекулярна маса — 32 335^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPLLTLYLLL	FWLSGYSIVT	QITGPTTVNG	LERGSLTVQC	VYRSGWETYL
KWWCRGAIWR	DCKILVKTSG	SEQEVKRDRV	SIKDNQKNRT	FTVTMEDLMK
TDADTYWCGI	EKTGNDLGVT	VQVTIDPAPV	TQEETSSSPT	LTGHHLDNRH
KLLKLSVLLP	LIFTILLLLL	VAASLLAWRM	MKYQQKAAGM	SPEQVLQPLE
GDLCYADLTL	QLAGTSPQKA	TTKLSSAQVD	QVEVEYVTMA	SLPKEDISYA
SLTLGAEDQE	PTYCNMGHLS	SHLPGRGPEE	PTEYSTISRP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
Kim E.J., Lee S.M., Suk K., Lee W.H. (2012). CD300a and CD300f differentially regulate the MyD88 and TRIF-mediated TLR signalling pathways through activation of SHP-1 and/or SHP-2 in human monocytic cell lines. Immunology. 135: 226—235. PMID 22043923 DOI:10.1111/j.1365-2567.2011.03528.x

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29883 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q8TDQ1 (англ.) . Архів оригіналу за 5 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.