DDX19B |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/e/ef/Protein_DDX19B_PDB_3EWS.png/250px-Protein_DDX19B_PDB_3EWS.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук для людей: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 3EWS, 3FHC, 3FHT, 3FMO, 3FMP, 3G0H | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | DDX19B, DBP5, DDX19, RNAh, DEAD-box helicase 19B |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605812 MGI: 2148251 HomoloGene: 56032 GeneCards: DDX19B |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nucleotide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • ATP binding • GO:0008026 helicase activity • RNA binding • nucleic acid binding |
---|
Клітинна компонента | • nuclear envelope • ядерна пора • ядерна мембрана • екзосома • мембрана • клітинне ядро • catalytic step 2 spliceosome • ядерце • цитоплазма |
---|
Біологічний процес | • protein transport • mRNA transport • RNA secondary structure unwinding • mRNA export from nucleus • Сплайсинг РНК • регуляція експресії генів • GO:0015915 транспорт |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/bf/PBB_GE_DDX19B_202576_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_DDX19B_202576_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001014449 NM_001014451 NM_001257172 NM_001257173 NM_001257174
| NM_001257175 NM_007242 NM_001363938 |
| | NM_001190786 NM_001190800 NM_172284 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_001014449 NP_001014451 NP_001244101 NP_001244102 NP_001244103
| NP_001244104 NP_009173 NP_001350867 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 16: 70.29 – 70.34 Mb | Хр. 8: 111.73 – 111.76 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
DDX19B (англ. DEAD-box helicase 19B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 479 амінокислот, а молекулярна маса — 53 927[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MATDSWALAV | | DEQEAAAESL | | SNLHLKEEKI | | KPDTNGAVVK | | TNANAEKTDE |
EEKEDRAAQS | | LLNKLIRSNL | | VDNTNQVEVL | | QRDPNSPLYS | | VKSFEELRLK |
PQLLQGVYAM | | GFNRPSKIQE | | NALPLMLAEP | | PQNLIAQSQS | | GTGKTAAFVL |
AMLSQVEPAN | | KYPQCLCLSP | | TYELALQTGK | | VIEQMGKFYP | | ELKLAYAVRG |
NKLERGQKIS | | EQIVIGTPGT | | VLDWCSKLKF | | IDPKKIKVFV | | LDEADVMIAT |
QGHQDQSIRI | | QRMLPRNCQM | | LLFSATFEDS | | VWKFAQKVVP | | DPNVIKLKRE |
EETLDTIKQY | | YVLCSSRDEK | | FQALCNLYGA | | ITIAQAMIFC | | HTRKTASWLA |
AELSKEGHQV | | ALLSGEMMVE | | QRAAVIERFR | | EGKEKVLVTT | | NVCARGIDVE |
QVSVVINFDL | | PVDKDGNPDN | | ETYLHRIGRT | | GRFGKRGLAV | | NMVDSKHSMN |
ILNRIQEHFN | | KKIERLDTDD | | LDEIEKIAN |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, транспорт мРНК, транслокація, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані, комплексі ядерної пори.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- von Moeller H., Basquin C., Conti E. (2009). The mRNA export protein DBP5 binds RNA and the cytoplasmic nucleoporin NUP214 in a mutually exclusive manner. Nat. Struct. Mol. Biol. 16: 247—254. PMID 19219046 DOI:10.1038/nsmb.1561
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2742 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9UMR2 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |