CTSB

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3PBH, 1CSB, 1GMY, 1HUC, 1PBH, 2IPP, 2PBH, 3AI8, 3CBJ, 3CBK, 3K9M

Ідентифікатори

Символи

CTSB, APPS, CPSB, cathepsin B, RECEUP

Зовнішні ІД

OMIM: 116810 MGI: 88561 HomoloGene: 37550 GeneCards: CTSB

Онтологія гена
Молекулярна функція	• cysteine-type peptidase activity • collagen binding • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cysteine-type endopeptidase activity • hydrolase activity • proteoglycan binding • serine-type endopeptidase activity • endopeptidase activity
Клітинна компонента	• внутрішньоклітинна мембранна органела • Меланосома • внутрішньоклітинний • extracellular region • endolysosome lumen • ядерце • мітохондрія • лізосома • екзосома • perinuclear region of cytoplasm • міжклітинний простір • ficolin-1-rich granule lumen • collagen-containing extracellular matrix
Біологічний процес	• regulation of apoptotic process • epithelial cell differentiation • протеоліз • toll-like receptor signaling pathway • decidualization • cellular response to thyroid hormone stimulus • collagen catabolic process • viral entry into host cell • GO:0048552 regulation of catalytic activity • proteolysis involved in cellular protein catabolic process • neutrophil degranulation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1508


13030

Ensembl


ENSG00000164733 ENSG00000285132


ENSMUSG00000021939

UniProt


P07858


P10605

RefSeq (мРНК)

NM_001908 NM_147780 NM_147781 NM_147782 NM_147783
NM_001317237


NM_007798

RefSeq (білок)

NP_001304166 NP_001899 NP_680090 NP_680091 NP_680092
NP_680093


NP_031824

Локус (UCSC)

Хр. 8: 11.84 – 11.87 Mb

Хр. 14: 63.36 – 63.38 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CTSB (англ. Cathepsin B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 339 амінокислот, а молекулярна маса — 37 822^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MWQLWASLCC	LLVLANARSR	PSFHPLSDEL	VNYVNKRNTT	WQAGHNFYNV
DMSYLKRLCG	TFLGGPKPPQ	RVMFTEDLKL	PASFDAREQW	PQCPTIKEIR
DQGSCGSCWA	FGAVEAISDR	ICIHTNAHVS	VEVSAEDLLT	CCGSMCGDGC
NGGYPAEAWN	FWTRKGLVSG	GLYESHVGCR	PYSIPPCEHH	VNGSRPPCTG
EGDTPKCSKI	CEPGYSPTYK	QDKHYGYNSY	SVSNSEKDIM	AEIYKNGPVE
GAFSVYSDFL	LYKSGVYQHV	TGEMMGGHAI	RILGWGVENG	TPYWLVANSW
NTDWGDNGFF	KILRGQDHCG	IESEVVAGIP	RTDQYWEKI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Локалізований у лізосомі. Також секретований назовні.

Література

Chan S.J., San Segundo B., McCormick M.B., Steiner D.F. (1986). Nucleotide and predicted amino acid sequences of cloned human and mouse preprocathepsin B cDNAs. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 83: 7721—7725. PMID 3463996 DOI:10.1073/pnas.83.20.7721
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Ritonja A., Popovic T., Turk V., Wiedenmann K., Machleidt W. (1985). Amino acid sequence of human liver cathepsin B. FEBS Lett. 181: 169—172. PMID 3972105 DOI:10.1016/0014-5793(85)81136-4
Fong D., Calhoun D.H., Hsieh W.-T., Lee B., Wells R.D. (1986). Isolation of a cDNA clone for the human lysosomal proteinase cathepsin B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 83: 2909—2913. PMID 3010323 DOI:10.1073/pnas.83.9.2909
Turk D., Podobnik M., Kuhelj R., Dolinar M., Turk V. (1996). Crystal structures of human procathepsin B at 3.2- and 3.3-A resolution reveal an interaction motif between a papain-like cysteine protease and its propeptide. FEBS Lett. 384: 211—214. PMID 8617355 DOI:10.1016/0014-5793(96)00309-2
Podobnik M., Kuhelj R., Turk V., Turk D. (1997). Crystal structure of the wild-type human procathepsin B at 2.5-A resolution reveals the native active site of a papain-like cysteine protease zymogen. J. Mol. Biol. 271: 774—788. PMID 9299326 DOI:10.1006/jmbi.1997.1218

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2527 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, P07858 (англ.) . Архів оригіналу за 7 жовтня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.