DDX19B

Наявні структури

Пошук для людей: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3EWS, 3FHC, 3FHT, 3FMO, 3FMP, 3G0H

Ідентифікатори

Символи

DDX19B, DBP5, DDX19, RNAh, DEAD-box helicase 19B

Зовнішні ІД

OMIM: 605812 MGI: 2148251 HomoloGene: 56032 GeneCards: DDX19B

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • ATP binding • GO:0008026 helicase activity • RNA binding • nucleic acid binding
Клітинна компонента	• nuclear envelope • ядерна пора • ядерна мембрана • екзосома • мембрана • клітинне ядро • catalytic step 2 spliceosome • ядерце • цитоплазма
Біологічний процес	• protein transport • mRNA transport • RNA secondary structure unwinding • mRNA export from nucleus • Сплайсинг РНК • регуляція експресії генів • GO:0015915 транспорт
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


11269


234733

Ensembl


ENSG00000157349


ENSMUSG00000033658

UniProt


Q9UMR2


н/д

RefSeq (мРНК)

NM_001014449 NM_001014451 NM_001257172 NM_001257173 NM_001257174
NM_001257175 NM_007242 NM_001363938


NM_001190786 NM_001190800 NM_172284

RefSeq (білок)

NP_001014449 NP_001014451 NP_001244101 NP_001244102 NP_001244103
NP_001244104 NP_009173 NP_001350867


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 16: 70.29 – 70.34 Mb

Хр. 8: 111.73 – 111.76 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

DDX19B (англ. DEAD-box helicase 19B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 479 амінокислот, а молекулярна маса — 53 927^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATDSWALAV	DEQEAAAESL	SNLHLKEEKI	KPDTNGAVVK	TNANAEKTDE
EEKEDRAAQS	LLNKLIRSNL	VDNTNQVEVL	QRDPNSPLYS	VKSFEELRLK
PQLLQGVYAM	GFNRPSKIQE	NALPLMLAEP	PQNLIAQSQS	GTGKTAAFVL
AMLSQVEPAN	KYPQCLCLSP	TYELALQTGK	VIEQMGKFYP	ELKLAYAVRG
NKLERGQKIS	EQIVIGTPGT	VLDWCSKLKF	IDPKKIKVFV	LDEADVMIAT
QGHQDQSIRI	QRMLPRNCQM	LLFSATFEDS	VWKFAQKVVP	DPNVIKLKRE
EETLDTIKQY	YVLCSSRDEK	FQALCNLYGA	ITIAQAMIFC	HTRKTASWLA
AELSKEGHQV	ALLSGEMMVE	QRAAVIERFR	EGKEKVLVTT	NVCARGIDVE
QVSVVINFDL	PVDKDGNPDN	ETYLHRIGRT	GRFGKRGLAV	NMVDSKHSMN
ILNRIQEHFN	KKIERLDTDD	LDEIEKIAN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, транспорт мРНК, транслокація, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані, комплексі ядерної пори.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
von Moeller H., Basquin C., Conti E. (2009). The mRNA export protein DBP5 binds RNA and the cytoplasmic nucleoporin NUP214 in a mutually exclusive manner. Nat. Struct. Mol. Biol. 16: 247—254. PMID 19219046 DOI:10.1038/nsmb.1561

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2742 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9UMR2 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.