CLDN9 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

CLDN9

Ідентифікатори

Символи

CLDN9, claudin 9, DFNB116

Зовнішні ІД

OMIM: 615799 MGI: 1913100 HomoloGene: 10656 GeneCards: CLDN9

Онтологія гена
Молекулярна функція	• structural molecule activity • identical protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • virus receptor activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • мембрана • bicellular tight junction • міжклітинні контакти • внутрішньоклітинна мембранна органела • клітинна мембрана
Біологічний процес	• calcium-independent cell-cell adhesion via plasma membrane cell-adhesion molecules • GO:0022415 viral process • cell-cell junction organization • viral entry into host cell • tight junction organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9080


56863

Ensembl


ENSG00000213937


ENSMUSG00000066720

UniProt


O95484


Q9Z0S7

RefSeq (мРНК)


NM_020982


NM_020293

RefSeq (білок)


NP_066192


NP_064689

Локус (UCSC)

Хр. 16: 3.01 – 3.01 Mb

Хр. 17: 23.9 – 23.9 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CLDN9 (англ. Claudin 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 217 амінокислот, а молекулярна маса — 22 848^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASTGLELLG	MTLAVLGWLG	TLVSCALPLW	KVTAFIGNSI	VVAQVVWEGL
WMSCVVQSTG	QMQCKVYDSL	LALPQDLQAA	RALCVIALLL	ALLGLLVAIT
GAQCTTCVED	EGAKARIVLT	AGVILLLAGI	LVLIPVCWTA	HAIIQDFYNP
LVAEALKREL	GASLYLGWAA	AALLMLGGGL	LCCTCPPPQV	ERPRGPRLGY
SIPSRSGASG	LDKRDYV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів. Задіяний у такому біологічному процесі, як взаємодія хазяїн-вірус. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, щільних контактах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2051 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, O95484 (англ.) . Архів оригіналу за 31 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.