CX3CL1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1B2T, 1F2L, 3ONA, 4XT1, 4XT3 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | CX3CL1, ABCD-3, C3Xkine, CXC3, CXC3C, NTN, NTT, SCYD1, fractalkine, neurotactin, C-X3-C motif chemokine ligand 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 601880 MGI: 1097153 HomoloGene: 2251 GeneCards: CX3CL1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • cytokine activity • chemokine activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • CCR chemokine receptor binding • signaling receptor binding • integrin binding • CX3C chemokine receptor binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • extracellular region • cell surface • міжклітинний простір |
---|
Біологічний процес | • G protein-coupled receptor signaling pathway • defense response • positive regulation of inflammatory response • monocyte chemotaxis • cytokine-mediated signaling pathway • chemokine-mediated signaling pathway • angiogenesis involved in wound healing • cellular response to tumor necrosis factor • Загоєння ран • leukocyte chemotaxis • neutrophil chemotaxis • positive regulation of angiogenesis • positive regulation of transforming growth factor beta1 production • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • адгезія клітин • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • cellular response to interleukin-1 • leukocyte adhesive activation • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • cellular response to interferon-gamma • cell chemotaxis • lymphocyte chemotaxis • negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand • positive regulation of calcium-independent cell-cell adhesion • хемотаксис • integrin activation • negative regulation of cell migration • leukocyte migration involved in inflammatory response • macrophage chemotaxis • regulation of signaling receptor activity |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 16: 57.37 – 57.39 Mb | Хр. 8: 95.5 – 95.51 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CX3CL1 (англ. C-X3-C motif chemokine ligand 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 397 амінокислот, а молекулярна маса — 42 203[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAPISLSWLL | | RLATFCHLTV | | LLAGQHHGVT | | KCNITCSKMT | | SKIPVALLIH |
YQQNQASCGK | | RAIILETRQH | | RLFCADPKEQ | | WVKDAMQHLD | | RQAAALTRNG |
GTFEKQIGEV | | KPRTTPAAGG | | MDESVVLEPE | | ATGESSSLEP | | TPSSQEAQRA |
LGTSPELPTG | | VTGSSGTRLP | | PTPKAQDGGP | | VGTELFRVPP | | VSTAATWQSS |
APHQPGPSLW | | AEAKTSEAPS | | TQDPSTQAST | | ASSPAPEENA | | PSEGQRVWGQ |
GQSPRPENSL | | EREEMGPVPA | | HTDAFQDWGP | | GSMAHVSVVP | | VSSEGTPSRE |
PVASGSWTPK | | AEEPIHATMD | | PQRLGVLITP | | VPDAQAATRR | | QAVGLLAFLG |
LLFCLGVAMF | | TYQSLQGCPR | | KMAGEMAEGL | | RYIPRSCGSN | | SYVLVPV |
Кодований геном білок за функцією належить до цитокінів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, хемотаксис. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Halim A., Nilsson J., Ruetschi U., Hesse C., Larson G. (2011). Human urinary glycoproteomics; attachment site specific analysis of N-and O-linked glycosylations by CID and ECD. Mol. Cell. Proteomics: —. PMID 22171320 DOI:10.1074/mcp.M111.013649
- Fujita M., Takada Y.K., Takada Y. (2012). Integrins alphavbeta3 and alpha4beta1 act as coreceptors for fractalkine, and the integrin-binding defective mutant of fractalkine is an antagonist of CX3CR1. J. Immunol. 189: 5809—5819. PMID 23125415 DOI:10.4049/jimmunol.1200889
- Fujita M., Takada Y.K., Takada Y. (2014). The chemokine fractalkine can activate integrins without CX3CR1 through direct binding to a ligand-binding site distinct from the classical RGD-binding site. PLoS ONE. 9: E96372—E96372. PMID 24789099 DOI:10.1371/journal.pone.0096372
- Mizoue L.S., Bazan J.F., Johnson E.C., Handel T.M. (1999). Solution structure and dynamics of the CX3C chemokine domain of fractalkine and its interaction with an N-terminal fragment of CX3CR1. Biochemistry. 38: 1402—1414. PMID 9931005 DOI:10.1021/bi9820614
- Hoover D.M., Mizoue L.S., Handel T.M., Lubkowski J. (2000). The crystal structure of the chemokine domain of fractalkine shows a novel quaternary arrangement. J. Biol. Chem. 275: 23187—23193. PMID 10770945 DOI:10.1074/jbc.M002584200
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10647 (англ.) . Архів оригіналу за 24 березня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P78423 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |