CNOT3

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4C0D, 4C0G, 5FU6, 5FU7

Ідентифікатори

Символи

CNOT3, LENG2, NOT3, NOT3H, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, IDDSADF

Зовнішні ІД

OMIM: 604910 MGI: 2385261 HomoloGene: 133900 GeneCards: CNOT3

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • CCR4-NOT complex • гіалоплазма • P-body • клітинне ядро • CCR4-NOT core complex
Біологічний процес	• nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening • multicellular organism development • Сайленсинг генів • negative regulation of translation • regulation of stem cell population maintenance • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • trophectodermal cell differentiation • regulation of translation • transcription, DNA-templated • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay • positive regulation of cold-induced thermogenesis
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


4849


232791

Ensembl

ENSG00000088038 ENSG00000277600 ENSG00000277114 ENSG00000274616 ENSG00000275979
ENSG00000277615 ENSG00000276082 ENSG00000274176 ENSG00000274941 ENSG00000273943


ENSMUSG00000035632

UniProt


O75175


Q8K0V4

RefSeq (мРНК)


NM_014516


NM_146176

RefSeq (білок)


NP_055331


NP_666288

Локус (UCSC)

Хр. 19: 54.14 – 54.16 Mb

Хр. 7: 3.65 – 3.66 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CNOT3 (англ. CCR4-NOT transcription complex subunit 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 753 амінокислот, а молекулярна маса — 81 872^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MADKRKLQGE	IDRCLKKVSE	GVEQFEDIWQ	KLHNAANANQ	KEKYEADLKK
EIKKLQRLRD	QIKTWVASNE	IKDKRQLIDN	RKLIETQMER	FKVVERETKT
KAYSKEGLGL	AQKVDPAQKE	KEEVGQWLTN	TIDTLNMQVD	QFESEVESLS
VQTRKKKGDK	DKQDRIEGLK	RHIEKHRYHV	RMLETILRML	DNDSILVDAI
RKIKDDVEYY	VDSSQDPDFE	ENEFLYDDLD	LEDIPQALVA	TSPPSHSHME
DEIFNQSSST	PTSTTSSSPI	PPSPANCTTE	NSEDDKKRGR	STDSEVSQSP
AKNGSKPVHS	NQHPQSPAVP	PTYPSGPPPA	ASALSTTPGN	NGVPAPAAPP
SALGPKASPA	PSHNSGTPAP	YAQAVAPPAP	SGPSTTQPRP	PSVQPSGGGG
GGSGGGGSSS	SSNSSAGGGA	GKQNGATSYS	SVVADSPAEV	ALSSSGGNNA
SSQALGPPSG	PHNPPPSTSK	EPSAAAPTGA	GGVAPGSGNN	SGGPSLLVPL
PVNPPSSPTP	SFSDAKAAGA	LLNGPPQFST	APEIKAPEPL	SSLKSMAERA
AISSGIEDPV	PTLHLTERDI	ILSSTSAPPA	SAQPPLQLSE	VNIPLSLGVC
PLGPVPLTKE	QLYQQAMEEA	AWHHMPHPSD	SERIRQYLPR	NPCPTPPYHH
QMPPPHSDTV	EFYQRLSTET	LFFIFYYLEG	TKAQYLAAKA	LKKQSWRFHT
KYMMWFQRHE	EPKTITDEFE	QGTYIYFDYE	KWGQRKKEGF	TFEYRYLEDR
DLQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, транскрипція, регуляція транскрипції, РНК-залежне заглушення генів, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Aoki T., Okada N., Wakamatsu T., Tamura T.-A. (2002). TBP-interacting protein 120B, which is induced in relation to myogenesis, binds to NOT3. Biochem. Biophys. Res. Commun. 296: 1097—1103. PMID 12207886 DOI:10.1016/S0006-291X(02)02031-4
Zwartjes C.G., Jayne S., van den Berg D.L., Timmers H.T. (2004). Repression of promoter activity by CNOT2, a subunit of the transcription regulatory Ccr4-not complex. J. Biol. Chem. 279: 10848—10854. PMID 14707134 DOI:10.1074/jbc.M311747200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7879 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, O75175 (англ.) . Архів оригіналу за 23 серпня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.