CHMP6

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2K3W, 3HTU

Ідентифікатори

Символи

CHMP6, VPS20, charged multivesicular body protein 6

Зовнішні ІД

OMIM: 610901 MGI: 3583942 HomoloGene: 11607 GeneCards: CHMP6

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein N-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0032403 protein-containing complex binding
Клітинна компонента	• ESCRT III complex • гіалоплазма • ендосома • мембрана • late endosome membrane • endosome membrane • екзосома • система ендомембран
Біологічний процес	• GO:0019067 viral life cycle • nucleus organization • regulation of exosomal secretion • multivesicular body assembly • ESCRT III complex assembly • endosomal transport • protein transport • septum digestion after cytokinesis • mitotic metaphase plate congression • vacuolar transport • macroautophagy • negative regulation of epidermal growth factor-activated receptor activity • GO:0015915 транспорт • GO:1903362 regulation of protein catabolic process • midbody abscission
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


79643


208092

Ensembl


ENSG00000176108


ENSMUSG00000025371

UniProt


Q96FZ7


P0C0A3

RefSeq (мРНК)


NM_024591


NM_001085498

RefSeq (білок)


NP_078867


NP_001078967

Локус (UCSC)

Хр. 17: 80.99 – 81.01 Mb

Хр. 11: 119.8 – 119.81 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CHMP6 (англ. Charged multivesicular body protein 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 201 амінокислот, а молекулярна маса — 23 485^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGNLFGRKKQ	SRVTEQDKAI	LQLKQQRDKL	RQYQKRIAQQ	LERERALARQ
LLRDGRKERA	KLLLKKKRYQ	EQLLDRTENQ	ISSLEAMVQS	IEFTQIEMKV
MEGLQFGNEC	LNKMHQVMSI	EEVERILDET	QEAVEYQRQI	DELLAGSFTQ
EDEDAILEEL	SAITQEQIEL	PEVPSEPLPE	KIPENVPVKA	RPRQAELVAA
S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків. Локалізований у мембрані, ендосомах.

Література

Peck J.W., Bowden E.T., Burbelo P.D. (2004). Structure and function of human Vps20 and Snf7 proteins. Biochem. J. 377: 693—700. PMID 14583093 DOI:10.1042/BJ20031347
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Martin-Serrano J., Yarovoy A., Perez-Caballero D., Bieniasz P.D. (2003). Divergent retroviral late-budding domains recruit vacuolar protein sorting factors by using alternative adaptor proteins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 12414—12419. PMID 14519844 DOI:10.1073/pnas.2133846100
Shim S., Kimpler L.A., Hanson P.I. (2007). Structure/function analysis of four core ESCRT-III proteins reveals common regulatory role for extreme C-terminal domain. Traffic. 8: 1068—1079. PMID 17547705 DOI:10.1111/j.1600-0854.2007.00584.x
Kuang Z., Seo E.J., Leis J. (2011). Mechanism of inhibition of retrovirus release from cells by interferon-induced gene ISG15. J. Virol. 85: 7153—7161. PMID 21543490 DOI:10.1128/JVI.02610-10
Martin-Serrano J., Yarovoy A., Perez-Caballero D., Bieniasz P.D. (2003). Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 152845—152845. {{cite journal}}: Пропущений або порожній |title= (довідка)

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25675 (англ.) . Архів оригіналу за 20 травня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q96FZ7 (англ.) . Архів оригіналу за 3 жовтня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.