COTL1 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

COTL1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1T2L, 1T3X, 1T3Y, 1TMW, 1VFQ, 1WNJ

Ідентифікатори

Символи

COTL1, CLP, coactosin like F-actin binding protein 1

Зовнішні ІД

OMIM: 606748 MGI: 1919292 HomoloGene: 10898 GeneCards: COTL1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• enzyme binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • actin binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • екзосома • цитоскелет • внутрішньоклітинний • клітинне ядро • extracellular region • secretory granule lumen • ficolin-1-rich granule lumen
Біологічний процес	• defense response to fungus • neutrophil degranulation • GO:0022610 життєдіяльність
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23406


72042

Ensembl


ENSG00000103187


ENSMUSG00000031827

UniProt


Q14019


Q9CQI6

RefSeq (мРНК)


NM_021149


NM_028071

RefSeq (білок)


NP_066972


NP_082347

Локус (UCSC)

Хр. 16: 84.57 – 84.62 Mb

Хр. 8: 120.54 – 120.57 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

COTL1 (англ. Coactosin like F-actin binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 142 амінокислот, а молекулярна маса — 15 945^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATKIDKEAC	RAAYNLVRDD	GSAVIWVTFK	YDGSTIVPGE	QGAEYQHFIQ
QCTDDVRLFA	FVRFTTGDAM	SKRSKFALIT	WIGENVSGLQ	RAKTGTDKTL
VKEVVQNFAK	EFVISDRKEL	EEDFIKSELK	KAGGANYDAQ	TE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до шаперонів. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18304 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q14019 (англ.) . Архів оригіналу за 28 жовтня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.