CDH8

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1ZXK, 2A62

Ідентифікатори

Символи

CDH8, Nbla04261, cadherin 8

Зовнішні ІД

OMIM: 603008 MGI: 107434 HomoloGene: 55604 GeneCards: CDH8

Пов'язані генетичні захворювання

недрібноклітинна карцинома легенів^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding • зв'язування з іоном металу • identical protein binding • cytoskeletal protein binding • protein homodimerization activity • cadherin binding
Клітинна компонента	• axon terminus • integral component of membrane • synaptic cleft • мембрана • клітинна мембрана • synaptic membrane • glutamatergic synapse • cell surface • catenin complex
Біологічний процес	• response to cold • адгезія клітин • adherens junction organization • synaptic transmission, glutamatergic • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • chemical synaptic transmission • GO:1904739 regulation of synapse organization • cell-cell junction assembly • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • cell-cell adhesion mediated by cadherin • cell-cell adhesion • GO:0000767 cell morphogenesis
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1006


12564

Ensembl


ENSG00000150394


ENSMUSG00000036510

UniProt


P55286


P97291

RefSeq (мРНК)


NM_001796


NM_001039154 NM_001285913 NM_001285914 NM_007667

RefSeq (білок)


NP_001787


NP_001034243 NP_001272842 NP_001272843 NP_031693

Локус (UCSC)

Хр. 16: 61.65 – 62.04 Mb

Хр. 8: 99.75 – 100.14 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CDH8 (англ. Cadherin 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 799 амінокислот, а молекулярна маса — 88 253^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPERLAEMLL	DLWTPLIILW	ITLPPCIYMA	PMNQSQVLMS	GSPLELNSLG
EEQRILNRSK	RGWVWNQMFV	LEEFSGPEPI	LVGRLHTDLD	PGSKKIKYIL
SGDGAGTIFQ	INDVTGDIHA	IKRLDREEKA	EYTLTAQAVD	WETSKPLEPP
SEFIIKVQDI	NDNAPEFLNG	PYHATVPEMS	ILGTSVTNVT	ATDADDPVYG
NSAKLVYSIL	EGQPYFSIEP	ETAIIKTALP	NMDREAKEEY	LVVIQAKDMG
GHSGGLSGTT	TLTVTLTDVN	DNPPKFAQSL	YHFSVPEDVV	LGTAIGRVKA
NDQDIGENAQ	SSYDIIDGDG	TALFEITSDA	QAQDGIIRLR	KPLDFETKKS
YTLKVEAANV	HIDPRFSGRG	PFKDTATVKI	VVEDADEPPV	FSSPTYLLEV
HENAALNSVI	GQVTARDPDI	TSSPIRFSID	RHTDLERQFN	INADDGKITL
ATPLDRELSV	WHNITIIATE	IRNHSQISRV	PVAIKVLDVN	DNAPEFASEY
EAFLCENGKP	GQVIQTVSAM	DKDDPKNGHY	FLYSLLPEMV	NNPNFTIKKN
EDNSLSILAK	HNGFNRQKQE	VYLLPIIISD	SGNPPLSSTS	TLTIRVCGCS
NDGVVQSCNV	EAYVLPIGLS	MGALIAILAC	IILLLVIVVL	FVTLRRHKNE
PLIIKDDEDV	RENIIRYDDE	GGGEEDTEAF	DIATLQNPDG	INGFLPRKDI
KPDLQFMPRQ	GLAPVPNGVD	VDEFINVRLH	EADNDPTAPP	YDSIQIYGYE
GRGSVAGSLS	SLESTTSDSD	QNFDYLSDWG	PRFKRLGELY	SVGESDKET

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як клітинна адгезія. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Shimoyama Y., Tsujimoto G., Kitajima M., Natori M. (2000). Identification of three human type-II classic cadherins and frequent heterophilic interactions between different subclasses of type-II classic cadherins. Biochem. J. 349: 159—167. PMID 10861224 DOI:10.1042/0264-6021:3490159
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Tanihara H., Sano K., Heimark R.L., St John T., Suzuki S. (1994). Cloning of five human cadherins clarifies characteristic features of cadherin extracellular domain and provides further evidence for two structurally different types of cadherin. Cell Adhes. Commun. 2: 15—26. PMID 7982033
Suzuki S., Sano K., Tanihara H. (1991). Diversity of the cadherin family: evidence for eight new cadherins in nervous tissue. Cell Regul. 2: 261—270. PMID 2059658

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з CDH8 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1767 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, P55286 (англ.) . Архів оригіналу за 5 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.