CLDN6 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

CLDN6

Ідентифікатори

Символи

CLDN6, claudin 6

Зовнішні ІД

OMIM: 615798 MGI: 1859284 HomoloGene: 10300 GeneCards: CLDN6

Онтологія гена
Молекулярна функція	• structural molecule activity • identical protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • virus receptor activity
Клітинна компонента	• bicellular tight junction • міжклітинні контакти • мембрана • apicolateral plasma membrane • integral component of membrane • клітинна мембрана
Біологічний процес	• cell-cell junction organization • GO:0022415 viral process • calcium-independent cell-cell adhesion via plasma membrane cell-adhesion molecules • viral entry into host cell
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9074


54419

Ensembl


ENSG00000184697


ENSMUSG00000023906

UniProt


P56747


Q9Z262

RefSeq (мРНК)


NM_021195


NM_018777

RefSeq (білок)


NP_067018


NP_061247

Локус (UCSC)

Хр. 16: 3.01 – 3.02 Mb

Хр. 17: 23.9 – 23.9 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CLDN6 (англ. Claudin 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 220 амінокислот, а молекулярна маса — 23 292^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASAGMQILG	VVLTLLGWVN	GLVSCALPMW	KVTAFIGNSI	VVAQVVWEGL
WMSCVVQSTG	QMQCKVYDSL	LALPQDLQAA	RALCVIALLV	ALFGLLVYLA
GAKCTTCVEE	KDSKARLVLT	SGIVFVISGV	LTLIPVCWTA	HAIIRDFYNP
LVAEAQKREL	GASLYLGWAA	SGLLLLGGGL	LCCTCPSGGS	QGPSHYMARY
STSAPAISRG	PSEYPTKNYV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як взаємодія хазяїн-вірус. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, щільних контактах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2048 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, P56747 (англ.) . Архів оригіналу за 14 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.