CNTNAP4

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4NXQ

Ідентифікатори

Символи

CNTNAP4, CASPR4, contactin associated protein like 4, contactin associated protein family member 4

Зовнішні ІД

OMIM: 610518 MGI: 2183572 HomoloGene: 24912 GeneCards: CNTNAP4

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • міжклітинні контакти • клітинна мембрана • дендрит (нейробіологія) • синапс • presynaptic membrane • мембрана • GABA-ergic synapse • integral component of presynaptic membrane
Біологічний процес	• regulation of synaptic transmission, dopaminergic • regulation of grooming behavior • адгезія клітин • regulation of synaptic transmission, GABAergic • GO:1904739 regulation of synapse organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


85445


170571

Ensembl


ENSG00000152910


ENSMUSG00000031772

UniProt


Q9C0A0


Q99P47

RefSeq (мРНК)

NM_033401 NM_138994 NM_001322178 NM_001322179 NM_001322180
NM_001322181 NM_001322187 NM_001322188 NM_001322189 NM_001322190 NM_001322191


NM_130457

RefSeq (білок)

NP_001309107 NP_001309108 NP_001309109 NP_001309110 NP_001309116
NP_001309117 NP_001309118 NP_001309119 NP_001309120 NP_207837 NP_620481


NP_569724

Локус (UCSC)

Хр. 16: 76.28 – 76.56 Mb

Хр. 8: 113.3 – 113.61 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CNTNAP4 (англ. Contactin associated protein like 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 308 амінокислот, а молекулярна маса — 145 274^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGSVTGAVLK	TLLLLSTQNW	NRVEAGNSYD	CDDPLVSALP	QASFSSSSEL
SSSHGPGFAR	LNRRDGAGGW	SPLVSNKYQW	LQIDLGERME	VTAVATQGGY
GSSNWVTSYL	LMFSDSGWNW	KQYRQEDSIW	GFSGNANADS	VVYYRLQPSI
KARFLRFIPL	EWNPKGRIGM	RIEVFGCAYR	SEVVDLDGKS	SLLYRFDQKS
LSPIKDIISL	KFKTMQSDGI	LLHREGPNGD	HITLQLRRAR	LFLLINSGEA
KLPSTSTLVN	LTLGSLLDDQ	HWHSVLIQRL	GKQVNFTVDE	HRHHFHARGE
FNLMNLDYEI	SFGGIPAPGK	SVSFPHRNFH	GCLENLYYNG	VDIIDLAKQQ
KPQIIAMGNV	SFSCSQPQSM	PVTFLSSRSY	LALPDFSGEE	EVSATFQFRT
WNKAGLLLFS	ELQLISGGIL	LFLSDGKLKS	NLYQPGKLPS	DITAGVELND
GQWHSVSLSA	KKNHLSVAVD	GQMASAAPLL	GPEQIYSGGT	YYFGGCPDKS
FGSKCKSPLG	GFQGCMRLIS	ISGKVVDLIS	VQQGSLGNFS	DLQIDSCGIS
DRCLPNYCEH	GGECSQSWST	FHCNCTNTGY	RGATCHNSIY	EQSCEAYKHR
GNTSGFYYID	SDGSGPLEPF	LLYCNMTETA	WTIIQHNGSD	LTRVRNTNPE
NPYAGFFEYV	ASMEQLQATI	NRAEHCEQEF	TYYCKKSRLV	NKQDGTPLSW
WVGRTNETQT	YWGGSSPDLQ	KCTCGLEGNC	IDSQYYCNCD	ADRNEWTNDT
GLLAYKEHLP	VTKIVITDTG	RLHSEAAYKL	GPLLCQGDRS	FWNSASFDTE
ASYLHFPTFH	GELSADVSFF	FKTTASSGVF	LENLGIADFI	RIELRSPTVV
TFSFDVGNGP	FEISVQSPTH	FNDNQWHHVR	VERNMKEASL	QVDQLTPKTQ
PAPADGHVLL	QLNSQLFVGG	TATRQRGFLG	CIRSLQLNGM	TLDLEERAQV
TPEVQPGCRG	HCSSYGKLCR	NGGKCRERPI	GFFCDCTFSA	YTGPFCSNEI
SAYFGSGSSV	IYNFQENYLL	SKNSSSHAAS	FHGDMKLSRE	MIKFSFRTTR
TPSLLLFVSS	FYKEYLSVII	AKNGSLQIRY	KLNKYQEPDV	VNFDFKNMAD
GQLHHIMINR	EEGVVFIEID	DNRRRQVHLS	SGTEFSAVKS	LVLGRILEHS
DVDQDTALAG	AQGFTGCLSA	VQLSHVAPLK	AALHPSHPDP	VTVTGHVTES
SCMAQPGTDA	TSRERTHSFA	DHSGTIDDRE	PLANAIKSDS	AVIGGLIAVV
IFILLCITAI	AVRIYQQKRL	YKRSEAKRSE	NVDSAEAVLK	SELNIQNAVN
ENQKEYFF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

Liu X., Shepherd T.R., Murray A.M., Xu Z., Fuentes E.J. (2013). The structure of the Tiam1 PDZ domain/ phospho-syndecan1 complex reveals a ligand conformation that modulates protein dynamics. Structure. 21: 342—354. PMID 23395182 DOI:10.1016/j.str.2013.01.004

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18747 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9C0A0 (англ.) . Архів оригіналу за 30 березня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.