CXXC1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3QMB, 3QMC, 3QMD, 3QMG, 3QMH, 3QMI

Ідентифікатори

Символи

CXXC1, 2410002I16Rik, 5830420C16Rik, CFP1, CGBP, HsT2645, PCCX1, PHF18, SPP1, ZCGPC1, hCGBP, CXXC finger protein 1

Зовнішні ІД

OMIM: 609150 MGI: 1921572 HomoloGene: 32221 GeneCards: CXXC1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • histone methyltransferase activity (H3-K4 specific) • зв'язування з іоном металу • unmethylated CpG binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• nuclear matrix • nuclear speck • клітинне ядро • нуклеоплазма • histone methyltransferase complex • гіалоплазма • Set1C/COMPASS complex
Біологічний процес	• GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • IRE1-mediated unfolded protein response • histone H3-K4 methylation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


30827


74322

Ensembl


ENSG00000154832


ENSMUSG00000024560

UniProt


Q9P0U4


Q9CWW7

RefSeq (мРНК)


NM_001101654 NM_014593


NM_028868 NM_001378844

RefSeq (білок)


NP_001095124 NP_055408


NP_083144 NP_001365773

Локус (UCSC)

Хр. 18: 50.28 – 50.29 Mb

Хр. 18: 74.35 – 74.35 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CXXC1 (англ. CXXC finger protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 656 амінокислот, а молекулярна маса — 75 712^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEGDGSDPEP	PDAGEDSKSE	NGENAPIYCI	CRKPDINCFM	IGCDNCNEWF
HGDCIRITEK	MAKAIREWYC	RECREKDPKL	EIRYRHKKSR	ERDGNERDSS
EPRDEGGGRK	RPVPDPDLQR	RAGSGTGVGA	MLARGSASPH	KSSPQPLVAT
PSQHHQQQQQ	QIKRSARMCG	ECEACRRTED	CGHCDFCRDM	KKFGGPNKIR
QKCRLRQCQL	RARESYKYFP	SSLSPVTPSE	SLPRPRRPLP	TQQQPQPSQK
LGRIREDEGA	VASSTVKEPP	EATATPEPLS	DEDLPLDPDL	YQDFCAGAFD
DHGLPWMSDT	EESPFLDPAL	RKRAVKVKHV	KRREKKSEKK	KEERYKRHRQ
KQKHKDKWKH	PERADAKDPA	SLPQCLGPGC	VRPAQPSSKY	CSDDCGMKLA
ANRIYEILPQ	RIQQWQQSPC	IAEEHGKKLL	ERIRREQQSA	RTRLQEMERR
FHELEAIILR	AKQQAVREDE	ESNEGDSDDT	DLQIFCVSCG	HPINPRVALR
HMERCYAKYE	SQTSFGSMYP	TRIEGATRLF	CDVYNPQSKT	YCKRLQVLCP
EHSRDPKVPA	DEVCGCPLVR	DVFELTGDFC	RLPKRQCNRH	YCWEKLRRAE
VDLERVRVWY	KLDELFEQER	NVRTAMTNRA	GLLALMLHQT	IQHDPLTTDL
RSSADR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Voo K.S., Carlone D.L., Jacobsen B.M., Flodin A., Skalnik D.G. (2000). Cloning of a mammalian transcriptional activator that binds unmethylated CpG motifs and shares a CXXC domain with DNA methyltransferase, human trithorax, and methyl-CpG binding domain protein 1. Mol. Cell. Biol. 20: 2108—2121. PMID 10688657 DOI:10.1128/MCB.20.6.2108-2121.2000
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Lee J.-H., Voo K.S., Skalnik D.G. (2001). Identification and characterization of the DNA binding domain of CpG-binding protein. J. Biol. Chem. 276: 44669—44676. PMID 11572867 DOI:10.1074/jbc.M107179200
Lee J.-H., Skalnik D.G. (2002). CpG-binding protein is a nuclear matrix- and euchromatin-associated protein localized to nuclear speckles containing human trithorax. Identification of nuclear matrix targeting signals. J. Biol. Chem. 277: 42259—42267. PMID 12200428 DOI:10.1074/jbc.M205054200
Lee J.-H., Skalnik D.G. (2005). CpG-binding protein (CXXC finger protein 1) is a component of the mammalian Set1 histone H3-Lys4 methyltransferase complex, the analogue of the yeast Set1/COMPASS complex. J. Biol. Chem. 280: 41725—41731. PMID 16253997 DOI:10.1074/jbc.M508312200
Lee J.-H., Tate C.M., You J.-S., Skalnik D.G. (2007). Identification and characterization of the human Set1B histone H3-Lys4 methyltransferase complex. J. Biol. Chem. 282: 13419—13428. PMID 17355966 DOI:10.1074/jbc.M609809200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24343 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9P0U4 (англ.) . Архів оригіналу за 16 жовтня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.