CIRBP |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/9/9e/Protein_CIRBP_PDB_1x5s.png/250px-Protein_CIRBP_PDB_1x5s.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | CIRBP, CIRP, cold inducible RNA binding protein |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 602649 MGI: 893588 HomoloGene: 980 GeneCards: CIRBP |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • translation repressor activity • nucleic acid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • small ribosomal subunit rRNA binding • mRNA 3'-UTR binding • RNA binding • poly(U) RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • cytoplasmic stress granule • ядерце • клітинне ядро • нуклеоплазма • spliceosomal complex • Рибонуклеопротеїни |
---|
Біологічний процес | • stress granule assembly • response to cold • mRNA stabilization • response to UV • positive regulation of translation • negative regulation of translation • positive regulation of mRNA splicing, via spliceosome |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/fc/PBB_GE_CIRBP_200810_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_CIRBP_200810_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/9/91/PBB_GE_CIRBP_200811_at_fs.png/250px-PBB_GE_CIRBP_200811_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001280 NM_001300815 NM_001300829 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001271 NP_001287744 NP_001287758 NP_001271.1 |
| NP_031731 NP_001366350 NP_001366351 NP_001366352 NP_001366353
| NP_001366354 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 19: 1.26 – 1.27 Mb | Хр. 10: 80.17 – 80.17 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CIRBP (англ. Cold inducible RNA binding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 172 амінокислот, а молекулярна маса — 18 648[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MASDEGKLFV | | GGLSFDTNEQ | | SLEQVFSKYG | | QISEVVVVKD | | RETQRSRGFG |
FVTFENIDDA | | KDAMMAMNGK | | SVDGRQIRVD | | QAGKSSDNRS | | RGYRGGSAGG |
RGFFRGGRGR | | GRGFSRGGGD | | RGYGGNRFES | | RSGGYGGSRD | | YYSSRSQSGG |
YSDRSSGGSY | | RDSYDSYATH | | NE |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як відповідь на стрес, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Yang C., Carrier F. (2001). The UV-inducible RNA-binding protein A18 (A18 hnRNP) plays a protective role in the genotoxic stress response. J. Biol. Chem. 276: 47277—47284. PMID 11574538 DOI:10.1074/jbc.M105396200
- Yang R., Weber D.J., Carrier F. (2006). Post-transcriptional regulation of thioredoxin by the stress inducible heterogeneous ribonucleoprotein A18. Nucleic Acids Res. 34: 1224—1236. PMID 16513844 DOI:10.1093/nar/gkj519
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1982 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q14011 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |