CYTH2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1PBV, 1R8M, 1R8Q, 1R8S, 1S9D, 4JMI, 4JMO, 4JWL, 4JXH, 4L5M, 4Z21

Ідентифікатори

Символи

CYTH2, ARNO, CTS18, CTS18.1, PSCD2, PSCD2L, SEC7L, Sec7p-L, Sec7p-like, cytohesin 2, cytohesin-2

Зовнішні ІД

OMIM: 602488 MGI: 1334255 HomoloGene: 32116 GeneCards: CYTH2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• inositol 1,4,5 trisphosphate binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • guanyl-nucleotide exchange factor activity • lipid binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • growth cone • клітинна мембрана • cell projection • мембрана • Golgi membrane • гіалоплазма • Адгезивні контакти • bicellular tight junction • міжклітинні контакти
Біологічний процес	• regulation of ARF protein signal transduction • ендоцитоз • actin cytoskeleton organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9266


19158

Ensembl


ENSG00000105443


ENSMUSG00000003269

UniProt


Q99418


P63034

RefSeq (мРНК)


NM_004228 NM_017457


NM_001112701 NM_011181

RefSeq (білок)


NP_004219 NP_059431


NP_001106171 NP_035311

Локус (UCSC)

Хр. 19: 48.47 – 48.48 Mb

Хр. 7: 45.46 – 45.46 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CYTH2 (англ. Cytohesin 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 400 амінокислот, а молекулярна маса — 46 546^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEDGVYEPPD	LTPEERMELE	NIRRRKQELL	VEIQRLREEL	SEAMSEVEGL
EANEGSKTLQ	RNRKMAMGRK	KFNMDPKKGI	QFLVENELLQ	NTPEEIARFL
YKGEGLNKTA	IGDYLGEREE	LNLAVLHAFV	DLHEFTDLNL	VQALRQFLWS
FRLPGEAQKI	DRMMEAFAQR	YCLCNPGVFQ	STDTCYVLSF	AVIMLNTSLH
NPNVRDKPGL	ERFVAMNRGI	NEGGDLPEEL	LRNLYDSIRN	EPFKIPEDDG
NDLTHTFFNP	DREGWLLKLG	GGRVKTWKRR	WFILTDNCLY	YFEYTTDKEP
RGIIPLENLS	IREVDDPRKP	NCFELYIPNN	KGQLIKACKT	EADGRVVEGN
HMVYRISAPT	QEEKDEWIKS	IQAAVSVDPF	YEMLAARKKR	ISVKKKQEQP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних відростках.

Література

Frank S.F., Upender S.K., Hansen S.H., Casanova J.E. (1998). ARNO is a guanine nucleotide exchange factor for ADP-ribosylation factor 6. J. Biol. Chem. 273: 23—27. PMID 9417041 DOI:10.1074/jbc.273.1.23
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Bouschet T., Martin S., Kanamarlapudi V., Mundell S., Henley J.M. (2007). The calcium-sensing receptor changes cell shape via a beta-arrestin-1 ARNO ARF6 ELMO protein network. J. Cell Sci. 120: 2489—2497. PMID 17623778 DOI:10.1242/jcs.03469
Hofmann I., Thompson A., Sanderson C.M., Munro S. (2007). The Arl4 family of small G proteins can recruit the cytohesin Arf6 exchange factors to the plasma membrane. Curr. Biol. 17: 711—716. PMID 17398095 DOI:10.1016/j.cub.2007.03.007
Mossessova E., Gulbis J.M., Goldberg J. (1998). Structure of the guanine nucleotide exchange factor Sec7 domain of human ARNO and analysis of the interaction with ARF GTPase. Cell. 92: 415—423. PMID 9476900 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80933-2
Renault L., Guibert B., Cherfils J. (2003). Structural snapshots of the mechanism and inhibition of a guanine nucleotide exchange factor. Nature. 426: 525—530. PMID 14654833 DOI:10.1038/nature02197

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9502 (англ.) . Архів оригіналу за 2 квітня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q99418 (англ.) . Архів оригіналу за 24 грудня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.