CDYL2 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

CDYL2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2MJ8, 4HAE, 5JJZ

Ідентифікатори

Символи

CDYL2, PCCP1, chromodomain protein, Y-like 2, chromodomain Y like 2

Зовнішні ІД

MGI: 1923046 HomoloGene: 41779 GeneCards: CDYL2

Пов'язані генетичні захворювання

рак молочної залози^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• каталітична активність • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • methylated histone binding • GO:0001106 transcription corepressor activity
Клітинна компонента	• клітинне ядро
Біологічний процес	• обмін речовин • negative regulation of nucleic acid-templated transcription
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


124359


75796

Ensembl


ENSG00000166446


ENSMUSG00000031758

UniProt


Q8N8U2


Q9D5D8

RefSeq (мРНК)


NM_152342


NM_029441

RefSeq (білок)


NP_689555


NP_083717

Локус (UCSC)

Хр. 16: 80.6 – 80.8 Mb

Хр. 8: 117.3 – 117.46 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CDYL2 (англ. Chromodomain Y like 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 506 амінокислот, а молекулярна маса — 56 500^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASGDLYEVE	RIVDKRKNKK	GKWEYLIRWK	GYGSTEDTWE	PEHHLLHCEE
FIDEFNGLHM	SKDKRIKSGK	QSSTSKLLRD	SRGPSVEKLS	HRPSDPGKSK
GTSHKRKRIN	PPLAKPKKGY	SGKPSSGGDR	ATKTVSYRTT	PSGLQIMPLK
KSQNGMENGD	AGSEKDERHF	GNGSHQPGLD	LNDHVGEQDM	GECDVNHATL
AENGLGSALT	NGGLNLHSPV	KRKLEAEKDY	VFDKRLRYSV	RQNESNCRFR
DIVVRKEEGF	THILLSSQTS	DNNALTPEIM	KEVRRALCNA	ATDDSKLLLL
SAVGSVFCSG	LDYSYLIGRL	SSDRRKESTR	IAEAIRDFVK	AFIQFKKPIV
VAINGPALGL	GASILPLCDI	VWASEKAWFQ	TPYATIRLTP	AGCSSYTFPQ
ILGVALANEM	LFCGRKLTAQ	EACSRGLVSQ	VFWPTTFSQE	VMLRVKEMAS
CSAVVLEESK	CLVRSFLKSV	LEDVNEKECL	MLKQLWSSSK	GLDSLFSYLQ
DKIYEV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Локалізований у ядрі.

Література

Dorus S., Gilbert S.L., Forster M.L., Barndt R.J., Lahn B.T. (2003). The CDY-related gene family: coordinated evolution in copy number, expression profile and protein sequence. Hum. Mol. Genet. 12: 1643—1650. PMID 12837688 DOI:10.1093/hmg/ddg185
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з CDYL2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:23030 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q8N8U2 (англ.) . Архів оригіналу за 28 грудня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.