CDH15

Ідентифікатори

Символи

CDH15, CDH14, CDH3, CDHM, MCAD, MRD3, cadherin 15

Зовнішні ІД

OMIM: 114019 MGI: 106672 HomoloGene: 3622 GeneCards: CDH15

Пов'язані генетичні захворювання

autosomal dominant non-syndromic intellectual disability 3^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • cytoskeletal protein binding • protein homodimerization activity • cadherin binding
Клітинна компонента	• caveola • integral component of membrane • neuromuscular junction • клітинна мембрана • екзосома • мембрана • комплекс Ґольджі • гіалоплазма • cell surface • catenin complex
Біологічний процес	• адгезія клітин • adherens junction organization • positive regulation of muscle cell differentiation • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • GO:0000767 cell morphogenesis • cell-cell junction assembly • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • cell-cell adhesion mediated by cadherin • cell-cell adhesion
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1013


12555

Ensembl


ENSG00000129910


ENSMUSG00000031962

UniProt


P55291


P33146

RefSeq (мРНК)


NM_004933


NM_007662

RefSeq (білок)


NP_004924


NP_031688

Локус (UCSC)

Хр. 16: 89.17 – 89.2 Mb

Хр. 8: 123.57 – 123.59 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CDH15 (англ. Cadherin 15) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 814 амінокислот, а молекулярна маса — 88 916^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDAAFLLVLG	LLAQSLCLSL	GVPGWRRPTT	LYPWRRAPAL	SRVRRAWVIP
PISVSENHKR	LPYPLVQIKS	DKQQLGSVIY	SIQGPGVDEE	PRGVFSIDKF
TGKVFLNAML	DREKTDRFRL	RAFALDLGGS	TLEDPTDLEI	VVVDQNDNRP
AFLQEAFTGR	VLEGAVPGTY	VTRAEATDAD	DPETDNAALR	FSILQQGSPE
LFSIDELTGE	IRTVQVGLDR	EVVAVYNLTL	QVADMSGDGL	TATASAIITL
DDINDNAPEF	TRDEFFMEAI	EAVSGVDVGR	LEVEDRDLPG	SPNWVARFTI
LEGDPDGQFT	IRTDPKTNEG	VLSIVKALDY	ESCEHYELKV	SVQNEAPLQA
AALRAERGQA	KVRVHVQDTN	EPPVFQENPL	RTSLAEGAPP	GTLVATFSAR
DPDTEQLQRL	SYSKDYDPED	WLQVDAATGR	IQTQHVLSPA	SPFLKGGWYR
AIVLAQDDAS	QPRTATGTLS	IEILEVNDHA	PVLAPPPPGS	LCSEPHQGPG
LLLGATDEDL	PPHGAPFHFQ	LSPRLPELGR	NWSLSQVNVS	HARLRPRHQV
PEGLHRLSLL	LRDSGQPPQQ	REQPLNVTVC	RCGKDGVCLP	GAAALLAGGT
GLSLGALVIV	LASALLLLVL	VLLVALRARF	WKQSRGKGLL	HGPQDDLRDN
VLNYDEQGGG	EEDQDAYDIS	QLRHPTALSL	PLGPPPLRRD	APQGRLHPQP
PRVLPTSPLD	IADFINDGLE	AADSDPSVPP	YDTALIYDYE	GDGSVAGTLS
SILSSQGDED	QDYDYLRDWG	PRFARLADMY	GHPCGLEYGA	RWDHQAREGL
SPGALLPRHR	GRTA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як клітинна адгезія. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Shibata T., Shimoyama Y., Gotoh M., Hirohashi S. (1997). Identification of human cadherin-14, a novel neurally specific type II cadherin, by protein interaction cloning. J. Biol. Chem. 272: 5236—5240. PMID 9030594 DOI:10.1074/jbc.272.8.5236
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з CDH15 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1754 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, P55291 (англ.) . Архів оригіналу за 18 травня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.