DIDO1 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/5d/Protein_DIDO1_PDB_1wem.png/250px-Protein_DIDO1_PDB_1wem.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2M3H, 4L7X | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | DIDO1, BYE1, C20orf158, DATF-1, DATF1, DIDO2, DIDO3, DIO-1, DIO1, dJ885L7.8, death inducer-obliterator 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 604140 MGI: 1344352 HomoloGene: 34139 GeneCards: DIDO1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • зв'язування з іоном металу • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • веретено поділу • цитоскелет • клітинне ядро |
---|
Біологічний процес | • apoptotic signaling pathway • transcription, DNA-templated • GO:0097285 апоптоз |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/2/2a/PBB_GE_DIDO1_218325_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_DIDO1_218325_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001193369 NM_001193370 NM_022105 NM_033081 NM_080796
| NM_080797 NM_152302 |
| | NM_001291432 NM_001291433 NM_011805 NM_175551 NM_177852 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_001180298 NP_001180299 NP_071388 NP_149072 NP_542986
| NP_542987 |
| | NP_001278361 NP_001278362 NP_035935 NP_780760 NP_808520 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 20: 62.88 – 62.94 Mb | Хр. 2: 180.3 – 180.35 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
DIDO1 (англ. Death inducer-obliterator 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 240 амінокислот, а молекулярна маса — 243 873[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDDKGDPSNE | | EAPKAIKPTS | | KEFRKTWGFR | | RTTIAKREGA | | GDAEADPLEP |
PPPQQQLGLS | | LRRSGRQPKR | | TERVEQFLTI | | ARRRGRRSMP | | VSLEDSGEPT |
SCPATDAETA | | SEGSVESASE | | TRSGPQSAST | | AVKERPASSE | | KVKGGDDHDD |
TSDSDSDGLT | | LKELQNRLRR | | KREQEPTERP | | LKGIQSRLRK | | KRREEGPAET |
VGSEASDTVE | | GVLPSKQEPE | | NDQGVVSQAG | | KDDRESKLEG | | KAAQDIKDEE |
PGDLGRPKPE | | CEGYDPNALY | | CICRQPHNNR | | FMICCDRCEE | | WFHGDCVGIS |
EARGRLLERN | | GEDYICPNCT | | ILQVQDETHS | | ETADQQEAKW | | RPGDADGTDC |
TSIGTIEQKS | | SEDQGIKGRI | | EKAANPSGKK | | KLKIFQPVIE | | APGASKCIGP |
GCCHVAQPDS | | VYCSNDCILK | | HAAATMKFLS | | SGKEQKPKPK | | EKMKMKPEKP |
SLPKCGAQAG | | IKISSVHKRP | | APEKKETTVK | | KAVVVPARSE | | ALGKEAACES |
STPSWASDHN | | YNAVKPEKTA | | APSPSLLYKS | | TKEDRRSEEK | | AAAMAASKKT |
APPGSAVGKQ | | PAPRNLVPKK | | SSFANVAAAT | | PAIKKPPSGF | | KGTIPKRPWL |
SATPSSGASA | | ARQAGPAPAA | | ATAASKKFPG | | SAALVGAVRK | | PVVPSVPMAS |
PAPGRLGAMS | | AAPSQPNSQI | | RQNIRRSLKE | | ILWKRVNDSD | | DLIMTENEVG |
KIALHIEKEM | | FNLFQVTDNR | | YKSKYRSIMF | | NLKDPKNQGL | | FHRVLREEIS |
LAKLVRLKPE | | ELVSKELSTW | | KERPARSVME | | SRTKLHNESK | | KTAPRQEAIP |
DLEDSPPVSD | | SEEQQESARA | | VPEKSTAPLL | | DVFSSMLKDT | | TSQHRAHLFD |
LNCKICTGQV | | PSAEDEPAPK | | KQKLSASVKK | | EDLKSKHDSS | | APDPAPDSAD |
EVMPEAVPEV | | ASEPGLESAS | | HPNVDRTYFP | | GPPGDGHPEP | | SPLEDLSPCP |
ASCGSGVVTT | | VTVSGRDPRT | | APSSSCTAVA | | SAASRPDSTH | | MVEARQDVPK |
PVLTSVMVPK | | SILAKPSSSP | | DPRYLSVPPS | | PNISTSESRS | | PPEGDTTLFL |
SRLSTIWKGF | | INMQSVAKFV | | TKAYPVSGCF | | DYLSEDLPDT | | IHIGGRIAPK |
TVWDYVGKLK | | SSVSKELCLI | | RFHPATEEEE | | VAYISLYSYF | | SSRGRFGVVA |
NNNRHVKDLY | | LIPLSAQDPV | | PSKLLPFEGP | | GLESPRPNII | | LGLVICQKIK |
RPANSGELDK | | MDEKRTRLQP | | EEADVPAYPK | | VATVPQSEKK | | PSKYPLCSAD |
AAVSTTPPGS | | PPPPPPLPEP | | PVLKVLSSLK | | PAAPSPATAA | | TTAAAASTAA |
SSTASSASKT | | ASPLEHILQT | | LFGKKKSFDP | | SAREPPGSTA | | GLPQEPKTTA |
EDGVPAPPLL | | DPIVQQFGQF | | SKDKALEEEE | | DDRPYDPEEE | | YDPERAFDTQ |
LVERGRRHEV | | ERAPEAAAAE | | REEVAYDPED | | ETILEEAKVT | | VDDLPNRMCA |
DVRRNSVERP | | AEPVAGAATP | | SLVEQQKMLE | | ELNKQIEEQK | | RQLEEQEEAL |
RQQRAAVGVS | | MAHFSVSDAL | | MSPPPKSSLP | | KAELFQQEQQ | | SADKPASLPP |
ASQASNHRDP | | RQARRLATET | | GEGEGEPLSR | | LSARGAQGAL | | PERDASRGGL |
VGQAPMPVPE | | EKEPASSPWA | | SGEKPPAGSE | | QDGWKAEPGE | | GTRPATVGDS |
SARPARRVLL | | PTPPCGALQP | | GFPLQHDGER | | DPFTCPGFAS | | QDKALGSAQY |
EDPRNLHSAG | | RSSSPAGETE | | GDREPQARPG | | EGTAPLPPPG | | QKVGGSQPPF |
QGQREPGPHA | | LGMSGLHGPN | | FPGPRGPAPP | | FPEENIASND | | GPRGPPPARF |
GAQKGPIPSL | | FSGQHGPPPY | | GDSRGPSPSY | | LGGPRGVAPS | | QFEERKDPHG |
EKREFQDAPY | | NEVTGAPAQF | | EGTEQAPFLG | | SRGGAPFQFG | | GQRRPLLSQL |
KGPRGGPPPS | | QFGGQRGPPP | | GHFVGPRGPH | | PSQFETARGP | | HPNQFEGPRG |
QAPNFMPGPR | | GIQPQQFEDQ | | RVHSPPRFTN | | QRAPAPLQFG | | GLRGSAPFSE |
KNEQTPSRFH | | FQGQAPQVMK | | PGPRPLLELP | | SHPPQHRKDR | | WEEAGPPSAL |
SSSAPGQGPE | | ADGQWASADF | | REGKGHEYRN | | QTFEGRQRER | | FDVGPKEKPL |
EEPDAQGRAS | | EDRRRERERG | | RNWSRERDWD | | RPREWDRHRD | | KDSSRDWDRN |
RERSANRDRE | | READRGKEWD | | RSRERSRNRE | | RERDRRRDRD | | RSRSRERDRD |
KARDRERGRD | | RKDRSKSKES | | ARDPKPEASR | | ASDAGTASQA |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2680 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9BTC0 (англ.) . Архів оригіналу за 23 жовтня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | - Стероїдні гормони
- Естроген-зв'язувальні
|
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|