| CDK5RAP3 |
|---|
|
| Ідентифікатори |
|---|
| Символи | CDK5RAP3, C53, HSF-27, IC53, LZAP, MST016, OK/SW-cl.114, PP1553, CDK5 regulatory subunit associated protein 3 |
|---|
| Зовнішні ІД | OMIM: 608202 MGI: 1933126 HomoloGene: 12718 GeneCards: CDK5RAP3 |
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція | • MDM2/MDM4 family protein binding
• NF-kappaB binding
• mitogen-activated protein kinase binding
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• ubiquitin-like protein ligase binding
• protein kinase binding
• cyclin binding
|
|---|
| Клітинна компонента | • цитоплазма
• центросома
• мембрана
• центр організації мікротрубочок
• ядерце
• мікротрубочка
• цитоскелет
• система ендомембран
• клітинне ядро
• гіалоплазма
• GO:0009327 protein-containing complex
|
|---|
| Біологічний процес | • GO:0033128 negative regulation of protein phosphorylation
• regulation of neuron differentiation
• protein ufmylation
• positive regulation of signal transduction by p53 class mediator
• regulation of phosphatase activity
• Відповідь на незгорнуті білки
• mitotic G2/M transition checkpoint
• brain development
• apoptotic nuclear changes
• negative regulation of MAP kinase activity
• positive regulation of ubiquitin-dependent protein catabolic process
• negative regulation of protein kinase activity by regulation of protein phosphorylation
• negative regulation of protein serine/threonine kinase activity
• проліферація
• mitotic G2 DNA damage checkpoint signaling
• negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity
• positive regulation of protein ubiquitination
• GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
• positive regulation of protein localization to nucleus
• regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity
• regulation of mitotic cell cycle
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних |
| Ортологи |
|---|
| Види | Людина | Миша |
|---|
| Entrez | | |
|---|
| Ensembl | | |
|---|
| UniProt | | |
|---|
| RefSeq (мРНК) | NM_001278197
NM_001278198
NM_001278216
NM_001278217
NM_025197
| NM_176095
NM_176096 |
| | NM_030248
NM_001308183
NM_001363255
NM_001363256 |
|
|---|
| RefSeq (білок) | | NP_001265126
NP_001265127
NP_001265145
NP_001265146
NP_788276 |
| | NP_001295112
NP_084524
NP_001350184
NP_001350185 |
|
|---|
| Локус (UCSC) | Хр. 17: 47.97 – 47.98 Mb | Хр. 11: 96.8 – 96.81 Mb |
|---|
| PubMed search | [1] | [2] |
|---|
| Вікідані |
| Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CDK5RAP3 (англ. CDK5 regulatory subunit associated protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 506 амінокислот, а молекулярна маса — 56 921[4].
Послідовність амінокислот
| 10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
|---|
| MEDHQHVPID | | IQTSKLLDWL | | VDRRHCSLKW | | QSLVLTIREK | | INAAIQDMPE |
| SEEIAQLLSG | | SYIHYFHCLR | | ILDLLKGTEA | | STKNIFGRYS | | SQRMKDWQEI |
| IALYEKDNTY | | LVELSSLLVR | | NVNYEIPSLK | | KQIAKCQQLQ | | QEYSRKEEEC |
| QAGAAEMREQ | | FYHSCKQYGI | | TGENVRGELL | | ALVKDLPSQL | | AEIGAAAQQS |
| LGEAIDVYQA | | SVGFVCESPT | | EQVLPMLRFV | | QKRGNSTVYE | | WRTGTEPSVV |
| ERPHLEELPE | | QVAEDAIDWG | | DFGVEAVSEG | | TDSGISAEAA | | GIDWGIFPES |
| DSKDPGGDGI | | DWGDDAVALQ | | ITVLEAGTQA | | PEGVARGPDA | | LTLLEYTETR |
| NQFLDELMEL | | EIFLAQRAVE | | LSEEADVLSV | | SQFQLAPAIL | | QGQTKEKMVT |
| MVSVLEDLIG | | KLTSLQLQHL | | FMILASPRYV | | DRVTEFLQQK | | LKQSQLLALK |
| KELMVQKQQE | | ALEEQAALEP | | KLDLLLEKTK | | ELQKLIEADI | | SKRYSGRPVN |
| LMGTSL |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Ching Y.-P., Qi Z., Wang J.H. (2000). Cloning of three novel neuronal Cdk5 activator binding proteins. Gene. 242: 285—294. PMID 10721722 DOI:10.1016/S0378-1119(99)00499-0
- Jiang H., Luo S., Li H. (2005). Cdk5 activator-binding protein C53 regulates apoptosis induced by genotoxic stress via modulating the G2/M DNA damage checkpoint. J. Biol. Chem. 280: 20651—20659. PMID 15790566 DOI:10.1074/jbc.M413431200
- Wang J., He X., Luo Y., Yarbrough W.G. (2006). A novel ARF-binding protein (LZAP) alters ARF regulation of HDM2. Biochem. J. 393: 489—501. PMID 16173922 DOI:10.1042/BJ20050960
- Wang J., An H., Mayo M.W., Baldwin A.S., Yarbrough W.G. (2007). LZAP, a putative tumor suppressor, selectively inhibits NF-kappaB. Cancer Cell. 12: 239—251. PMID 17785205 DOI:10.1016/j.ccr.2007.07.002
- Jiang H., Wu J., He C., Yang W., Li H. (2009). Tumor suppressor protein C53 antagonizes checkpoint kinases to promote cyclin-dependent kinase 1 activation. Cell Res. 19: 458—468. PMID 19223857 DOI:10.1038/cr.2009.14
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18673 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q96JB5 (англ.) . Архів оригіналу за 29 липня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
 | Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
 Портал «Біологія»  Портал «Хімія»
|
| На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |
